[发明专利]一种DNA编码分子库的筛选方法在审
申请号: | 201811351400.1 | 申请日: | 2018-11-14 |
公开(公告)号: | CN109537060A | 公开(公告)日: | 2019-03-29 |
发明(设计)人: | 周海鹏;李笑宇;黄已然 | 申请(专利权)人: | 周海鹏;李笑宇;黄已然 |
主分类号: | C40B30/04 | 分类号: | C40B30/04 |
代理公司: | 深圳中一联合知识产权代理有限公司 44414 | 代理人: | 张全文 |
地址: | 518000 广东*** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 分子库 筛选 目标化合物 靶点蛋白 目标靶点 化合物分子 解码 纯化分离 交联基团 活细胞 有效地 蛋白 | ||
1.一种DNA编码分子库的筛选方法,其特征在于,包括以下步骤:
(1)提供第一DNA标记的目标靶点蛋白;其中,所述第一DNA连接有交联基团,且所述第一DNA通过所述交联基团与目标靶点蛋白交联结合;
(2)筛选目标化合物;将所述第一DNA标记的目标靶点蛋白与DNA编码分子库孵育,得到目标靶点蛋白-编码分子库混合体系,其中,所述DNA编码分子库中至少含有一种能与所述目标靶点蛋白结合的目标编码化合物,且所述DNA编码分子库中的碱基与所述第一DNA靠近目标靶点蛋白一端的至少5个碱基之间形成互补;
(3)分离并解码目标化合物;对所述目标靶点蛋白-编码分子库混合体系进行分离、筛选,将分离得到的目标靶点蛋白-编码分子库偶联体系进行变性解离,分析所述编码分子库中DNA分子类型,根据所述分析结果,确定与目标靶点蛋白结合的化合物类型。
2.如权利要求1所述的DNA编码分子库的筛选方法,其特征在于,提供第一DNA标记的目标靶点蛋白的方法为:
提供目标靶点蛋白,采用第二DNA标记的特异性抗体标记所述目标靶点蛋白,得到第二DNA标记的目标靶点蛋白,其中,所述特异性抗体为目标靶点蛋白的已知抗体;
提供所述第一DNA,将所述第一DNA加入所述第二DNA标记的目标靶点蛋白中,反应得到第一DNA/第二DNA标记的目标靶点蛋白,其中,所述第二DNA与所述第一DNA靠近所述交联基团的一端的至少10个碱基互补,所述第一DNA连接的交联基团与目标靶点蛋白进行交联反应;
提供与所述第二DNA具有互补碱基区域的第三DNA,且所述第三DNA与所述第二DNA的互补程度高于所述第一DNA与所述第二DNA的互补程度,将所述第三DNA加入所述第一DNA/第二DNA标记的目标靶点蛋白中,将所述第二DNA从所述第一DNA/第二DNA标记的目标靶点蛋白解离,得到第一DNA标记的目标靶点蛋白。
3.如权利要求1所述的DNA编码分子库的筛选方法,其特征在于,所述目标靶点蛋白选自膜蛋白、蛋白质复合体、活细胞、病理组织的任一种。
4.如权利要求1-3任一项所述的DNA编码分子库的筛选方法,其特征在于,所述第一DNA的长度为12~20个碱基;和/或,
第二DNA的长度为10~14个碱基;和/或,
第三DNA的长度为12~20个碱基。
5.如权利要求4所述的DNA编码分子库的筛选方法,其特征在于,
所述DNA编码分子库中的碱基与所述第一DNA靠近目标靶点蛋白一端形成互补的碱基为5~8个;和/或,
所述第一DNA与所述第二DNA碱基互补配对长度小于所述第二DNA与所述第三DNA碱基互补配对长度。
6.如权利要求1-3任一项所述的DNA编码分子库的筛选方法,其特征在于,所述交联基团包括光交联基团、亲电基团的任一种。
7.如权利要求6所述的DNA编码分子库的筛选方法,其特征在于,所述光交联基团包括苯基叠氮、二苯甲酮、丙基吖啶中的任一种。
8.如权利要求7所述的DNA编码分子库的筛选方法,其特征在于,所述光交联基团与目标靶点蛋白进行交联反应时,所述交联反应的条件为紫外光照,所述紫外光波长为360nm~370nm,反应时间为9~11秒。
9.如权利要求6所述的DNA编码分子库的筛选方法,其特征在于,所述亲电基团包括N-羟基琥珀酰亚胺、丙烯酰胺、溴代乙酰胺的任一种。
10.如权利要求1-3任一项所述的DNA编码分子库的筛选方法,其特征在于,所述分离的方法包括清洗、超滤任一种;和/或,
所述变性的方法包括加热、破碎任一种。
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