[发明专利]差异表达基因筛选方法及装置

说明书

本发明提供了一种差异表达基因筛选方法及装置，涉及差异表达基因筛选的技术领域，通过获取待筛选基因表达量；对所述待筛选基因表达量进行初步筛选，得到初筛差异表达基因；生成所述初筛差异表达基因对应的关联规则；基于所述关联规则，从所述初筛差异表达基因中筛选差异表达基因的方式，建立了关联规则，实现对初筛差异表达基因进行再筛选，得到精度更高的差异表达基因的同时，还节省了对初筛差异表达基因逐一实验所需大量的人力物力。

技术领域

本发明涉及差异表达基因筛选技术领域，尤其是涉及一种差异表达基因筛选方法及装置。

背景技术

基因的差异化表达由多种因素共同导致，并且与许多疾病的发生和发展有密切联系，对差异化表达的基因进行生物信息学以及生物统计学的分析对于研究细胞调节机制和疾病机理有着重要意义。

目前，针对差异基因表达的筛选，现有技术基于传统方法已有大量的工具，但是传统方法没有设置再筛选过程，筛选精度低。

发明内容

有鉴于此，本发明的目的在于提供一种差异表达基因筛选方法及装置，以解决传统方法中没有设置再筛选过程，筛选精度低的技术问题。

第一方面，本发明实施例提供了一种差异表达基因筛选方法，包括：

获取待筛选基因表达量；

对所述待筛选基因表达量进行初步筛选，得到初筛差异表达基因；

生成所述初筛差异表达基因对应的关联规则；

基于所述关联规则，从所述初筛差异表达基因中筛选差异表达基因。

结合第一方面，本发明实施例提供了第一方面的第一种可能的实施方式，其中，对所述待筛选基因表达量进行初步筛选，得到初筛差异表达基因的步骤，包括：

获取所述待筛选基因表达量的表达矩阵、分组矩阵和差异比较矩阵；

根据所述表达矩阵、分组矩阵和差异比较矩阵进行差异表达基因分析，得到初筛差异表达基因。

结合第一方面，本发明实施例提供了第一方面的第二种可能的实施方式，其中，生成所述初筛差异表达基因对应的关联规则的步骤包括：

根据所述初筛差异表达基因生成差异表达基因事务集；

根据所述差异表达基因事务集确定频繁项集；

根据所述频繁项集和所述基因事务集确定所述初筛差异表达基因对应的关联规则。

结合第一方面，本发明实施例提供了第一方面的第三种可能的实施方式，其中，根据所述初筛差异表达基因生成差异表达基因事务集的步骤，包括：

获取所述初筛差异表达基因对应差异表达倍数FC划分强度类别；

基于所述初筛差异表达基因，根据所述强度类别，生成差异表达基因事务集。

结合第一方面，本发明实施例提供了第一方面的第四种可能的实施方式，其中，基于所述关联规则，从所述初筛差异表达基因中筛选差异表达基因的步骤，包括：

根据所述事务集确定所述关联规则的支持度；

根据所述频繁项集确定所述关联规则的置信度；

根据所述支持度、置信度及相应的提升度，从所述初筛差异表达基因中筛选差异表达基因。

结合第一方面，本发明实施例提供了第一方面的第五种可能的实施方式，其中，根据所述支持度、置信度及相应的提升度，从所述初筛差异表达基因中筛选差异表达基因的步骤，包括：

根据所述置信度比所述支持度确定所述提升度；

获取预设的提升度阈值；