[发明专利]一种用于检测猪圆环病毒2型和3型的试剂盒、引物对、探针及方法在审
申请号: | 201811088132.9 | 申请日: | 2018-09-18 |
公开(公告)号: | CN108998577A | 公开(公告)日: | 2018-12-14 |
发明(设计)人: | 杨德全;鞠厚斌;周锦萍;赵洪进;王建;葛菲菲;邓波;杨显超;李鑫;李凯航;葛杰 | 申请(专利权)人: | 上海市动物疫病预防控制中心 |
主分类号: | C12Q1/70 | 分类号: | C12Q1/70;C12Q1/686;C12N15/11 |
代理公司: | 上海弼兴律师事务所 31283 | 代理人: | 薛琦;朱水平 |
地址: | 201103 上*** | 国省代码: | 上海;31 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 探针 引物 引物探针混合液 核苷酸序列 试剂盒 检测 猪圆环病毒2型 扩增产物污染 产物检测 发明试剂 后续处理 扩增反应 探针杂交 假阳性 病毒 安全 | ||
1.一种用于检测PCV-2和PCV-3的试剂盒,其包括PCR反应体系,其特征在于,所述PCR反应体系包括引物探针混合液,所述引物探针混合液包括两引物对和两探针,所述引物对的核苷酸序列如SEQ ID NO.1、SEQ ID NO.2、SEQ ID NO.3和SEQ ID NO.4所示,所述探针的核苷酸序列如SEQ ID NO.5和SEQ ID NO.6所示。
2.如权利要求1所述的试剂盒,其特征在于,所述PCR反应体系中的引物的浓度分别为200~400nM,较佳地为200nM;所述探针的浓度为200~400nM,较佳地为400nM。
3.如权利要求1所述的试剂盒,其特征在于,所述PCR反应体系还包括PCR反应液和Taq酶,所述PCR反应液包括Mg2+、dNTP以及PCR反应缓冲液,所述Taq酶为热启动Taq酶;较佳地:
所述Mg2+的浓度为1~2.5mmol/L,更佳地为2.0mmol/L;
和/或,所述dNTP的浓度为0.1~0.25mmol/L,更佳地为0.2mmol/L;
和/或,所述PCR缓冲液为2×PCR缓冲液;
和/或,所述热启动Taq酶的用量为0.1~0.5U/反应。
4.如权利要求3所述的试剂盒,其特征在于,所述引物探针混合液由所述两引物对和所述两探针组成,所述两引物对中各引物的量为0.5μL、浓度为10μM,所述两探针中,各探针的量为0.5μL、浓度为10μM;所述PCR反应液由10μL 2×PCR缓冲液、2μL 25mM的MgCl2、1μL10mM的dNTP以及2μL DEPC-H2O组成,所述Taq酶为1μL 5U/μL的Taq酶。
5.如权利要求1~4任一项所述的试剂盒,其特征在于,所述试剂盒为实时荧光定量PCR试剂盒;和/或,
所述试剂盒还包括阳性对照和阴性对照,所述阳性对照为含有PCV-2和PCV-3目的基因序列的重组质粒,较佳地,所述阳性对照的浓度为3.1×106拷贝/μL;所述阴性对照为去离子水,较佳地为DEPC-H2O。
6.检测PCV-2和PCV-3的引物对,其特征在于,所述引物对的一对是序列如SEQ ID NO.1和SEQ ID NO.2所示的核酸,另一对是序列如SEQ ID NO.3和SEQ ID NO.4所示的核酸;较佳地,所述的检测通过实时荧光定量PCR进行。
7.检测PCV-2和PCV-3的探针,其特征在于,所述探针的核苷酸序列如SEQ ID NO.5和SEQ ID NO.6所示;较佳地,所述的检测通过实时荧光定量PCR进行。
8.检测PCV-2和PCV-3的组合,所述的组合包括引物对和探针,其特征在于,所述的引物对的一对是序列如SEQ ID NO.1和SEQ ID NO.2所示的核酸,另一对是序列如SEQ ID NO.3和SEQ ID NO.4所示的核酸;所述的探针的核苷酸序列如SEQ ID NO.5和SEQ ID NO.6所示;较佳地,所述的检测通过实时荧光定量PCR进行。
9.如权利要求6所述的引物对和/或如权利要求7所述的探针,或者权利要求8所述的组合在制备检测PCV-2和PCV-3的试剂盒中的应用;较佳地,所述试剂盒为双通道实时荧光定量PCR试剂盒。
10.一种非诊断目的的检测PCV-2和PCV-3的方法,其特征在于,其包括如下步骤:
(1)使用DNA提取试剂提取待检样品中的总DNA;
(2)以步骤(1)提取的总DNA为模板,利用权利要求1~5任一项所述试剂盒中的PCR反应体系进行PCR反应;
(3)分析检测结果;
较佳地:
步骤(1)中所述DNA提取试剂包括样品裂解液、氯仿、DEPC-乙醇、异丙醇和DEPC-H2O中的一种或多种;较佳地,所述样品裂解液为Trizol,所述DEPC-乙醇为质量百分数为75%的DEPC-乙醇;
和/或,步骤(2)中所述PCR反应的反应条件为:
(1)94~95℃10~15min;(2)94~95℃10~15s;(3)55~60℃35~60s;(2)-(3)循环40~45次。
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