[发明专利]包括SNP10-1的分子标记及其在湖羊辅助育种中的应用

说明书

本发明提供了与湖羊体重性状相关的多个SNP分子标记及其在湖羊分子标记辅助育种中的应用。本发明还提供了检测与湖羊体重性状相关的多个SNP的引物对、包含该引物对的试剂盒以及它们在湖羊分子标记辅助育种中的应用。本发明进一步提供了筛选湖羊体重性状的方法及其在湖羊分子标记辅助育种中的应用。本发明可用于湖羊肉用性状分子标记辅助育种以及湖羊肉用系核心群个体的早期选育。

技术领域

本发明属于分子标记领域，具体地涉及一种湖羊SNP分子标记、相关引物对、试剂盒，以及它们在湖羊分子标记辅助育种中的应用，进一步涉及一种筛选湖羊体重性状的方法及其在湖羊分子标记辅助育种中的应用。

背景技术

自20世纪中叶以来，我国绵羊遗传改良经历了地方品种的选优培育和提纯，杂交改良地方品种，再到新品种培育，生产方向也从“毛主肉辅”向“肉主毛辅”转变。目前国内畜牧养殖业中养羊业的发展速度仅次于家禽养殖^[1]。

我国虽然开展了多项肉用绵羊新品种的培育研究工作，并培育了巴美肉羊^[2]、昭乌达肉羊^[3]和察哈尔羊^[4]等具有自主知识产权的肉羊品种。但在育种工作中还是存在“重引进，轻选育”的现象^[1]。以湖羊、小尾寒羊为例，这两个品种是我国著名的多胎绵羊品种，但是这些品种毛用价值不高，产肉性能偏低，不能满足羊肉消费市场的需求。因此，进行遗传改良，提高养羊的生产效率是绵羊选育工作中亟待解决的问题，也是摆在广大动物遗传育种研究者面前的一项刻不容缓的任务。

在人类单倍体型图计划、多物种基因组信息的陆续公布，商业化中高密度SNP芯片的出现和基因数据分析方法的成熟的大背景下，基于全基因组范围内搜寻与动物重要经济性状相关联的遗传变异研究，为分子育种研究带来了新思路和新途径，而全基因组关联分析 (Genome-wide association study，GWAS)已成为复杂性状功能基因鉴定的分析方法和手段之一。人们已经在与绵、山羊经济性状上开展了很多GWAS的研究^[5-29]。Ovine SNP50BeadChip 芯片由Illumina公司与国际羊基因组协会专家联合开发，包含54241个SNP位点，平均每 46kb有一个标记，覆盖整个绵羊基因组。该芯片已经成为绵、山羊经济性状GWAS分析的重要工具，目前已有的研究结果大都使用该芯片获得。

GWAS在羊的相关性状基因的研究中主要分为两类：(1)无关个体基础上的联系。(2)家系基础上的联系剖析。病例-对照分析的方法主要用来分析病例组和对照组的全基因组中基因型的分布特点和差异性。随机群体基础上的分析法在动物的应用中主要用来分析数量性状。目前各国研究者已经对复杂疾病和经济性状开展了许多的GWAS研究分析，发现了许多与疾病或经济性状相关联的SNPs，已经证实的相关基因或位点就超过一千余个，而且近年来公开报道GWAS研究成果的数量呈逐年递增态势^[30]。

虽然GWAS分析在相关的研究中取得了优异的成绩和效果，也有学者对其持质疑的态度^[31]，有关研究和分析也在不断的修缮过程中^[32-34]。目前对于GWAS研究和分析我们还需要从多方面入手，将科研转化到实际中去。

随着生活水平的提高，人们对羊肉的消费需求也越来越多，国内一些地方肉用绵羊品种如湖羊、小尾寒羊等，因繁殖力强，肉质鲜美等优点深受消费者的喜爱，但与肉用品种相比，这些品种具有产肉量较低，生产周期长等，不能满足消费者的需求，湖羊为我国特有的宝贵绵羊品种，集繁殖力强，早期生长快，肉品质好等优点于一体，但也存在产肉性能不高，肉用体型不理想的缺陷。因此，进行湖羊肉用系选育，提高湖羊的生产性能，是湖羊选育工作中亟待解决的重要问题。

发明内容