[发明专利]一种环状RNA hsa-circ-0044506及其特异性扩增引物和应用在审
申请号: | 201811508150.8 | 申请日: | 2018-12-11 |
公开(公告)号: | CN109280705A | 公开(公告)日: | 2019-01-29 |
发明(设计)人: | 王立斌;张旭 | 申请(专利权)人: | 宁夏医科大学总医院 |
主分类号: | C12Q1/6886 | 分类号: | C12Q1/6886;C12Q1/6806;C12N15/11 |
代理公司: | 北京弘权知识产权代理事务所(普通合伙) 11363 | 代理人: | 逯长明;许伟群 |
地址: | 750004 宁夏回*** | 国省代码: | 宁夏;64 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 特异性扩增引物 环状RNA 核苷酸序列 乳腺癌 上游引物 下游引物 试剂盒 筛查 应用 分子标志物 乳腺癌组织 高表达 扩增 制备 血液 细胞 | ||
1.一种环状RNA,其特征在于,所述环状RNA在circ-RNA数据库中的全称为hsa-circ-0044506,其核苷酸序列如SEQ ID NO:1所示。
2.权利要求1所述环状RNA用作筛查乳腺癌的分子标志物的用途。
3.用于扩增权利要求1所述环状RNA的特异性扩增引物,其特征在于,所述特异性扩增引物包括上游引物和下游引物,其中,
所述上游引物的核苷酸序列如SEQ ID NO:2所示;
所述下游引物的核苷酸序列如SEQ ID NO:3所示。
4.一种扩增权利要求1所述环状RNA的方法,其特征在于,所述方法包括:
步骤1,合成第一链cDNA:混合原料,所述原料包括权利要求1所述环状RNA、随机引物、ddH2O、dNTP混合液、反转录缓冲液、RNA酶抑制剂、反转录酶,按照第一程序控温反应;
步骤2,对步骤1制得的第一链cDNA进行实时荧光定量聚合酶链式反应扩增:配制扩增体系,所述扩增体系包括步骤1制备的cDNA、如权利要求3所示的上游引物、如权利要求3所示的下游引物、ddH2O、qPCR扩增荧光染料Mix,按照第二程序控温反应。
5.根据权利要求4所述的方法,其特征在于,步骤1中,
所述原料的按照如下配比混合:1μl权利要求1所述环状RNA,1μl随机引物,10μl ddH2O,2μl dNTP混合液,4μl反转录缓冲液,1μl RNA酶抑制剂,1μl反转录酶,其中,所述dNTP混合液包括dATP,dGTP,dCTP和dTTP;
所述第一程序为:25℃条件下反应5min,42℃条件下反应60min,最后在70℃条件下反应5min。
6.根据权利要求4所述的方法,其特征在于,步骤2中,
所述扩增体系按照如下配比配制:2μl步骤1制备的cDNA,0.5μl如权利要求3所述的上游引物,0.5μl如权利要求3所述的下游引物,7μl ddH2O,10μl qPCR扩增荧光染料Mix;
所述第二程序为:95℃预变性10s,然后以95℃反应15s、60℃反应30s、72℃反应40s进行40个循环,以95℃反应5s、65℃反应1min、37℃反应1min,最后终止反应。
7.权利要求3所述的特异性扩增引物在制备用于乳腺癌筛查的试剂盒中的应用。
8.一种用于乳腺癌筛查的试剂盒,其特征在于,所述试剂盒包括权利要求3所述的特异性扩增引物。
9.根据权利要求8所述的试剂盒,其特征在于,所述试剂盒还包括反转录酶、缓冲液、ddH2O、DNA聚合酶、荧光染料和dNTP混合液中的至少一种。
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