[发明专利]用于检测肺癌的组合物及其用途在审
申请号: | 201811236651.5 | 申请日: | 2018-10-23 |
公开(公告)号: | CN111088351A | 公开(公告)日: | 2020-05-01 |
发明(设计)人: | 马竣;李永君;韩晓亮;王建铭 | 申请(专利权)人: | 博尔诚(北京)科技有限公司 |
主分类号: | C12Q1/6886 | 分类号: | C12Q1/6886 |
代理公司: | 北京彩和律师事务所 11688 | 代理人: | 闫桑田;刘磊 |
地址: | 100176 北京市大兴区北京*** | 国省代码: | 北京;11 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 用于 检测 肺癌 组合 及其 用途 | ||
1.一种用于体外检测肺癌的组合物,所述组合物包括:
用于检测目标基因甲基化状态的核酸,
其中,所述目标基因为MARCH11基因和CDO1基因中的一种或两种。
2.根据权利要求1所述的组合物,其中,所述MARCH11基因的靶序列如SEQ ID NO:1-4所示。
3.根据权利要求1所述的组合物,其中,所述CDO1基因的靶序列如SEQ ID NO:5-8所示。
4.根据权利要求1~3中任一项所述的组合物,其中,所述用于检测目标基因甲基化状态的核酸包括:
所述目标基因的靶序列中的至少9个核苷酸的片段,
所述片段包含至少一个CpG二核苷酸序列。
5.根据权利要求1~4中任一项所述的组合物,其中,所述用于检测目标基因甲基化状态的核酸包括:
在中等严紧或严紧条件下杂交于所述目标基因靶序列中的至少15个核苷酸的片段,
所述片段包含至少一个CpG二核苷酸序列。
6.根据权利要求1~5中任一项所述的组合物,其还包括:
将目标基因靶序列的5位未甲基化胞嘧啶碱基转化为尿嘧啶的试剂。
7.根据权利要求1~6中任一项所述的组合物,其中,所述用于检测目标基因甲基化状态的核酸还包括:
优先与处于非甲基化状态的靶序列结合的阻断剂。
8.根据权利要求7所述的组合物,其中,
所述至少9个核苷酸的片段引物,其为SEQ ID NO:9和SEQ ID NO:10的序列,或者其为SEQ ID NO:11和SEQ ID NO:12的序列,
所述至少15个核苷酸的片段探针,其为SEQ ID NO:13的序列或SEQ ID NO:14的序列,
阻断剂,其为SEQ ID NO:15的序列或SEQ ID NO:16的序列。
9.根据权利要求1~8中任一项所述的组合物在用于制备用于体外检测肺癌的试剂盒中的用途。
10.根据权利要求9所述的用途,其中,所述用于体外检测肺癌的试剂盒通过包括如下步骤的方法来检测肺癌:
分离待测生物样品中的包括目标基因靶序列或其片段的DNA样品;
确定所述目标基因靶序列的甲基化状态;以及
通过所述目标基因靶序列的甲基化状态的检测结果判断生物样品的状态,从而实现对肺癌的体外检测。
11.根据权利要求9所述的用途,其中,所述方法包括如下步骤:
提取待测生物样品的基因组DNA;
使用试剂处理提取的基因组DNA,使5位未甲基化的胞嘧啶碱基转化为尿嘧啶或其它碱基;
将试剂处理过的DNA样品与DNA聚合酶和目标基因靶序列的引物接触,并在优先与处于非甲基化状态的DNA靶序列结合的阻断剂的存在下进行DNA聚合反应;
用探针检测扩增产物;以及
基于所述扩增产物是否存在,确定所述目标基因靶序列的至少一个CpG二核苷酸的甲基化状态。
12.根据权利要求11所述的用途,其中,所述试剂为亚硫酸氢盐试剂。
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