[发明专利]与水稻耐盐性相关的SNP分子标记及其应用在审
| 申请号： | 201811531107.3 | 申请日： | 2018-12-14 |
| 公开（公告）号： | CN109371162A | 公开（公告）日： | 2019-02-22 |
| 发明（设计）人： | 赵秀琴;王文生;穆罕默德·马布布尔·拉希德;傅彬英;王银晓;谢自艳;徐建龙;黎志康 | 申请（专利权）人： | 中国农业科学院作物科学研究所;中国农业科学院深圳生物育种创新研究院 |
| 主分类号： | C12Q1/6895 | 分类号： | C12Q1/6895;C12N15/11 |
| 代理公司： | 北京纪凯知识产权代理有限公司 11245 | 代理人： | 关畅;陈晓庆 |
| 地址： | 100081 北*** | 国省代码： | 北京;11 |
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| 摘要： | |||
| 搜索关键词： | 水稻耐盐性 盐胁迫条件 水稻品种 耐盐性 分子标记辅助育种 核苷酸序列 位点基因型 水稻 存活指数 水稻苗期 水稻耐盐 验证结果 自然群体 多态性 基因型 染色体 可用 引物 幼苗 应用 预测 | ||
1.一种鉴定或辅助鉴定水稻耐盐性的方法，是检测待测水稻第7号染色体第10,979,736位的基因型是AA基因型还是GG基因型：AA基因型的待测水稻的耐盐性强于GG基因型的待测水稻；
所述AA基因型是水稻基因组第7号染色体第10,979,736位脱氧核糖核苷酸均为A的纯合体；
所述GG基因型是水稻基因组第7号染色体第10,979,736位脱氧核糖核苷酸均为G的纯合体。
2.根据权利要求1所述的方法，其特征在于：所述耐盐性为苗期耐盐性。
3.根据权利要求1或2所述的方法，其特征在于：所述检测待测水稻第7号染色体第10,979,736位的基因型是AA基因型还是GG基因型的方法为如下A)或B)：
A)直接测序；
B)测序含有水稻基因组第7号染色体第10,979,736位脱氧核糖核苷酸的PCR扩增产物。
4.根据权利要求3所述的方法，其特征在于：所述PCR扩增产物所用的引物为1)或2)：
1)由序列表中序列1所示的单链DNA分子和序列表中序列2所示的单链DNA分子组成的引物对A；
2)由序列A所示的单链DNA分子和序列B所示的单链DNA分子组成的引物对B；
所述序列A为将序列1删除或增加或改变一个或几个核苷酸，且与序列1具有相同功能的核苷酸；
所述序列B为将序列2删除或增加或改变一个或几个核苷酸，且与序列2具有相同功能的核苷酸。
5.检测水稻第7号染色体第10,979,736位的基因型的物质在如下(a1)-(a8)中任一种中的应用：
(a1)鉴定或辅助鉴定待测水稻耐盐性；
(a2)制备鉴定或辅助鉴定待测水稻耐盐性的产品；
(a3)选育耐盐水稻品种；
(a4)制备选育耐盐水稻品种的产品；
(a5)改良水稻的耐盐性；
(a6)制备改良水稻的耐盐性的产品；
(a7)水稻分子育种；
(a8)制备水稻分子育种的产品。
6.一种鉴定或辅助鉴定待测水稻耐盐性的产品，为检测水稻第7号染色体第10,979,736位的基因型的物质。
7.根据权利要求6所述的产品，其特征在于：所述产品为如下(b1)-(b3)中任一种：
(b1)权利要求4中所述的引物；
(b2)含有(b1)所述的引物的PCR试剂；
(b3)含有(b1)所述的引物或(b2)所述的PCR试剂的试剂盒。
8.权利要求6或7所述的产品在如下(c1)-(c4)中任一种应用：
(c1)鉴定或辅助鉴定待测水稻耐盐性；
(c2)选育耐盐水稻品种；
(c3)改良水稻的耐盐性；
(c4)水稻分子育种。
9.一种选育耐盐水稻品种的方法，包括选择AA基因型的水稻品种进行育种的步骤；所述AA基因型是水稻基因组第7号染色体第10,979,736位脱氧核糖核苷酸均为A的纯合体。
10.根据权利要求5所述的应用或权利要求6或7所述产品或权利要求8所述的应用或权利要求9所述的方法，其特征在于：所述耐盐性为苗期耐盐性。
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