[发明专利]用于检测CYP2C9和VKORC1基因分型的引物组、试剂、试剂盒及检测方法和应用在审
申请号: | 201811121498.1 | 申请日: | 2018-09-27 |
公开(公告)号: | CN109055540A | 公开(公告)日: | 2018-12-21 |
发明(设计)人: | 李培峰;李保伟;王建勋;刘英;郝晓丹;吴薇 | 申请(专利权)人: | 青岛大学 |
主分类号: | C12Q1/6883 | 分类号: | C12Q1/6883;C12N15/11 |
代理公司: | 北京超凡志成知识产权代理事务所(普通合伙) 11371 | 代理人: | 舒畅 |
地址: | 266000 *** | 国省代码: | 山东;37 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 引物组 检测 准确度 临床检测 试剂盒 分型 位点 等位基因特异引物 基因工程技术 个体化用药 基因分型 技术开发 特异性强 特异引物 通用探针 下游引物 中间序列 华法林 检出率 研发 应用 基因 开发 | ||
1.一种用于检测CYP2C9和VKORC1基因分型的引物组,其特征在于,所述引物组包括CYP2C9共用下游引物、CYP2C9等位基因特异引物和CYP2C9中间序列特异引物;以及,VKORC1共用下游引物、VKORC1等位基因特异引物和VKORC1中间序列特异引物;
所述CYP2C9共用下游引物为CYP2C9-acR,具有如SEQ ID NO.1所示的核苷酸序列;
所述CYP2C9等位基因特异引物包括CYP2C9-aF和CYP2C9-cF,所述CYP2C9-aF具有如SEQID NO.2所示的核苷酸序列,所述CYP2C9-cF具有如SEQ ID NO.3所示的核苷酸序列;
所述CYP2C9中间序列特异引物为CYP2C9-mid,具有如SEQ ID NO.4所示的核苷酸序列;
所述VKORC1共用下游引物为VKORC1-ctR,具有如SEQ ID NO.5所示的核苷酸序列;
所述VKORC1等位基因特异引物包括VKORC1-cF和VKORC1-tF,所述VKORC1-cF具有如SEQID NO.6所示的核苷酸序列,所述VKORC1-tF具有如SEQ ID NO.7所示的核苷酸序列;
所述VKORC1中间序列特异引物为VKORC1-mid,具有如SEQ ID NO.8所示的核苷酸序列。
2.根据权利要求1所述的引物组,其特征在于,所述CYP2C9等位基因特异引物CYP2C9-aF和CYP2C9-cF,分别含有通用引物序列和与通用探针反向互补的序列;
优选地,所述CYP2C9-aF含有与FAM通用探针反向互补的序列,FAM信号代表A基因型,所述CYP2C9-cF含有与HEX通用探针反向互补的序列,HEX信号代表C基因型;
优选地,所述VKORC1等位基因特异引物VKORC1-cF和VKORC1-tF,分别含有通用引物序列和与通用探针反向互补的序列;
优选地,所述VKORC1-cF含有与FAM通用探针反向互补的序列,FAM信号代表C基因型,所述VKORC1-tF含有与HEX通用探针反向互补的序列,HEX信号代表T基因型。
3.一种用于检测CYP2C9和VKORC1基因分型的试剂,其特征在于,所述试剂包括权利要求1或2所述的引物组。
4.一种用于检测CYP2C9和VKORC1基因分型的试剂盒,其特征在于,所述试剂盒包括权利要求1或2所述的引物组或权利要求3所述的试剂。
5.根据权利要求4所述的试剂盒,其特征在于,所述试剂盒还包括2*PCR Mix、2*UP-qPCR Mix、Primer Mix、CYP2C9qPrimer Mix、VKORC1qPrimer Mix、ddH2O、CYP2C9阳性标准品和VKORC1阳性标准品。
6.根据权利要求5所述的试剂盒,其特征在于,所述Primer Mix包括CYP2C9-acR、CYP2C9-aF、CYP2C9-cF、VKORC1-ctR、VKORC1-cF与VKORC1-tF,溶剂为灭菌双蒸水;
优选地,所述CYP2C9-acR、CYP2C9-aF、CYP2C9-cF、VKORC1-ctR、VKORC1-cF与VKORC1-tF的浓度均为1-3μM;
优选地,所述CYP2C9qPrimer Mix包括CYP2C9-mid,溶剂为灭菌双蒸水;所述VKORC1qPrimer Mix包括VKORC1-mid,溶剂为灭菌双蒸水;
优选地,所述CYP2C9-mid与VKORC1-mid的浓度均为5-10μM。
7.一种CYP2C9和VKORC1基因分型的检测方法,其特征在于,应用权利要求1或2所述的引物组或权利要求3所述的试剂或权利要求4-6任一项所述的试剂盒。
8.根据权利要求7所述的检测方法,其特征在于,以待测样本的DNA为模板,利用所述引物组进行实时荧光定量PCR反应,根据检测到的荧光信号判定CYP2C9和VKORC1的基因型。
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