[发明专利]黄秋葵叶绿体微卫星多态性标记引物及品种分子鉴定方法有效
申请号: | 201811486253.9 | 申请日: | 2018-12-06 |
公开(公告)号: | CN109338008B | 公开(公告)日: | 2022-06-14 |
发明(设计)人: | 俞晨良;孙晨栋;董文其 | 申请(专利权)人: | 浙江省农业科学院;浙江农林大学 |
主分类号: | C12Q1/6895 | 分类号: | C12Q1/6895;C12N15/11 |
代理公司: | 杭州万合知识产权代理事务所(特殊普通合伙) 33294 | 代理人: | 余冬 |
地址: | 310000 浙*** | 国省代码: | 浙江;33 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 秋葵 叶绿体 卫星 多态性 标记 引物 品种 分子 鉴定 方法 | ||
本发明公开了黄秋葵叶绿体微卫星多态性标记引物及品种分子鉴定方法。本发明中多态性标记引物的序列为:SEQ ID NO.1~SEQ ID NO.24。基于提供的多态性标记引物,通过常规PCR扩增、非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳和DNA指纹图谱分析,可以对黄秋葵品种进行亲缘关系分析。同时,利用提供的多态性标记引物对黄秋葵品种PCR扩增、电泳检测,获得特定黄秋葵品种四个特异性DNA序列,基于这些特异性DNA序列,可以实现目标黄秋葵品种的分子鉴定。本发明所述的多态性引物及其应用方法能够反映黄秋葵品种细胞质基因组的遗传信息,提供了关于黄秋葵细胞核DNA之外的其他物质用于鉴定黄秋葵的种质资源的方法,解决了黄秋葵资源鉴定中的不全面问题。
技术领域
本发明属于分子生物学技术领域,特别涉及黄秋葵叶绿体微卫星多态性标记引物及品种分子鉴定方法。
背景技术
黄秋葵(Abelmoschus esculentus L.)是锦葵科秋葵属一年生草本植物,又名秋葵、黄葵、补肾草、羊豆角、羊芝麻、咖啡葵等。其原产于非洲,现普遍栽培与热带和亚热带地区。黄秋葵嫩果富含蛋白质、纤维素、不饱和脂肪酸及铁、锰、锌、钙和钾等矿物质,具有很高的食用价值,其果荚润滑柔嫩,可清炒、凉拌、做汤、加工、制罐等。另外,还富含多糖、黄酮、花青素及萜类等多种生物活性成分,具有助消化、抗癌、抗肿瘤、消炎、保肝及增强人体免疫力等功效。因此,黄秋葵是集食、药、工业加工于一身的兼用型植物。黄秋葵品种较多,对黄秋葵种质资源的准确区分和鉴定是进行良种选育和遗传改良的重要基础。
微卫星分子标记(Simple Sequence Repeat,SSR)是指基因组中由1-6个核苷酸为基本重复单位构成的一段DNA序列。微卫星DNA在真核生物基因组中的含量非常丰富,并且广泛分布于基因组中的不同位置。该标记已经被广泛应用于生物的种质鉴定、遗传多样性评价和亲缘关系分析研究中。目前,SSR在黄秋葵中的应用研究主要是针对细胞核DNA。但是,由于植物细胞中,除了细胞核遗传外,还具有细胞质遗传,而目前,尚未有关于黄秋葵细胞核DNA之外的其他物质用于鉴定黄秋葵的种质资源。为了解决现有技术在黄秋葵资源鉴定中的不全面问题,迄今为止,也尚未有关于黄秋葵叶绿体微卫星分子标记开发及应用的研究报道。
发明内容
本发明的目的在于,提供黄秋葵叶绿体微卫星多态性标记引物及品种分子鉴定方法。本发明提供了关于黄秋葵细胞核DNA之外的其他物质用于鉴定黄秋葵的种质资源的方法,解决了黄秋葵资源鉴定中的不全面问题。
本发明的技术方案:黄秋葵叶绿体微卫星多态性标记引物,包括12对引物,其引物序列信息如下:
AEcpSSR1正向引物如序列表中SEQ ID NO.1所示;
AEcpSSR1反向引物如序列表中SEQ ID NO.2所示;
AEcpSSR3正向引物如序列表中SEQ ID NO.3所示;
AEcpSSR3反向引物如序列表中SEQ ID NO.4所示;
AEcpSSR4正向引物如序列表中SEQ ID NO.5所示;
AEcpSSR4反向引物如序列表中SEQ ID NO.6所示;
AEcpSSR10正向引物如序列表中SEQ ID NO.7所示;
AEcpSSR10反向引物如序列表中SEQ ID NO.8所示;
AEcpSSR11正向引物如序列表中SEQ ID NO.9所示;
AEcpSSR11反向引物如序列表中SEQ ID NO.10所示;
AEcpSSR12正向引物如序列表中SEQ ID NO.11所示;
AEcpSSR12反向引物如序列表中SEQ ID NO.12所示;
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