[发明专利]一种编码KANSL1基因突变体的核酸及其应用有效

专利信息
申请号: 201811444952.7 申请日: 2018-11-29
公开(公告)号: CN109402131B 公开(公告)日: 2021-07-23
发明(设计)人: 王开宇;陈燕惠;宋光运;吴晶晶;刘小霞 申请(专利权)人: 福州福瑞医学检验实验室有限公司;福建医科大学附属协和医院
主分类号: C12N15/12 分类号: C12N15/12;C12N15/11;C12N5/10;C12Q1/6883;C12Q1/02;C07K14/47
代理公司: 福州市景弘专利代理事务所(普通合伙) 35219 代理人: 林祥翔;黄以琳
地址: 350012 福建省福州市晋*** 国省代码: 福建;35
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摘要:
搜索关键词: 一种 编码 kansl1 基因 突变体 核酸 及其 应用
【说明书】:

发明公开了一种编码KANSL1基因突变体的核酸及其应用,属于基因工程技术领域。该突变体与野生型相比,具有c.3031CT突变,其编码的多肽的氨基酸序列具有p.Arg1011*突变。通过检测该新突变体是否存在,可有效筛选出易患Koolen‑de Vries综合征的生物样品。本发明的检测方法快速、准确、高效。

技术领域

本发明属于基因工程技术领域,具体涉及一种KANSL1基因突变体及其应用。具体地,本发明涉及分离的编码KANSL1基因突变体的核酸及其编码的多肽,含KANSL1突变体核酸的重组细胞,以及筛选易患Koolen-de Vries综合征的生物样品的方法。

背景技术

Koolen-de Vries综合征是一种以发育迟缓和轻度至中度智力残疾为特征的疾病。该病患者通常被描述为性格开朗,善于交际和合作。他们通常在幼年时出现肌张力减退。约一半患有复发性癫痫。受累者通常具有独特的面部特征,包括高而宽的额头、眼睑下垂、眼裂狭窄、外眼角上斜、内眦赘皮、蒜头鼻、耳朵突出。Koolen-de Vries综合征的患病男性经常有隐睾。部分受累者可出现室间隔缺损或其他心脏异常、肾脏异常和骨骼异常。Koolen-de Vries综合征患者可能会失去生育能力,因为没有任何已知Koolen-de Vries综合征患者有生育后代。

Koolen-de Vries综合征由KANSL1基因突变或缺失后的单倍剂量不足所导致。大多数受累者有17q21.31的杂合微缺失,极少数有KANSL1基因内的杂合缺失或碱基突变。KANSL1基因的蛋白产物在出生前和整个生命中在身体的大多数器官和组织中表达。该蛋白质通过参与控制其他基因的活性,在身体许多部分的发育和功能中起重要作用。但目前KANSL1基因损失与Koolen-de Vries综合征的特定体征和症状的关系尚不清楚。由于KANSL1基因突变病例罕见,KANSL1基因的哪些位点可以导致Koolen-de Vries综合征的发生还不清楚。

因而,可用于Koolen-de Vries综合征诊断的KANSL1基因致病突变对于建立Koolen-de Vries综合征的基因检测新方法,明确基因突变位点与临床表型的相关性具有重要意义。

发明内容

为此,需要提供一种KANSL1基因突变体,并提出一种能够有效筛选易患Koolen-deVries综合征的生物样品的方法。

为实现上述目的,发明人提供的技术方案如下:

根据国际医学最新研究进展,多种遗传性疾病可导致智力障碍,因此主要表型为智力障碍时,患者的分子诊断要检测众多基因,而Sanger测序等经典分子诊断技术在检测速度、检测费用等方面无法满足临床需求。第二代测序技术可同步对智力障碍相关的众多基因或全基因组的外显子序列进行序列分析,具有快速、准确、经济的特点。第二代测序是利用设计的DNA序列探针将目标基因或全基因组中的外显子区域捕获下来,然后针对每个外显子进行深度测序。利用该技术流程用于患者疾病诊断或者寻找疾病致病基因已成研究热点。苗圃等(苗圃,彭镜,陈晨,等.不明原因智力障碍共患癫痫患者的临床及遗传学分析[J].中华实用儿科临床杂志,2017,32(8):603-606.)利用第二代测序技术对40例不明原因智力障碍伴癫痫患者进行基因检测,其遗传性确诊率为18%。Itsara等(Itsara A,VissersL E,Steinberg K M,et al.Resolving the breakpoints of the17q21.31microdeletion syndrome with next-generation sequencing.[J].AmericanJournal of Human Genetics,2012,90(4):599-613.)利用第二代测序技术发现了Koolen-de Vries综合征基因位点断裂的规律,为阐明Koolen-de Vries综合征的发病机制提供的重要的依据。由此可见,第二代测序技术正在推动Koolen-de Vries综合征等众多智力障碍疾病的诊断及其机制研究的迅速发展。

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