[发明专利]一种用于检测PEDV-TGEV核酸的双重荧光定量RT-PCR检测试剂盒在审
申请号: | 201811091219.1 | 申请日: | 2018-09-19 |
公开(公告)号: | CN109097499A | 公开(公告)日: | 2018-12-28 |
发明(设计)人: | 王晓杜;宋厚辉;吴瑗;周莹珊;邵春艳;章先;程昌勇;姜胜;孙静;周彬;宋泉江 | 申请(专利权)人: | 浙江农林大学 |
主分类号: | C12Q1/70 | 分类号: | C12Q1/70;C12Q1/6851;C12R1/93 |
代理公司: | 杭州中成专利事务所有限公司 33212 | 代理人: | 周世骏 |
地址: | 311304 浙江省*** | 国省代码: | 浙江;33 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 双重荧光 荧光定量 反转录 混合液 核酸 猪传染性胃肠炎病毒 猪流行性腹泻病毒 碱基随机引物 阳性对照质粒 定量RT-PCR 反转录引物 检测试剂 检验检疫 扩增引物 阳性对照 阴性对照 高通量 灵敏度 检测 探针 | ||
1.一种用于检测PEDV-TGEV核酸的双重荧光定量RT-PCR检测试剂盒,其特征在于,该试剂盒中包括:
(1)反转录和荧光定量RT-PCR扩增混合液:
该混合液包含反转录和荧光定量扩增引物以及探针,其序列如SEQ ID NO:1~6所示;其中,反转录引物为12碱基随机引物;
(2)阴性对照;
(3)阳性对照,包含猪流行性腹泻病毒和猪传染性胃肠炎病毒的阳性对照质粒。
2.根据权利要求1所述的试剂盒,其特征在于,所述序列SEQ ID NO:1-2是猪流行性腹泻病毒扩增引物;所述序列SEQ ID NO:4-5是猪传染性胃肠炎病毒扩增引物;所述序列SEQID NO:5是猪流行性腹泻病毒带荧光标记的探针;所述序列SEQ ID NO:6是猪传染性胃肠炎病毒带荧光标记的探针。
3.根据权利要求1所述的试剂盒,其特征在于,阳性对照来自病毒核酸RNA经反转录后,其特异基因片段与质粒连接所得的重组质粒混合物;其中特异基因分别为猪流行性腹泻病毒的N基因、猪传染性胃肠炎病毒的N基因;其中,猪流行性腹泻病毒的N基因序列如SEQ IDNO:7所示,猪传染性胃肠炎病毒的n基因序列如SEQ ID NO:8所示。
4.利用权利要求1所述试剂盒实现检测PEDV-TGEV的双重荧光定量RT-PCR检测方法,其特征在于,包括以下步骤:
(1)磁珠法提取样品DNA/RNA;
用磁珠DNA/RNA共提取试剂盒和全自动核酸提取仪同时提取样品中的RNA,得到200μL样品;
(2)双重荧光定量RT-PCR扩增
a)取预混冻干液,其中已按如下要求配制22μL反应体系:2.5μL RT-PCR 5×buffer,2.5μL dNTPs mix,0.5μL Reverse enzymes mix,2.5μL 5×Q-solution;5.2μL引物混合液,其中包括PEDV/TGEV的上下游引物各1.15μL,PEDV的探针0.2μL、TGEV的探针0.4μL;rTaq酶1μL、2.5μL 10×PCR buffer,5.3μL H2O补足,-20℃冻干,储存于2-8℃;
b)加入25μL灭菌H2O回溶冻干颗粒,加入3μL待检样品RNA或者阴性对照或阳性对照;
c)每次检测时设置2管阳性和两管阴性对照,检测管放入荧光定量PCR仪中;
反应条件:42℃30min;95℃15s,60℃1min,40个循环,60℃为荧光信号采集温度,荧光信号分别在FAM和HEX通道进行采集;
(3)结果描述及判定
a)质控标准:
PEDV和TGEV阳性对照Ct值分别都<32,且有典型扩增曲线;阴性对照无Ct值,且无典型扩增曲线;
如阴性对照和阳性条件不同时满足以上条件,此次试验视为无效;
b)结果判断:
扩增结果按下述方式进行判断:
阳性:在FAM通道Ct值小于38且有典型扩增曲线,表示样本中存在猪流行性腹泻病毒的核酸;在HEX通道Ct值小于38且有典型扩增曲线,表示样本中存在猪传染性胃肠炎病毒的核酸;
阴性:无特异性扩增条带或者无Ct值,表明样品中猪流行性腹泻病毒、猪传染性胃肠炎病毒。
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