[发明专利]一种病原体感染损伤机理解析方法及装置

权利要求书

1.一种病原体感染损伤机理解析方法，其特征在于，包括：

获取多个基因沉默后的全基因组表达数据；

获取所述全基因组表达数据所对应的基因表达秩序列；

从数据库获取多种不同病原体感染后的全基因组表达谱数据；

基于所述全基因组表达谱数据构建所述病原体感染的印记基因集；

获取所述基因表达秩序列与所述印记基因集的富集分数；

根据所述富集分数确定所述病原体感染的损伤机理；

其中，所述基于所述全基因组表达谱数据构建所述病原体感染的印记基因集，包括：

获取所述全基因组表达谱数据所对应的差异表达量；

按照所述差异表达量从高到低将所述全基因组表达谱数据所对应的基因从上到下排列，得到秩序列；

从所述秩序列顶部与底部获取多个基因；

将所述多个基因作为所述病原体感染的印记基因集；

以及，所述根据所述富集分数确定所述病原体感染的损伤机理，包括：

确定所述富集分数是否为正数；

若是，根据所述富集分数确定所述基因沉默的细胞反应和所述病原体感染损伤的细胞反应一致；

其中，述确定所述富集分数是否为正数，包括：

确定所述印记基因集中的目标基因子集合是否位于所述基因沉默下的所述基因表达秩序列的对应位置；

若是，则确定所述富集分数为正数；

或者，所述根据所述富集分数确定所述病原体感染的损伤机理，包括：

以所述富集分数为权重构建所述基因沉默所使用的基因和所述病原体感染所使用的病原体之间的关联网络；

获取所述关联网络中所有所述富集分数最高的关联关系，所述关联关系用于表征所述基因和所述病原体感染所使用的病原体之间的关系；

根据所述关联关系确定所述病原体感染的损伤机理。

2.根据权利要求1所述的方法，其特征在于，所述获取多个基因沉默后的全基因组表达数据，包括：

从LINCS数据库获取多个基因沉默后的全基因组表达数据。

3.一种病原体感染损伤机理解析装置，其特征在于，包括：

第一获取单元，用于获取多个基因沉默后的全基因组表达数据；

第一处理单元，用于获取所述全基因组表达数据所对应的基因表达秩序列；

第二获取单元，用于从数据库获取多种不同病原体感染后的全基因组表达谱数据；

第二处理单元，用于基于所述全基因组表达谱数据构建所述病原体感染的印记基因集；

第三获取单元，用于获取所述基因表达秩序列与所述印记基因集的富集分数；

第四处理单元，用于根据所述富集分数确定所述病原体感染的损伤机理；

所述第二处理单元还用于获取所述全基因组表达谱数据所对应的差异表达量；按照所述差异表达量从高到低将所述全基因组表达谱数据所对应的基因从上到下排列，得到秩序列；从所述秩序列顶部与底部获取多个基因；将所述多个基因作为所述病原体感染的印记基因集；

所述第四处理单元还用于确定所述富集分数是否为正数；若是，根据所述富集分数确定所述基因沉默的细胞反应和所述病原体感染损伤的细胞反应一致；

所述第四处理单元具体用于确定所述印记基因集中的目标基因子集合是否位于所述基因沉默下的所述基因表达秩序列的对应位置；若是，则确定所述富集分数为正数；

所述第四处理单元还用于以所述富集分数为权重构建所述基因沉默所使用的基因和所述病原体感染所使用的病原体之间的关联网络；获取所述关联网络中所有所述富集分数最高的关联关系，所述关联关系用于表征所述基因和所述病原体感染所使用的病原体之间的关系；根据所述关联关系确定所述病原体感染的损伤机理。

4.根据权利要求3所述的装置，其特征在于，所述第一获取单元，还用于：

从LINCS数据库获取多个基因沉默后的全基因组表达数据。