[发明专利]一种马铃薯卷叶病毒PLRV的反转录环介导等温扩增RT-LAMP检测试剂在审

专利信息
申请号: 201811541908.8 申请日: 2018-12-17
公开(公告)号: CN109355438A 公开(公告)日: 2019-02-19
发明(设计)人: 高彦萍;吕和平;张武;贾小霞;吴雁斌;梁宏杰 申请(专利权)人: 甘肃省农业科学院马铃薯研究所
主分类号: C12Q1/70 分类号: C12Q1/70;C12Q1/6844;C12N15/11
代理公司: 北京智客联合知识产权代理事务所(特殊普通合伙) 11700 代理人: 李戍
地址: 730070 甘*** 国省代码: 甘肃;62
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摘要:
搜索关键词: 卷叶 马铃薯 病毒 检测 环介导等温扩增 生物检测技术 特异性引物 病毒诊断 基层单位 现场检测 反转录 灵敏 田间 进出口 应用 展示
【权利要求书】:

1.用于检测马铃薯卷叶病毒PLRV的反转录环介导等温扩增RT-LAMP引物组,其特征在于:所述引物组由以下引物组成:

上游内引物FIP:CATCGGATACGTCGTCAGACGG-AGGGACGAAACCCCGATAC;

下游内引物BIP:ACTGAGTCGCTGCGATTGGAG-TGGGCCAGTCTGTACCAT;

上游外引物F3:GGAAGGAAAACCGGTTGGAA;

下游外引物B3:GTTCAGGTGGGTGCCTTG;

PLRV-LF:CAGGTTGTCTTTCCTGCGTTT;

PLRV-LB:AGTACCTACGATGCTACAGTCG。

2.一种马铃薯卷叶病毒PLRV的反转录环介导等温扩增RT-LAMP检测试剂,其特征在于:所述试剂包括权利要求1所述的引物组。

3.根据权利要求2所述的试剂,其特征在于:所述试剂还包括如下组分:10×Bstbuffer、浓度为100mmol·L-1的Mg2+、dNTPs、浓度为2U·μL-1的UNG、浓度为8U·µL-1的Bst3.0DNA聚合酶、引物混合液、终浓度为2ng·µL-1的RNA样品、SYBR Green I、 DEPC H2O。

4.根据权利要求3所述的试剂,其特征在于:所述dNTPs中dATP、dGTP、dCTP的浓度为10mmol·L-1,dUTP的浓度为 30 mmol·L-1

5.根据权利要求3所述的试剂,其特征在于:所述引物混合液中,F3和B3的浓度为2μmol·L-1,FIP和BIP的浓度为8μmol·L-1,LF和LB的浓度为6 μmol·L-1

6.根据权利要求3所述的试剂,其特征在于:所述试剂还包括阴性对照和阳性对照。

7.一种马铃薯卷叶病毒PLRV的反转录环介导等温扩增RT-LAMP检测试剂盒,其特征在于:所述试剂盒包括权利要求2-6任一项所述的反转录环介导等温扩增RT-LAMP检测试剂。

8.权利要求2-6任一项所述的检测试剂或权利要求7所述的检测试剂盒在如下任一中的应用: (1)检测或辅助检测马铃薯卷叶病毒PLRV;

(2)制备用于检测或辅助检测马铃薯卷叶病毒PLRV的产品;

(3)检测或辅助检测待测植物样品是否感染马铃薯卷叶病毒PLRV;

(4)制备用于检测或辅助检测待测植物样品是否为感染马铃薯卷叶病毒PLRV的产品;

(5)检测待测病毒是否为马铃薯卷叶病毒PLRV;

(6)制备用于检测或辅助检测待测病毒是否为马铃薯卷叶病毒PLRV的产品。

9.一种检测或辅助检测待测植物样品是否感染马铃薯卷叶病毒PLRV的方法,其特征在于:包括以下步骤: (1)从待测植物样品中提取基因组RNA作为模板,采用权利要求2-6任一项所述的检测试剂或权利要求7所述的检测试剂盒进行反转录环介导等温扩增,得到扩增产物;作为优选,所述反转录环介导等温扩增的反应条件为:60℃反应50 min;

(2)按照下述任一方法确定待测植物样品是否感染马铃薯卷叶病毒PLRV:

A、反应结束后,将产物进行琼脂糖凝胶电泳,出现典型的阶梯状条带即为阳性;

B、加入1µL 1000× SYBR GreenⅠ,振荡混匀,直接目视观察结果,阳性产物颜色变为绿色,阴性产物颜色为褐色;

C、加入1µL50× SYBR GreenⅠ,振荡混匀,紫外线下观察结果,阳性样品发出强荧光,阴性样品不发出强荧光。

10.一种检测或辅助检测待测病毒是否为马铃薯卷叶病毒PLRV的方法,其特征在于:包括以下步骤: (1)从待测病毒中提取基因组RNA作为模板,采用权利要求2-6任一项所述的检测试剂或权利要求7所述的检测试剂盒进行反转录环介导等温扩增,得到扩增产物;作为优选,所述反转录环介导等温扩增的反应条件为:60℃反应50 min;

(2)按照下述任一方法确定待测病毒是否为马铃薯卷叶病毒PLRV:

A、反应结束后,将产物进行琼脂糖凝胶电泳,出现典型的阶梯状条带即为阳性;

B、加入1µL 1000× SYBR GreenⅠ,振荡混匀,直接目视观察结果,阳性产物颜色变为绿色,阴性产物颜色为褐色;

C、加入1µL50× SYBR GreenⅠ,振荡混匀,紫外线下观察结果,阳性样品发出强荧光,阴性样品不发出强荧光。

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