[发明专利]一种基于概率统计模型的生物学全同胞鉴定方法有效
申请号: | 201811223988.2 | 申请日: | 2018-10-19 |
公开(公告)号: | CN109273046B | 公开(公告)日: | 2022-04-22 |
发明(设计)人: | 赵书民;靳超;赵峰;赵琪 | 申请(专利权)人: | 江苏东南证据科学研究院有限公司 |
主分类号: | G16B5/00 | 分类号: | G16B5/00;G16B25/10 |
代理公司: | 上海申新律师事务所 31272 | 代理人: | 严罗一 |
地址: | 210018 江苏省南*** | 国省代码: | 江苏;32 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 基于 概率 统计 模型 生物学 同胞 鉴定 方法 | ||
1.一种基于概率统计模型的生物学全同胞鉴定方法,其特征在于,包括以下步骤:
S1:使用DNA提取试剂盒,分别提取两名被鉴定人的生物检材基因组DNA;
S2:进行PCR扩增,实施STR分型,以获得n个相互独立的STR基因座的分型结果;
S3:建立检验假设:
原假设H0:两名被鉴定人为无亲缘关系个体;
备择假设H1:两名被鉴定人为生物学全同胞;
S4:依据两名被鉴定人的STR基因座的基因型,比较并计算各STR基因座上存在的相同等位基因的个数,累计得到两名被鉴定人在全部STR基因座上存在的相同等位基因的总数,即IBS值;
S5:依据各STR基因座在人群中的等位基因频率,得到IBS在无亲缘关系个体对人群中符合二项分布IBS~B(2n,π0),IBS在全同胞对人群中符合二项分布IBS~B(2n,π1);
其中,以a2=1、a1=1、a0=1分别表示在任一STR基因座上存在2个相同的等位基因、仅存在1个相同的等位基因、无相同的等位基因的状态各自成立,a2、a1、a0分别为0时则表示上述各状态各自不成立;
设任一STR基因座有m个等位基因,并以fi表示该STR基因座上第i个等位基因的频率,其中i=1,2,3……m,则有:
以p2、p1、p0分别表示无亲缘关系个体对A与B之间a2、a1、a0取值为1的概率,则有:
p2+p1+p0=1
其中,
因此,在无亲缘关系个体对人群中的IBS的期望值E(IBS)为:
在无亲缘关系个体对人群中的IBS的总体率π0为:
以p2FS、p1FS分别表示全同胞对C与D之间a2、a1取值为1的概率,则有:
因此,在全同胞对人群中的IBS的期望值E(IBS)为:
在全同胞对人群中的IBS的总体率π1为:
S6:使用EXCEL软件中的BINOMDIST函数进行计算:
输入参数BINOMDIST(IBS值,2n,π0,FALSE)以计算出两名被鉴定人为无亲缘关系个体的概率pH0;
输入参数BINOMDIST(IBS值,2n,π1,FALSE)以计算出两名被鉴定人为全同胞的概率pH1;
S7:遗传学证据价值评估:
当pH1pH0时,计算pH1与pH0的比值R1,其意义为:两名被鉴定人为全同胞的概率是二者为无亲缘关系个体的概率的R1倍;当pH1pH0时,计算pH0与pH1的比值R0,其意义为:两名被鉴定人为无亲缘关系个体的概率是二者为全同胞的概率的R0倍;
当倾向于认定两名被鉴定人为无亲缘关系个体时,这一结论的犯错概率为pH1,其准确性=1-pH1;当倾向于认定两名被鉴定人为全同胞时,这一结论的犯错概率为pH0,其准确性=1-pH0。
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