[发明专利]小麦常规品种纯度的SSR分子标记检测方法、引物组合及其应用有效
申请号: | 201811337609.2 | 申请日: | 2018-11-08 |
公开(公告)号: | CN109777881B | 公开(公告)日: | 2022-04-08 |
发明(设计)人: | 庞斌双;刘丽华;赵昌平;刘阳娜;张风廷;李宏博;张立平 | 申请(专利权)人: | 北京市农林科学院 |
主分类号: | C12Q1/6895 | 分类号: | C12Q1/6895;C12N15/11 |
代理公司: | 北京法信智言知识产权代理事务所(特殊普通合伙) 11737 | 代理人: | 刘静荣 |
地址: | 100097 *** | 国省代码: | 北京;11 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 小麦 常规 品种 纯度 ssr 分子 标记 检测 方法 引物 组合 及其 应用 | ||
1.检测小麦常规品种纯度用的SSR分子标记引物组合,其特征在于,所述引物组合由以下10对引物组成:
barc80-F:GCGAATTAGCATCTGCATCTGTTTGAG,
barc80-R:CGGTCAACCAACTACTGCACAAC;
barc324-F:CCAATTCTGCCCATAGGTGA,
barc324-R:GAGGAAATAAGATTCAGCCAACTG;
barc164-F:TGCAAACTAATCACCAGCGTAA,
barc164-R:CGCTTTCTAAAACTGTTCGGGATTTCTAA;
cfa2028-F:TGGGTATGAAAGGCTGAAGG,
cfa2028-R:ATCGCGACTATTCAACGCTT;
gwm161-F:GATCGAGTGATGGCAGATGG,
gwm161-R:TGTGAATTACTTGGACGTGG;
gwm610-F:CTGCCTTCTCCATGGTTTGT,
gwm610-R:AATGGCCAAAGGTTATGAAGG;
cfa2123-F:CGGTCTTTGTTTGCTCTAAACC,
cfa2123-R:ACCGGCCATCTATGATGAAG;
gwm294-F:GGATTGGAGTTAAGAGAGAACCG,
gwm294-R:GCAGAGTGATCAATGCCAGA;
gwm155-F:CAATCATTTCCCCCTCCC,
gwm155-R:AATCATTGGAAATCCATATGCC;
gwm304-F:AGGAAACAGAAATATCGCGG,
gwm304-R:AGGACTGTGGGGAATGAATG。
2.权利要求1所述的检测小麦常规品种纯度用的SSR分子标记引物组合在小麦常规品种纯度检测中的应用。
3.小麦常规品种纯度的SSR分子标记检测方法,其特征在于,所述检测方法包括使用权利要求1所述的引物组合对待测的小麦品种DNA进行PCR扩增的步骤。
4.根据权利要求3所述的小麦常规品种纯度的SSR分子标记检测方法,其特征在于,所述检测方法包括以下步骤:
(1)提取待测小麦的DNA;
(2)以步骤(1)提取的DNA为模板、使用权利要求1所述的引物组合进行PCR扩增;
(3)毛细管电泳检测;
(4)根据步骤(3)的毛细管电泳结果,判断待测小麦的纯度。
5.根据权利要求4所述的小麦常规品种纯度的SSR分子标记检测方法,其特征在于,步骤(4)中,首先判断变异位点是否为非纯合的SSR分子标记位点,将非纯合SSR分子标记位点排除后,若某一待测小麦个体中存在至少2个不同于其他多数待测个体的SSR分子标记位点,则判定所述待测小麦个体为杂株。
6.根据权利要求4所述的小麦常规品种纯度的SSR分子标记检测方法,其特征在于,步骤(4)中,当不同的待测小麦个体的同一个位点上携带两种等位变异的杂合子,且随机分布在不同待测小麦个体中时,则判定所述位点为非纯合SSR分子标记位点。
7.根据权利要求3所述的小麦常规品种纯度的SSR分子标记检测方法,其特征在于,所述引物组合中各个引物的末端标记有荧光基团。
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