[发明专利]一种血清淀粉样蛋白A抗原表位、其预测与验证方法及单克隆抗体的制备方法在审
| 申请号： | 201811560976.9 | 申请日： | 2018-12-20 |
| 公开（公告）号： | CN109678945A | 公开（公告）日： | 2019-04-26 |
| 发明（设计）人： | 顾悦;周俊花;徐长银 | 申请（专利权）人： | 迪亚莱博（张家港）生物科技有限公司 |
| 主分类号： | C07K14/47 | 分类号： | C07K14/47;C07K16/18;C12N5/20;G01N33/68;G01N33/543 |
| 代理公司： | 苏州创元专利商标事务所有限公司 32103 | 代理人： | 孙仿卫;周敏 |
| 地址： | 215600 江苏省苏州市张家港*** | 国省代码： | 江苏;32 |
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| 摘要： | |||
| 搜索关键词： | 血清淀粉样蛋白A 单克隆抗体 抗原表位 预测 验证 表位 制备 表位序列 非冗余 预测表 抗原表位多肽 转角 弹性序列 实验验证 线性表位 应用合成 长片段 抗原性 亲水性 抗原 准确率 长表 抗体 去除 重复 | ||
1.一种血清淀粉样蛋白A抗原表位，其特征在于：所述的抗原表位包括如SEQ ID NO.1、SEQ ID NO.2、SEQ ID NO.3、SEQ ID NO.4所示的序列。
2.一种血清淀粉样蛋白A抗原表位的预测与验证方法，其特征在于：包括如下步骤：
(1)预测血清淀粉样蛋白A抗原的表面可及性，获得多个第一表位序列；
(2)预测血清淀粉样蛋白A抗原的弹性序列区域，获得多个第二表位序列；
(3)预测血清淀粉样蛋白A抗原的β转角，获得多个第三表位序列；
(4)预测血清淀粉样蛋白A抗原的抗原性，获得多个第四表位序列；
(5)预测血清淀粉样蛋白A抗原的亲水性，获得多个第五表位序列；
(6)预测血清淀粉样蛋白A抗原的线性表位，获得多个第六表位序列；
(7)预测血清淀粉样蛋白A抗原的长片段表位，获得多个第七表位序列；
(8)去除所述的第一表位序列、所述的第二表位序列、所述的第三表位序列、所述的第四表位序列、所述的第五表位序列、所述的第六表位序列、所述的第七表位序列中的重复的表位和包含在其他较长表位中的序列，得到多个非冗余预测表位；
(9)采用ELISA验证所述的多个非冗余预测表位是否为抗体的识别表位。
3.根据权利要求2所述的血清淀粉样蛋白A抗原表位的预测与验证方法，其特征在于：步骤(1)采用Emini Surface Accessibility Prediction进行预测；步骤(2)采用Karplus&Schulz Flexibility Prediction进行预测；步骤(3)采用Chou&Fasman Beta-TurnPrediction进行预测；步骤(4)采用Kolaskar&Tongaonkar Antigenicity进行预测；步骤(5)采用Parker Hydrophilicity Prediction进行预测；步骤(6)采用Bepipred LinearEpitope Prediction 2.0进行预测；步骤(7)采用ABCpred Prediction进行预测。
4.根据权利要求2或3所述的血清淀粉样蛋白A抗原表位的预测与验证方法，其特征在于：所述的第一表位序列为阈值≥1的序列；所述的第二表位序列为阈值≥0.999的序列；所述的第三表位序列为阈值≥1.041的序列；所述的第四表位序列为阈值≥0.976的序列；所述的第五表位序列为阈值≥2.410的序列；所述的第六表位序列为阈值≥0.500的序列；所述的第七表位序列为阈值≥0.51的序列。
5.根据权利要求4所述的血清淀粉样蛋白A抗原表位的预测与验证方法，其特征在于：所述的第二表位序列为得分高的十个表位序列；所述的第三表位序列为得分高的十个表位序列；所述的第五表位序列为得分高的十个表位序列；所述的第七表位序列的长度为16。
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