[发明专利]一种高通量研究水稻转录因子的方法在审
申请号: | 201811090668.4 | 申请日: | 2018-09-17 |
公开(公告)号: | CN110904141A | 公开(公告)日: | 2020-03-24 |
发明(设计)人: | 王树伟;肖云平;赵仕兰 | 申请(专利权)人: | 上海欧易生物医学科技有限公司 |
主分类号: | C12N15/81 | 分类号: | C12N15/81;C12N15/29 |
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地址: | 201110 上海市闵行*** | 国省代码: | 上海;31 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 通量 研究 水稻 转录 因子 方法 | ||
1.一种高通量研究水稻转录因子的方法,其特征在于,包括两部分:
(1)水稻转录因子库的构建;
(2)一对一mating筛选。
2.根据权利要求1所述的水稻转录因子库的构建,其特征在于,包括以下4个步骤:
(1)设计引物利用PCR扩增将1800个水稻转录因子从cDNA或T载体上扩增出来;
(2)将扩增出来的转录因子片段连接到表达载体上,然后转入大肠杆菌感受态细胞进行扩大培养,获得连接入水稻转录因子序列的质粒;
(3)将获得的质粒转入酵母感受态细胞中;
(4)鉴定验证阳性克隆,将正确的克隆转入深孔板扩大培养,每一个孔是一个水稻转录因子。
3.根据权利要求2所述的水稻转录因子库的构建,其特征在于,步骤(1)所设计的引物序列必须保证与所用载体序列同框表达,不局限于在起始密码子位置开始扩增。
4.根据权利要求2所述的水稻转录因子库的构建,其特征在于,步骤(1)引物设计时需增加同源重组序列或相应的酶切位点序列,PCR扩增所使用的模板包括质粒及水稻cDNA。
5.根据权利要求2所述的水稻转录因子库的构建,其特征在于,步骤(2)重组实验中使用线性化的酵母pGADT7载体。
6.根据权利要求2所述的水稻转录因子库的构建,其特征在于,步骤(3)经一代测序验证后带有正确的转录因子序列的载体质粒转入Y187的酵母感受态菌株中。
7.根据权利要求2所述的水稻转录因子库的构建,其特征在于,步骤(4)采用96孔深孔板培养酵母菌文库,用以实现高通量筛选的目的。
8.根据权利要求1所述的一对一mating筛选,其特征在于,包括以下步骤:
(1)将诱饵基因连入目的载体中,再将载体转入酵母感受态细胞中进行扩大培养,得到菌液;
(2)活化1800个转录因子酵母库,以及含有诱饵质粒的酵母菌,在96孔深孔板中等量混匀进行mating;
(3)培养过后用12连排枪将菌液点在筛选板上培养;
(4)培养3-4天,观察并记录实验结果。
9.根据权利要求8所述的一对一mating筛选,其特征在于,步骤(1)中使用pHisi-1酵母载体。
10.根据权利要求8所述的一对一mating筛选,其特征在于,步骤(1)使用的酵母感受态菌株是YM4271。
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