[发明专利]一种应用RPA技术检测杉并根结线虫的方法、RPA引物及试剂盒有效
申请号: | 201811300658.9 | 申请日: | 2018-11-02 |
公开(公告)号: | CN109486960B | 公开(公告)日: | 2021-11-16 |
发明(设计)人: | 方亦午;顾建锋;刘乐乐;陈先锋 | 申请(专利权)人: | 宁波检验检疫科学技术研究院 |
主分类号: | C12Q1/6888 | 分类号: | C12Q1/6888 |
代理公司: | 浙江千克知识产权代理有限公司 33246 | 代理人: | 冷红梅 |
地址: | 315012 *** | 国省代码: | 浙江;33 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 应用 rpa 技术 检测 线虫 方法 引物 试剂盒 | ||
1.应用RPA技术检测杉并根结线虫的RPA引物,所述引物的序列如下:
上游引物MSRPAF:5'- TCCCTTCTCATGGGCTCATTAAGTCTTAAACCG-3'
下游引物MSRPAR:5'- ACTTTGGTCGTGTAACGGCTAACGCTGGTGTCT-3'。
2.一种应用RPA技术检测杉并根结线虫的RPA试剂盒,所述试剂盒中的RPA引物的序列如下:
上游引物MSRPAF:5'- TCCCTTCTCATGGGCTCATTAAGTCTTAAACCG-3'
下游引物MSRPAR:5'- ACTTTGGTCGTGTAACGGCTAACGCTGGTGTCT-3'。
3.如权利要求2所述的应用RPA技术检测杉并根结线虫的RPA试剂盒,其特征在于所述试剂盒的反应体系的组成如下:
反应缓冲液29.5μL,浓度均为10μM的上游引物MSRPAF和下游引物MSRPAR各2.4μL,待测DNA模板1μL,RPA冻干酶粉 适量,280mM的醋酸镁溶液2.5μL ,ddH2O 12.2μL。
4.如权利要求3所述的应用RPA技术检测杉并根结线虫的RPA试剂盒,其特征在于所述试剂盒的反应体系的组成如下:
反应缓冲液29.5μL,浓度均为10μM的上游引物MSRPAF和下游引物MSRPAR各2.4μL,待测DNA模板1μL, 280mM的MgAc溶液2.5μL ,ddH2O 12.2μL,含有RPA冻干酶粉的RPA反应管,RPA扩增反应在RPA反应管中进行。
5.利用权利要求2~4之一所述的RPA试剂盒来检测杉并根结线虫的方法,其特征在于所述方法为:
提取待测线虫样品的DNA 作为模板,利用杉并根结线虫的RPA试剂盒中的特异性引物作为扩增引物,进行RPA 扩增,对扩增产物进行电泳检测,若电泳结果出现145 bp的特异DNA 条带,则待测线虫为杉并根结线虫,反之则否。
6.如权利要求5所述的方法,其特征在于所述RPA扩增的条件如下:38℃反应30分钟。
7.如权利要求5所述的方法,其特征在于所述方法包括如下步骤:
(1)提取待测线虫样品的DNA作为模板;
(2)利用杉并根结线虫的RPA试剂盒中的特异性引物作为扩增引物,进行RPA 扩增,RPA扩增的反应体系如下:
反应缓冲液29.5μL,浓度均为10μM的上游引物MSRPAF和下游引物MSRPAR各2.4μL,待测DNA模板1μL,RPA冻干酶粉 适量,280mM的MgAc溶液2.5μL ,ddH2O 12.2μL;
RPA扩增的条件如下:38℃反应30分钟;
(3)RPA扩增产物进行电泳检测:取出RPA扩增产物5μL,用10 g/L琼脂糖凝胶电泳检测扩增结果,在145 bp处出现扩增条带的为杉并根结线虫,反之则否。
8.如权利要求7所述的方法,其特征在于所述步骤(2)的RPA扩增反应按照以下操作进行:在0.2ml 的PCR管中加入反应缓冲液29.5μL,浓度均为10μM的上游引物MSRPAF和下游引物MSRPAR各2.4μL,待测DNA模板1μL,ddH2O 12.2μL,混匀后,加入到含有RPA冻干酶粉的RPA反应管中混匀,加入280mM的MgAc溶液2.5μL,将RPA反应管置于金属浴中,38℃反应30分钟。
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