[发明专利]一种生化试剂盒及其应用方法在审
申请号: | 201811575706.5 | 申请日: | 2018-12-22 |
公开(公告)号: | CN109652861A | 公开(公告)日: | 2019-04-19 |
发明(设计)人: | 罗俊峰;陈苗苗;杨继伟;刘香琼;欧阳虎;陈云弟 | 申请(专利权)人: | 阅尔基因技术(苏州)有限公司 |
主分类号: | C40B50/06 | 分类号: | C40B50/06 |
代理公司: | 北京华仲龙腾专利代理事务所(普通合伙) 11548 | 代理人: | 李静 |
地址: | 215000 江苏省苏州市工业*** | 国省代码: | 江苏;32 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 富集 生化试剂盒 盒体 通用测序引物 核酸外切酶 分子标签 基因区域 基因文库 生化技术 试剂成本 核苷酸 聚合酶 酶制剂 试剂盒 构建 硫代 应用 | ||
本发明适用于生化技术领域,提供了一种生化试剂盒及其应用方法,该试剂盒包括:盒体以及存放于盒体中的试剂;试剂包括:浓度为5~40μM的试剂A,浓度为0.5~10μM的试剂B,浓度为500~50000units/mL的试剂C,浓度为1~10mM的试剂D,浓度为500~50000units/mL的试剂E,浓度为1~100μM的试剂F,浓度为500~50000units/mL的试剂G;和浓度为1~10μM的试剂H;试剂A为Cas12a和/或Cas9;试剂B为sgRNA;试剂C为聚合酶;试剂D为硫代核苷酸;试剂E为核酸外切酶;试剂F为含有分子标签序列的试剂;试剂G为酶制剂;试剂H为含有通用测序引物序列和酶的试剂。利用本发明的试剂对基因区域进行富集并构建基因文库,可较传统富集方式缩短3~5倍的时间,富集区域的局限性小,且操作简便,试剂成本较低。
技术领域
本发明属于生化技术领域,尤其涉及一种生化试剂盒及其应用方法。
背景技术
生物基因组大多数都很复杂且碱基数目巨大,比如人类基因组有30亿个碱基,其中基因区域只占其中的1-2%,研究通常是对这些基因区域进行研究,所以基因区域的富集技术则应运而生。
现有的基因区域富集技术多采用基因杂交捕获的方式,但是,这种杂交捕获技术的杂交时间长达4-24小时,并且仅适用于短基因区域(总长度小于或等于24kb的连续/非连续区域);且在对这些基因区域进行富集时通常需要用到修饰有生物素的探针、杂交反应液和封闭试剂,整个富集的操作过程复杂且成本相对较高。
由此可见,现有的基因富集技术存在杂交时间长、富集区域局限性大、且操作复杂成本高的问题。
发明内容
本发明实施例提供一种生化试剂盒,旨在解决现有的基因富集技术存在杂交时间长、富集区域局限性大、且操作复杂成本高的问题。
本发明实施例是这样实现的,一种生化试剂盒,包括盒体以及存放于所述盒体中的试剂;
所述试剂包括:浓度为5~40μM的试剂A,浓度为0.5~10μM的试剂B,浓度为500~50000units/mL的试剂C,浓度为1~10mM的试剂D,浓度为500~50000units/mL的试剂E,浓度为1~100μM的试剂F,浓度为500~50000units/mL的试剂G;和浓度为1~10μM的试剂H;
所述试剂A为Cas12a和/或Cas9;所述试剂B为sgRNA;所述试剂C为聚合酶;所述试剂D为硫代核苷酸;所述试剂E为核酸外切酶;所述试剂F为含有分子标签序列的试剂;所述试剂G为酶制剂;所述试剂H为含有通用测序引物序列和酶的试剂。
进一步的,所述试剂B为由sgDNA oligos经过转录而成的sgRNA(small guideRNA)混合物。
进一步的,所述试剂C为Klenow Fragment(3'→5'exo-)和/或DNA聚合酶I。
进一步的,所述试剂D为
1-Thio-2'-Deoxyadenosine-5'-Triphosphate,1-Thio-2'-Deoxycytidine-5'-Triphosphate,1-Thio-2'-Deoxyguanosine-5'-Triphosphate,1-Thio-2'-Deoxythymidine-5'-Triphosphate中的其中一种或其任意组合的混合物。
进一步的,所述试剂E为T7核酸外切酶、T5核酸外切酶、RecJf核酸外切酶、核酸外切酶VII、核酸外切酶V、Lambda核酸外切酶、核酸外切酶III、核酸外切酶T或者核酸外切酶I中的一种或者其任意组合的混合物。
进一步的,所述分子标签序列的结构包括碱基数目在5~100个的通用序列区、碱基数目在0-24个的分子标签区和碱基数目在0-16个随机引物区。
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