[发明专利]一种高通量研究水稻转录因子的方法在审

专利信息
申请号: 201811090668.4 申请日: 2018-09-17
公开(公告)号: CN110904141A 公开(公告)日: 2020-03-24
发明(设计)人: 王树伟;肖云平;赵仕兰 申请(专利权)人: 上海欧易生物医学科技有限公司
主分类号: C12N15/81 分类号: C12N15/81;C12N15/29
代理公司: 暂无信息 代理人: 暂无信息
地址: 201110 上海市闵行*** 国省代码: 上海;31
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摘要:
搜索关键词: 一种 通量 研究 水稻 转录 因子 方法
【权利要求书】:

1.一种高通量研究水稻转录因子的方法,其特征在于,包括两部分:

(1)水稻转录因子库的构建;

(2)一对一mating筛选。

2.根据权利要求1所述的水稻转录因子库的构建,其特征在于,包括以下4个步骤:

(1)设计引物利用PCR扩增将1800个水稻转录因子从cDNA或T载体上扩增出来;

(2)将扩增出来的转录因子片段连接到表达载体上,然后转入大肠杆菌感受态细胞进行扩大培养,获得连接入水稻转录因子序列的质粒;

(3)将获得的质粒转入酵母感受态细胞中;

(4)鉴定验证阳性克隆,将正确的克隆转入深孔板扩大培养,每一个孔是一个水稻转录因子。

3.根据权利要求2所述的水稻转录因子库的构建,其特征在于,步骤(1)所设计的引物序列必须保证与所用载体序列同框表达,不局限于在起始密码子位置开始扩增。

4.根据权利要求2所述的水稻转录因子库的构建,其特征在于,步骤(1)引物设计时需增加同源重组序列或相应的酶切位点序列,PCR扩增所使用的模板包括质粒及水稻cDNA。

5.根据权利要求2所述的水稻转录因子库的构建,其特征在于,步骤(2)重组实验中使用线性化的酵母pGADT7载体。

6.根据权利要求2所述的水稻转录因子库的构建,其特征在于,步骤(3)经一代测序验证后带有正确的转录因子序列的载体质粒转入Y187的酵母感受态菌株中。

7.根据权利要求2所述的水稻转录因子库的构建,其特征在于,步骤(4)采用96孔深孔板培养酵母菌文库,用以实现高通量筛选的目的。

8.根据权利要求1所述的一对一mating筛选,其特征在于,包括以下步骤:

(1)将诱饵基因连入目的载体中,再将载体转入酵母感受态细胞中进行扩大培养,得到菌液;

(2)活化1800个转录因子酵母库,以及含有诱饵质粒的酵母菌,在96孔深孔板中等量混匀进行mating;

(3)培养过后用12连排枪将菌液点在筛选板上培养;

(4)培养3-4天,观察并记录实验结果。

9.根据权利要求8所述的一对一mating筛选,其特征在于,步骤(1)中使用pHisi-1酵母载体。

10.根据权利要求8所述的一对一mating筛选,其特征在于,步骤(1)使用的酵母感受态菌株是YM4271。

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