[发明专利]一种与ENU诱变草鱼家系生长特性相关连的SNP标记及检测引物

说明书

本发明公开了一种草鱼SNP标记，草鱼SNP标记为草鱼mstn1基因465ntC/G、草鱼mstn1基因467nt G/A、草鱼mstn2基因909nt C/T和草鱼mstn2基因1024nt G/A中的任一种、任两种、任三种或四种。mstn1基因的GenBank登录号为KM874826.1。mstn2基因的GenBank登录号为KM874827.1。本发明还公开了用于发现或检测该SNP的方法、引物组以及应用。该SNP标记能够用于检测或监测草鱼的体重、全长、体长、体高、头长、尾柄长、尾柄高、体厚或其任意种的组合或任两种的比值。

技术领域

本发明属于水产科学领域，涉及一种与ENU诱变草鱼家系生长特性相关连的SNP标记。

背景技术

ENU(N-乙基-N-亚硝基脲)是一种常用的化学诱变剂，它能对基因组DNA碱基产生烷基化修饰，进而引起DNA在复制时发生错配导致突变体生成^[1,2]。ENU主要诱发不定点的单碱基突变，没有任何的倾向性，从而使基因发生突变，其诱变模式与自然变异相似^[3,4]。同时，ENU诱变效率很高，是其他诱变手段的10倍左右。在模式生物中，利用ENU获得大规模突变体进行功能基因的研究已成为常用手段。但在养殖鱼类中的应用报道很少。目前，仅前苏联报道采用ENU诱变结合雌核发育技术获得了鲤优良突变品系^[5]。国内韩启霞等^[6]采用ENU浸泡的方法诱变银鲫得到突变个体。

草鱼(Ctenopharyngodonidellus)肌肉生长抑制素(Mstn)基因是一种肌细胞生长负向调控因子，具有抑制肌肉分化和生长的作用，其表达量与肌肉质量的变化呈负相关^[7,8]。目前，mstn基因在哺乳动物方面针对功能及调控机理进行大量的研究^[9-13]，在水产动物方面还处于cDNA克隆与表达，功能研究相对较少^[14-17]。在鱼类中mstn基因存在两种亚型(mstn1、mstn2)并且时空表达具有较大的差异，濮剑威等^[18]研究表明mstn1在草鱼肌肉、脑和眼中的转录量较高，mstn2只在脑和肌肉中有表达。并且通过注射mstn1型mRNA过表达可导致斑马鱼体节发生期胚胎的前-后轴拉长，背-腹轴变短，脊索轻微扭曲，以及体节发育受到强烈抑制而不分化等现象。注射mstn2型mRNA胚胎早期发育有所延迟并未发生明显变化，但发育至60h之后尾部明显发生严重弯曲。

单核苷酸多态性(SNP)是指在基因组水平上由于单个核苷酸的变异所引起的DNA序列多态性。SNP作为第三代分子遗传标记在分子育种方面已经得到广泛的应用^[19,20]。

参考文献:

[1]Mullins MC,Hammerschmidt M,Haffter P,etal.Largescale mutagenesisin the zebrafish：in searchof genescontrollingdevelopment in a vertebrate.CurrBiol,1994,4:189-202.

[2]VanEeden FJ,Granato M,Odenthal J,et al.Developmentalmutantscreensin the zebrafish. Meth Cel lBiol,1999,60:21-41.

[3]HitotsumachiS,Carpenter DA,Russell WL.Dose-repetitionincreasesthemutagenic effectivenessof N-ethyl-N-nitrosourea in mouse spermatogonia.ProcNatl Acad Sci USA, 1985,82:6619-6621.