[发明专利]自闭症生物标志物及其应用有效
申请号: | 201811120111.0 | 申请日: | 2018-09-25 |
公开(公告)号: | CN109182577B | 公开(公告)日: | 2022-03-15 |
发明(设计)人: | 王明帮;王艳;周家秀;何福生 | 申请(专利权)人: | 深圳市英马诺生物科技有限公司 |
主分类号: | C12Q1/6895 | 分类号: | C12Q1/6895;C12Q1/6869;C12N15/11 |
代理公司: | 深圳市六加知识产权代理有限公司 44372 | 代理人: | 曲卫涛 |
地址: | 518000 广东省深圳市罗*** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 自闭症 生物 标志 及其 应用 | ||
1.一种筛选易患自闭症的生物样品的系统,其特征在于,包括:
自闭症生物标志物检测装置,所述自闭症生物标志物检测装置用于分别检测待测生物样品和健康对照样品中的宏基因组测序数据,并确定两者的肠道菌群毒力因子基因的多态性;
其中,肠道菌群毒力因子基因的多态性是指样品中所含的肠道菌群毒力因子基因的种类多样性;多态性高是指样品中所含的肠道菌群毒力因子基因的种类多;
以及
分析装置,所述分析装置与所述自闭症生物标志物检测装置相连,用于从所述自闭症生物标志物检测装置接收所述待测生物样品和健康对照样品中的肠道菌群毒力因子基因的多态性确定结果,并基于所述多态性确定结果确定所述待测生物样品是否易患自闭症,其中,所述待测生物样品的肠道菌群毒力因子基因的多态性显著高于健康对照样品,是所述待测生物样品易患自闭症的指示,
其中,所述待测生物样品和健康对照样品均为粪便样品,分别来自待测个体和健康人;
其中,所述自闭症生物标志物检测装置包括:
粪便DNA提取单元;
宏基因组建库和测序单元;以及
多态性确定单元,
其中,所述多态性确定单元适于基于宏基因组测序数据分别确定所述待测生物样品和健康对照样品的肠道菌群毒力因子基因的多态性,
其中,所述宏基因组建库和测序单元适于实施鸟枪法宏基因组测序,
其中,采用Illumina HiSeq 2500测序平台作为所述宏基因组建库和测序单元,
其中,在所述多态性确定单元中,基于宏基因组测序数据分别确定所述待测生物样品和健康对照样品的肠道菌群毒力因子基因的多态性,进一步包括:将所述宏基因组测序数据比对到毒力因子基因数据库virulence factor database, http://www.mgc.ac.cn/VFs/main.htm,以便得到各样品的肠道菌群毒力因子基因的多态性。
2.根据权利要求1所述的系统,其特征在于,在所述分析装置中,基于所述多态性确定结果确定所述待测生物样品是否易患自闭症进一步包括:通过多维方差分析对所述待测生物样品和健康对照样品中的肠道菌群毒力因子基因的多态性进行显著差异分析,并对显著差异分析结果进行稀疏偏最小二乘判别分析,以便确定所述待测生物样品的肠道菌群毒力因子基因的多态性是否显著高于健康对照样品。
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