[发明专利]一种鉴定西瓜果皮底色的CAPS分子标记及其应用有效
申请号: | 201811338556.6 | 申请日: | 2018-11-12 |
公开(公告)号: | CN109251995B | 公开(公告)日: | 2021-05-07 |
发明(设计)人: | 刘文革;路绪强;赵胜杰;何楠;李兵兵 | 申请(专利权)人: | 中国农业科学院郑州果树研究所 |
主分类号: | C12Q1/6895 | 分类号: | C12Q1/6895;C12N15/11 |
代理公司: | 郑州大通专利商标代理有限公司 41111 | 代理人: | 陈勇 |
地址: | 450009 河南省郑州*** | 国省代码: | 河南;41 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 鉴定 西瓜 果皮 底色 caps 分子 标记 及其 应用 | ||
1.一种鉴定西瓜果皮底色的CAPS分子标记,其特征在于,所述的CAPS分子标记在墨绿色果皮底色西瓜中的核苷酸序列如SEQ ID NO:1所示,CAPS分子标记在绿色果皮底色西瓜中的核苷酸序列如 SEQ ID NO:2所示。
2.权利要求1所述的分子标记在鉴定西瓜墨绿色和/或绿色果皮底色中的应用。
3.一种用于检测权利要求1所述的CAPS分子标记的引物组,其特征在于,所述引物组由如SEQ ID NO:3所示的上游引物序列和SEQ ID NO:4所示的下游引物序列组成。
4.权利要求3所述的引物组在鉴定西瓜墨绿色和/或绿色果皮底色中的应用。
5.用于鉴定西瓜果皮底色的试剂盒,其特征在于,所述试剂盒包含权利要求3所述的引物组。
6.利用权利要求3所述引物组鉴定西瓜果皮底色的方法,其特征在于,包括以下步骤:
步骤1:提取西瓜组织的基因组DNA;
步骤2:以权利要求3所述的引物组对步骤1得到的基因组DNA进行PCR扩增;
步骤3:将步骤2的PCR扩增产物经BccI酶切后电泳,得到酶切产物;
步骤4:若酶切产物为715bp一条电泳条带或者715pb、403bp和312pb三条电泳条带,则该西瓜样品为墨绿色果皮底色,若得到403bp和312pb两条电泳条带则该西瓜为绿色果皮底色。
7.根据权利要求6所述的方法,其特征在于,所述PCR扩增的反应体系为:2×PCR Mix12.5μL、 DNA 2μL、上游引物1.25μL、下游引物1.25μL,补充去离子水至25μL。
8.根据权利要求6所述的方法,其特征在于,所述PCR的反应程序为:94℃ 1min30sec;94℃ 20sec,57℃ 20sec,72℃ 50sec,共30个循环;72℃ 5min;4℃保存。
9.权利要求1所述CAPS分子标记在鉴定西瓜果皮底色性状基因型纯度中的应用,所述的果皮底色为墨绿色和/或绿色。
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