[发明专利]一种与ENU诱变草鱼家系生长特性相关连的SNP标记及检测引物

权利要求书

1.一种草鱼SNP标记，所述草鱼SNP标记为草鱼mstn1基因465ntC/G、草鱼mstn1基因467nt G/A、草鱼mstn2基因909nt C/T和草鱼mstn2基因1024nt G/A中的任一种、任两种、任三种或四种。

2.如权利要求1所述的SNP标记，其特征在于：

所述mstn1基因的GenBank登录号为KM874826.1。

3.如权利要求1所述的SNP标记，其特征在于：

所述mstn2基因的GenBank登录号为KM874827.1。

4.一种用于发现或检测如权利要求1或2或3所述的SNP标记的方法，所述方法包括如下步骤：

(1)提取草鱼的基因组DNA。

(2)用PCR方法扩增所述草鱼的基因组DNA，其中，

针对所述草鱼mstn1基因465ntC/G，引物对(i)为：

第一方向引物：5’-CGGTGCGTGGTGAGGTT，如SEQ ID NO.1所示；

第二方向引物：5’-CGCTTGGATTTTCGGACTGA，如SEQ ID NO.2所示；

针对所述草鱼mstn1基因467nt G/A，引物对(ii)为：

第一方向引物：5’-TGTTGCTTTTTCTCCTTCAGTC，如SEQ ID NO.3所示；

第二方向引物：5’-CCCAAGTCCAGCCAGTA，如SEQ ID NO.4所示；

针对所述草鱼mstn2基因909nt C/T，引物对(iii)为：

第一方向引物：5’-AGTGCTGTTTGGAGAGAGTGCGTAT，如SEQ ID NO.5所示；

第二方向引物：5’-GGGTGACATCTTGGTGG，如SEQ ID NO.6所示；

针对所述草鱼mstn2基因1024nt G/A，引物对(iv)为：

第一方向引物：5’-ACTCCTGGCAGCACAT，如SEQ ID NO.7所示；

第二方向引物：5’-AGCCCGTCAAGTCATC，如SEQ ID NO.8所示；

(3)对PCR扩增产物进行DNA测序；

(4)对DNA测序结果分析。

5.如权利要求1-3中任一项所述的SNP标记或如权利要求4所述的方法在草鱼育种中的应用。

6.如权利要求1-3中任一项所述的SNP标记或如权利要求4所述的方法在草鱼生长状况预测、检测或监测中的应用。

7.如权利要求6所述的应用，所述草鱼生长状况选自：

草鱼的体重、全长、体长、体高、头长、尾柄长、尾柄高、体厚或其任意种的组合或任两种的比值。

8.一种用于检测或监测草鱼生长状况的PCR引物对，所述PCR引物对选自引物对(a)、引物对(b)、引物对(c)、引物对(d)中的任一种、任两种、任三种或四种。

其中，所述引物对(a)为：

第一方向引物：5’-CGGTGCGTGGTGAGGTT，如SEQ ID NO.1所示；

第二方向引物：5’-CGCTTGGATTTTCGGACTGA，如SEQ ID NO.2所示；

所述引物对(b)为：

第一方向引物：5’-TGTTGCTTTTTCTCCTTCAGTC，如SEQ ID NO.3所示；

第二方向引物：5’-CCCAAGTCCAGCCAGTA，如SEQ ID NO.4所示；

所述引物对(c)为：

第一方向引物：5’-AGTGCTGTTTGGAGAGAGTGCGTAT，如SEQ ID NO.5所示；

第二方向引物：5’-GGGTGACATCTTGGTGG，如SEQ ID NO.6所示；

所述引物对(d)为：

第一方向引物：5’-ACTCCTGGCAGCACAT，如SEQ ID NO.7所示；

第二方向引物：5’-AGCCCGTCAAGTCATC，如SEQ ID NO.8所示。