[发明专利]一种同步检测3种菠萝凋萎相关病毒和菠萝杆状DNA病毒的多重RT-PCR检测方法在审
申请号: | 201811372981.7 | 申请日: | 2018-11-19 |
公开(公告)号: | CN109355430A | 公开(公告)日: | 2019-02-19 |
发明(设计)人: | 罗志文;张治礼;范鸿雁;何凡;李向宏;胡福初;郭利军;胡加谊;何舒;余乃通;刘志昕 | 申请(专利权)人: | 海南省农业科学院热带果树研究所 |
主分类号: | C12Q1/70 | 分类号: | C12Q1/70;C12Q1/686;C12N15/11;C12R1/94 |
代理公司: | 广州三环专利商标代理有限公司 44202 | 代理人: | 陈欢 |
地址: | 570100 海*** | 国省代码: | 海南;46 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 菠萝 凋萎 病毒 同步检测 耗时 多重RT-PCR 检测灵敏度 菠萝植株 分子检测 杆状病毒 基层部门 检测结果 快速检测 特异性强 引物组合 病毒病 灵敏度 检测 杆状 耗材 辨别 复制 预警 携带 研究 | ||
1.一种用于同步检测3种菠萝凋萎相关病毒和菠萝杆状DNA病毒的引物组合,其特征在于,所述引物组合包括:
用于特异性RT-PCR检测菠萝凋萎相关病毒-1的引物对I:
PMWaV-1-F:5'-TCCAAAGCTCTGTGGGAGTTGGGT-3',
PMWaV-1-R:5'-ACGTTGTGTTCGCCAGAACCACT-3';
用于特异性RT-PCR检测菠萝凋萎相关病毒-2的引物对II:
PMWaV-2-F:5'-TGGCAACAATCCCAACGGAAGC-3',
PMWaV-2-R:5'-TCGCCGAATGGTTCATGAGGCT-3';
用于特异性RT-PCR检测菠萝凋萎相关病毒-3的引物对III:
PMWaV-3-F:5'-AACCATGGGCGCACAAAACCAG-3',
PMWaV-3-R:5'-CGCTCTCTTTACAAGATGCCAA-3';以及
用于特异性RT-PCR检测菠萝杆状DNA病毒的引物对IV:
PBCoV-F:5'-TATCCTTGTATGCGTGCGTCTAC-3',
PBCoV-R:5'-GCAGAGTTTCCAAAGTTTCGTCAC-3'。
2.一种同步检测3种菠萝凋萎相关病毒和菠萝杆状DNA病毒的多重RT-PCR检测方法,其特征在于,包括以下步骤:
1)提取待测菠萝样品总RNA,并以RNA为模板反转录制备获得第一链cDNA;
2)以步骤1)中获得的cDNA为模板,利用权利要求1所述引物组合,进行特异性PCR扩增反应;
3)用琼脂糖凝胶电泳检测PCR扩增产物。
3.根据权利要求2所述的多重RT-PCR检测方法,其特征在于,步骤1)具体为:提取待测菠萝样品总RNA,向RNase-free的反应管中加入菠萝样品总RNA模板5.0μL,10mM随机引物1.0μL,10mM dNTPs 1.0μL,缓冲液2×RT Buffer 10.0μL,M-MuLV反转录酶1.0μL,RNA酶抑制剂0.5μL和RNase-free Water 1.0μL,于42℃孵育1h,即获得第一链cDNA。
4.根据权利要求2所述的多重RT-PCR检测方法,其特征在于,步骤2)中进行多重RT-PCR扩增使用的25μL PCR反应体系为:
步骤1)所得第一链cDNA溶液1μL,5U/μL Taq酶0.25μL,10×PCR buffer 2.5μL,2.5mMdNTP混合液2.5μL,10μm/μL上、下游引物各0.5μL和ddH2O 14.75μL。
5.根据权利要求4所述的多重RT-PCR检测方法,其特征在于,PCR反应程序为:94℃预变性5min;94℃变性30s,54℃退火30s,72℃延伸1min,循环35次;72℃延伸10min保存。
6.根据权利要求2所述的多重RT-PCR检测方法,其特征在于,步骤3)所述电泳具体为:取5μL PCR扩增产物进行1.5%琼脂糖凝胶电泳30min。
7.根据权利要求2所述的多重RT-PCR检测方法,其特征在于,待测菠萝样品来自于菠萝的叶片、花、果实、芽或茎。
8.根据权利要求7所述的多重RT-PCR检测方法,其特征在于,待测菠萝样品来自于菠萝的叶片、芽或地上茎。
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