[发明专利]一种检测淡色库蚊抗药性基因突变的引物、探针及方法在审
申请号: | 201811296149.3 | 申请日: | 2018-11-01 |
公开(公告)号: | CN109337989A | 公开(公告)日: | 2019-02-15 |
发明(设计)人: | 周冬根 | 申请(专利权)人: | 宁波国际旅行卫生保健中心 |
主分类号: | C12Q1/6888 | 分类号: | C12Q1/6888;C12Q1/6858;C12N15/11 |
代理公司: | 北京华仲龙腾专利代理事务所(普通合伙) 11548 | 代理人: | 董涛 |
地址: | 315012 浙*** | 国省代码: | 浙江;33 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 淡色库蚊 引物 抗药性基因 种检测 探针 突变 拟除虫菊酯类杀虫剂 等位基因类型 基因型频率 等位基因 抗性基因 种群遗传 抗药性 试剂盒 检测 抗性 灵敏 监测 预测 | ||
1.一种检测淡色库蚊抗药性基因突变的专用引物对,所述引物对由F和R组成,其特征在于,所述F具有序列表中SEQ ID №:1所示核苷酸序列,所述R具有序列表中SEQ ID №:2所示核苷酸序列。
2.一种检测淡色库蚊抗药性基因突变的探针,其特征在于,所述探针包括下述1)-6)中的至少一种:
1)探针P1具有序列表中SEQ ID №:3所示核苷酸序列;
2)探针P2具有序列表中SEQ ID №:4所示核苷酸序列;
3)探针P3具有序列表中SEQ ID №:5所示核苷酸序列;
4)探针P1为将具序列表中SEQ ID №:3所示核苷酸序列的核苷酸的3’末端增加MGB基团、5’端标记FAM发光基团后制备得到;
5)探针P2为将具序列表中SEQ ID №:4所示核苷酸序列的核苷酸的3’末端增加MGB基团、5’端标记FAM发光基团后制备得到;
6)探针P3为将具序列表中SEQ ID №:5所示核苷酸序列的核苷酸的3’末端增加MGB基团、5’端标记VIC发光基团后制备得到。
3.一种检测淡色库蚊抗药性基因突变的试剂盒,其特征在于,所述试剂盒包括权利要求1所述的专用引物对和/或权利要求2所述的至少一种探针。
4.根据权利要求3所述的试剂盒,其特征在于,所述试剂盒包括下述1)-3)中的至少一种:
1)试剂A,所述试剂A包括权利要求1所述的专用引物对、权利要求2的5)所述的探针P2和权利要求2的6)所述的探针P3;
2)试剂B,所述试剂B包括权利要求1所述的专用引物对、权利要求2的4)所述的探针P1和权利要求2的6)所述的探针P3;
3)TaqMan反应缓冲液。
5.一种检测或辅助检测淡色库蚊中kdr基因的突变位点的方法,其特征在于,所述方法包括使用权利要求1所述的专用引物对、权利要求2所述的至少一种探针和/或权利要求3或4所述的至少一种试剂盒进行检测。
6.根据权利要求5所述的方法,其特征在于,所述方法包括:
使用权利要求4所述的试剂A对待测淡色库蚊进行TaqMan PCR扩增反应,得到A反应产物;使用权利要求4所述的试剂B对待测淡色库蚊进行TaqMan PCR扩增反应,得到B反应产物;
检测A反应产物和B反应产物:
若A反应产物在FAM和VIC通道均无信号,且B反应产物仅在FAM通道有信号,则所述kdr基因不含或候选不含有所述突变位点,突变位点所在位置的碱基为TTG/TTG;
若A反应产物在FAM通道有信号且在VIC通道无信号,且B反应产物在FAM和VIC通道均无信号,则所述kdr基因突变位点为或候选为L1014C,突变位点所在位置的碱基为TGT/TGT;
若A反应产物在FAM通道无信号且在VIC通道有信号,且B反应产物仅在VIC通道有信号,则所述kdr基因的突变位点为或候选为L1014F,突变位点所在位置的碱基为TTT/TTT;
若A反应产物在FAM通道有信号且在VIC通道无信号,且B反应产物仅在FAM通道有信号,则所述kdr基因的突变位点为或候选为L1014C,突变位点所在位置的碱基为TTG/TGT;
若A反应产物在FAM通道无信号且在VIC通道有信号,且B反应产物在FAM通道和VIC通道均有信号,则所述kdr基因突变位点为或候选为L1014F,突变位点所在位置的碱基为TTG/TTT;
若A反应产物在FAM通道和VIC通道均有信号,且B反应产物仅在VIC通道有信号,则所述kdr基因突变位点为或候选为L1014F和L1014C;突变位点所在位置的碱基为TTT/TGT。
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