[发明专利]一种改进的重叠延伸PCR方法有效
申请号: | 201811128907.0 | 申请日: | 2018-09-27 |
公开(公告)号: | CN109402109B | 公开(公告)日: | 2022-05-24 |
发明(设计)人: | 戴忠敏;郭伟;谢冰花;朱晓静;邱猛生 | 申请(专利权)人: | 杭州师范大学 |
主分类号: | C12N15/10 | 分类号: | C12N15/10 |
代理公司: | 杭州天正专利事务所有限公司 33201 | 代理人: | 黄美娟;李世玉 |
地址: | 310036 浙江*** | 国省代码: | 浙江;33 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 改进 重叠 延伸 pcr 方法 | ||
1.一种改进的重叠延伸PCR方法,其特征在于克隆单个目的基因片段到载体时,以pCDH-CMV-MCS-EF1-copGFP质粒为模板,用引物P1和引物P2进行第一轮PCR扩增,获得copGFP-WPRE片段,copGFP-WPRE片段核苷酸序列如SEQ ID NO.2所示;再以copGFP-WPRE片段与慢病毒载体LCas9载体作为模板,利用引物P1和引物P3进行第二轮PCR扩增,获得Cas9-copGFP融合产物,LCas9载体核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示;所述引物P1的3’端与copGFP-WPRE片段有19bp的匹配序列,5’端与载体有19bp的匹配序列,P2的3’ 端与目的基因有14bp的匹配序列,5’ 端与载体有21bp的匹配序列;P3共25bp,全部与载体相互匹配,其中3’ 端与P1的5’ 端有19bp相匹配;
引物P1:GAGAAAGGTGGAGGCCAGCATGGAGAGCGACGAGAGCG;
引物P2:GTACCGGTACCGCGGCCGCGGAAGAGGCCGCAGAG;
引物P3:GCTGGCCTCCACCTTTCTCTTCTTC。
2.一种改进的重叠延伸PCR方法,其特征在于克隆两个目的基因片段到载体的同一位点时,以pKOD-Sso7d质粒为模板,以引物P1和引物P2进行第一轮PCR扩增,获得Sso7d DNA片段,pKOD-Sso7d质粒核苷酸序列如SEQ ID NO.3所示;以Rosetta(DE3)菌的基因组DNA为模板,以引物P3和引物P4进行第一轮PCR扩增,获得T7C565-883 DNA片段;将Sso7d DNA片段和T7C565-883 DNA片段与pLysS载体共同作为模板,利用引物P2和引物P3进行第二轮PCR扩增,获得Sso7d DNA片段和T7C565-883 DNA片段及载体pLysS的融合产物,pLysS载体核苷酸序列如SEQ ID NO.4所示;
引物P1:
GCTAACGCAGTCAGGCACCAAGGAGAGATCTATGGGCGGCCGCGCAACCGTAAAGTTCA;
引物P2:CCTCCAGATCCACCACCGGATCCCTTTTTCTGCTTCTCCAGCA;
引物P3:GGATCCGGTGGTGGATCTGGAGGTTCAGAAACCGTTCAGGACATCTACG;
引物P4:AATTCGACCCGGTCGTCGACTTACGCGAACGCGAAGTCCGA。
3.一种改进的重叠延伸PCR方法,其特征在于克隆两个目的基因片段到载体的不同位点时,以pCR2.1质粒为模板,以引物P1和引物P2进行第一轮PCR扩增,获得Neo DNA片段;以Rosetta(DE3)菌的基因组DNA为模板,P3加上T7NF和引物P4进行第一轮PCR扩增,获得T7N1-564 DNA片段;以Neo DNA片段和T7N1-564 DNA片段与pKOD-Sso7d载体共同作为模板,利用两对引物P1和P3’、 P3和P1’再进行第二轮PCR扩增,获得Neo DNA片段和T7N1-564 DNA片段融合到pKOD-Sso7d载体的不同位点;
引物P1:GTTAAACAAAATTATTTCTAGTCAGGTACCGAAGAACTCGTCAAGAAGG;
引物P2:
GATAACAATTCCCCTCTAGAAGAAGGAGATATACCATGGGATCGGCCATTGAAC;
引物P3:
GGCACGTAAGAGGTTCCAACTTTCACCATAATGAAACACCATGGGGTACTAGAGAAAG;
引物P4:
CAATGCCAGCGCTTCGTTAGTCGACGTATCCGCGGCCGCTTGAACCTCCAGATCCACCACTAGGAAGCAAGTTAAC;
引物P1’: CCTGACTAGAAATAATTTTGTTTAACTTTAAGAAGGAGATATACATATGATCC;
引物P3’:
GTTGGAACCTCTTACGTGCCGATCTCGATCCCGCGAAATTAATACGACTCACTATAG;
引物T7NF:
CCATGGGGTACTAGAGAAAGAGGAGAAAGATCTATGAACACGATTAACATCGCTAAG。
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