[发明专利]检测基因表达水平的试剂的应用以及乳腺癌患者NAC疗效预测模型的构建方法有效
申请号: | 201811438906.6 | 申请日: | 2018-11-28 |
公开(公告)号: | CN109439753B | 公开(公告)日: | 2022-05-06 |
发明(设计)人: | 叶丰;步宏;郑鸿;付波;杨李波;邓玲 | 申请(专利权)人: | 四川大学华西医院 |
主分类号: | C12Q1/6886 | 分类号: | C12Q1/6886 |
代理公司: | 北京超凡志成知识产权代理事务所(普通合伙) 11371 | 代理人: | 曾章沐 |
地址: | 610000 四*** | 国省代码: | 四川;51 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 检测 基因 表达 水平 试剂 应用 以及 乳腺癌 患者 nac 疗效 预测 模型 构建 方法 | ||
1.检测目标基因表达水平的试剂在制备疗效预测或评估试剂盒中的应用,其特征在于,所述目标基因包括如下3组基因组 :
基因组A,其包括如下基因:TFF1、NAT1、AGR2、ESR1、FOXA1、MLPH以及GATA3;
基因组B,其包括如下基因:CYAT1、IGLC1、IGHM、IGKC以及CXCL13;
基因组C,其包括如下基因:SFRP1和ELF5;
所述疗效是指乳腺癌患者接受NAC治疗的疗效,NAC治疗是指4周期或6周期蒽环类联合紫杉类药物的治疗方案。
2.根据权利要求1所述的应用,其特征在于,所述目标基因包括有参考基因;所述参考基因为以下一种或几种基因的组合:ACTB、GAPDH以及RPLPO。
3.根据权利要求1所述的应用,其特征在于,所述检测目标基因表达水平的试剂为RT-PCR检测方法用试剂、Northern-blot检测方法用试剂或原位杂交检测方法用试剂。
4.根据权利要求3所述的应用,其特征在于,所述RT-PCR检测方法用试剂包括有:RT-PCR反应液、阳性对照品以及阴性对照品。
5.根据权利要求3所述的应用,其特征在于,所述Northern-blot检测方法用试剂包括有:放射性标记的探针、杂交液以及检测液。
6.根据权利要求3所述的应用,其特征在于,所述试剂还包括如下引物对:
如SEQ ID NO.1所示的上游引物和SEQ ID NO.2所示的下游引物组成的用于检测基因TFF1的第一引物对;
如SEQ ID NO.4所示的上游引物和SEQ ID NO.5所示的下游引物组成的用于检测基因NAT1的第二引物对;
如SEQ ID NO.7所示的上游引物和SEQ ID NO.8所示的下游引物组成的用于检测基因AGR2的第三引物对;
如SEQ ID NO.10所示的上游引物和SEQ ID NO.11所示的下游引物组成的用于检测基因ESR1的第四引物对;
如SEQ ID NO.13所示的上游引物和SEQ ID NO.14所示的下游引物组成的用于检测基因FOXA1的第五引物对;
如SEQ ID NO.16所示的上游引物和SEQ ID NO.17所示的下游引物组成的用于检测基因MLPH的第六引物对;
如SEQ ID NO.19所示的上游引物和SEQ ID NO.20所示的下游引物组成的用于检测基因GATA3的第七引物对;
如SEQ ID NO.22所示的上游引物和SEQ ID NO.23所示的下游引物组成的用于检测基因CYAT1的第八引物对;
如SEQ ID NO.25所示的上游引物和SEQ ID NO.26所示的下游引物组成的用于检测基因IGLC1的第九引物对;
如SEQ ID NO.28所示的上游引物和SEQ ID NO.29所示的下游引物组成的用于检测基因IGHM的第十引物对;
如SEQ ID NO.31所示的上游引物和SEQ ID NO.32所示的下游引物组成的用于检测基因IGKC的第十一引物对;
如SEQ ID NO.34所示的上游引物和SEQ ID NO.35所示的下游引物组成的用于检测基因CXCL13的第十二引物对;
如SEQ ID NO.37所示的上游引物和SEQ ID NO.38所示的下游引物组成的用于检测基因SFRP1的第十三引物对;
如SEQ ID NO.40所示的上游引物和SEQ ID NO.41所示的下游引物组成的用于检测基因ELF5的第十四引物对;
如SEQ ID NO.43所示的上游引物和SEQ ID NO.44所示的下游引物组成的用于检测基因ACTB的第十五引物对;
如SEQ ID NO.46所示的上游引物和SEQ ID NO.47所示的下游引物组成的用于检测基因GAPDH的第十六引物对;
如SEQ ID NO.49所示的上游引物和SEQ ID NO.50所示的下游引物组成的用于检测基因RPLPO的第十七引物对。
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