[发明专利]检测EGFR基因T790M、C797S及L798I位点的特异性探针及试剂盒有效
申请号: | 201811292553.3 | 申请日: | 2018-11-01 |
公开(公告)号: | CN109182529B | 公开(公告)日: | 2021-09-14 |
发明(设计)人: | 陈月琴;钟英健;刘旭宏;王小波 | 申请(专利权)人: | 厦门基科生物科技有限公司 |
主分类号: | C12Q1/6886 | 分类号: | C12Q1/6886;C12Q1/6858;C12N15/11 |
代理公司: | 北京科亿知识产权代理事务所(普通合伙) 11350 | 代理人: | 汤东凤 |
地址: | 361000 福建省厦门市中国(福*** | 国省代码: | 福建;35 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 检测 egfr 基因 t790m c797s l798i 特异性 探针 试剂盒 | ||
1.检测EGFR基因的特异性探针,所述探针适用于EGFR基因T790M或C797S或L798I位点的基因突变检测,其特征在于:所述特异性探针为一核酸序列,沿其5′端至3′端的方向依序为非配对区、突变检测区、配对区;
所述非配对区的碱基序列与待测位点的特异性序列不配对,所述配对区的碱基序列与待测位点的特异性序列配对;所述突变检测区为一个核苷酸,该核苷酸的碱基种类与待测位点的突变位点突变前或突变后的碱基种类相配对;
所述非配对区沿所述方向的第一个核苷酸的碱基修饰有第一修饰基团;所述配对区沿所述方向的第一个核苷酸的碱基修饰有第二修饰基团;第一修饰基团和第二修饰基团为相互配合的荧光基团和淬灭基团;
其中,所述非配对区的长度为3-5个碱基对;所述配对区的长度为15-25个碱基对。
2.如权利要求1所述的特异性探针,其特征在于:所述突变检测区的核苷酸的碱基种类与待测位点的突变位点突变后的碱基种类相配对。
3.如权利要求2所述的特异性探针,其特征在于:所述特异性探针的3′端末位碱基修饰一C3 Spacer基团;
所述荧光基团采用以下所述基团中的一种,其包括但不限于:ALEXA350、FAM、HEX、TET、JOE、VIC、ROX、Texas Red、Cy5、Cy5.5、TAMRA;
所述淬灭基团采用以下所述基团中的一种,其包括但不限于:Dabcyl、BHQ、QYS-7。
4.如权利要求3所述的特异性探针,其特征在于:所述特异性探针为T790M-P,其用于T790M位点的基因突变检测;T790M-P的碱基序列为:5′-CAC-A-TGATGAGCTGCACGGTGGA-3′;
其中,所述非配对区的碱基序列为CAC,所述突变检测区的碱基序列为A,所述配对区的碱基序列为TGATGAGCTGCACGGTGGA。
5.如权利要求3所述的特异性探针,其特征在于:所述特异性探针为C797S-P,其用于C797S位点的基因突变检测;C797S-P的碱基序列为:5′-ATC-A-GCCGAAGGGCATGAGCTGCGT-3′;
其中,所述非配对区的碱基序列为ATC,所述突变检测区的碱基序列为A,所述配对区的碱基序列为GCCGAAGGGCATGAGCTGCGT。
6.如权利要求3所述的特异性探针,其特征在于:所述特异性探针为L798I-P,其用于L798I位点的基因突变检测;L798I-P的碱基序列为:5′-CAC-A-TCCTGGACTATGTCCGGGAACAC-3′;
其中,所述非配对区的碱基序列为CAC,所述突变检测区的碱基序列为A,所述配对区的碱基序列为TCCTGGACTATGTCCGGGAACAC。
7.检测EGFR基因的试剂盒,所述试剂盒适用于EGFR基因T790M或C797S或L798I位点的基因突变检测,其特征在于:所述试剂盒包含如权利要求4-6中任一一项所述的特异性探针。
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