[发明专利]一种人类斑秃相关基因突变筛查的组合引物及其应用

说明书

本发明公开了一种人类斑秃相关基因突变筛查的组合引物及其应用，涉及基因检测技术领域，所述组合引物包括针对人类斑秃在chr1、chr2、chr3、chr4、chr5、chr6、chr9、chr10、chr11、chr12、chr14、chr16、chr18、chr19染色体上相关基因的26个SNP位点的特异性引物，并将该组合引物应用于人类斑秃相关基因突变的筛查。本发明采用自主研发的试剂，其价格要远远低于进口试剂，使得检测成本也大大降低；并且进行一次本发明的方法至少可以检测30份样品，从而使其可以被广泛地用于斑秃相关基因的普查工作。

技术领域：

本发明涉及基因检测技术领域，具体涉及一种人类斑秃相关基因突变筛查的组合引物及其应用。

背景技术：

斑秃是一种常见的非瘢痕性脱发性疾病,常发生于身体有毛发的部位，以局限性圆形脱发为特征。斑秃虽然不是严重致命疾病，但是会严重影响患者的心理状态和生活质量。斑秃的具体发病机制尚不明确，可能是遗传、环境、心理因素等众多因素影响的产物。目前，斑秃普遍被认为是由T淋巴细胞介导的针对毛囊器官的自身免疫性疾病，精神心理因素可能会加重病情或至病情反复。

斑秃在人群中的发病率约为1％～2％，男女发病率并无明显差别，约66％的患者在30岁前发病，仅20％的患者在40岁以后发病，其中约50％的患者会在祛除诱因后的一年内自愈。对斑秃的提早发现，并采用针对性的治疗，可避免发展成为慢性反复性疾病。

斑秃是一种多因素遗传性疾病。中国流行病学调查显示，8.4％的患者存在家族内发病，并且与患者的越亲近发病率越高。单卵双生斑秃发病一致率高达55％。丝聚合蛋白基因变异的特应性皮炎患者，存在合并重度斑秃的倾向。

单核苷酸多态性(Single Nucleotide Polymorphisms，SNP)是指在基因组水平上由单个核苷酸的变异所引起的DNA序列多态性，是人类可遗传变异中最常见的一种。SNP在人类基因组中广泛存在，平均每500～1000个碱基对中就有1个，估计其总数可达300万。数量庞大的SNP位点与生命的多种进程都密切相关，尤其是在疾病的鉴定方面SNP起着重大的作用。目前已经发现ACOXL(rs12986962，rs3789129)，CLEC16A(rs3862469)，FAM19A2(rs4348998)，FPR2(rs17834679)，GSE1(rs7500151)，IL13(rs848)，intergenic(rs10761660，rs1171582，rs2216164，rs247459，rs2781388，rs574087，rs6848139，rs7682481，rs9275524，rs972099)，IRF4(rs6906608)，LOC101928337(rs12348691)，LPP(rs9864529)，MAGI3(rs17031716)，PFKFB3(rs631902)，PLXNC1(rs7299099)，RP11(rs2847266)，SYT14(rs170557)，TNFRSF1A(rs1860545)等斑秃相关基因的26个SNP位点。而目前针对这些基因位点多态性的研究主要是Sanger测序法，该方法只能针对某一个样本的某一段区域进行检测，检测效率低，成本高。

基于此，本发明提供了一种人类斑秃相关基因突变筛查的组合引物及其应用。

发明内容：

本发明所要解决的技术问题在于提供一种检测便捷、准确率高、经济实惠的斑秃相关突变基因位点的检测方法；通过多组基因引物对样品DNA进行实时定量PCR扩增，并通过各位点的熔解曲线与标准熔解曲线相比较获取其基因型，最终通过各SNP位点对斑秃的贡献系数计算出患病的比率。

本发明所要解决的技术问题采用以下的技术方案来实现：

本发明的一个技术方案如下：