[发明专利]一种SNP位点分析方法及系统在审
申请号: | 201811583420.1 | 申请日: | 2018-12-24 |
公开(公告)号: | CN109741788A | 公开(公告)日: | 2019-05-10 |
发明(设计)人: | 范绍钦 | 申请(专利权)人: | 广州合众生物科技有限公司 |
主分类号: | G16B20/20 | 分类号: | G16B20/20;G16B30/00 |
代理公司: | 广州一锐专利代理有限公司 44369 | 代理人: | 李新梅 |
地址: | 510000 广东省广州市天河*** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 样本 分析方法及系统 输出结果 序列末端 样本序列 分析 基因型 去除 标注 统计 | ||
1.一种SNP位点分析方法,其特征在于,包括:
获取标准SNP序列;
将标准SNP序列进行标注;
获取样本SNP序列;
将样本SNP序列进行峰图处理,并标记第二峰;
去除样本SNP序列末端的杂峰;
将标准SNP序列与样本SNP序列进行对比;
统计样本序列的基因型并输出结果。
2.根据权利要求1所述的一种SNP位点分析方法,其特征在于,所述的将标准SNP序列进行标注,具体为标注基因型及SNP所在基因序列中的位置。
3.根据权利要求2所述的一种SNP位点分析方法,其特征在于,所述的将标准SNP序列进行标注后,将标准SNP序列以多个文件或镜像存储形式进行存储,形成标准数据库。
4.根据权利要求1所述的一种SNP位点分析方法,其特征在于,所述的去除样本SNP序列末端的杂峰后还包括:
将SNP序列进行拼接。
5.根据权利要求1所述的一种SNP位点分析方法,其特征在于,所述的将标准SNP序列与样本SNP序列进行对比,具体为根据标准SNP序列,在样本SNP序列中显示相对应的位点并用不同颜色标记。
6.根据权利要求7所述的一种SNP位点分析方法,其特征在于,所述的将标准SNP序列与样本SNP序列进行对比,还包括根据标准序列中的一种基因型,显示该基因型相同的样本序列个数和位置。
7.一种SNP位点分析系统,其特征在于包括:
标准序列获取模块:所述标准序列获取模块用于获取标准SNP序列;
标准序列标注模块:所述标准序列标注模块用于将标准SNP序列进行标注;
样本序列获取模块:所述样本序列获取模块用于获取样本SNP序列;
样本序列处理模块:所述样本序列处理模块用于先将样本SNP序列进行峰图处理,并标记第二峰后,再去除样本SNP序列末端的杂峰;
比较模块:所述比较模块用于将标准SNP序列与样本SNP序列进行对比;
统计模块:所述统计模块用于统计样本序列的基因型并输出结果。
8.根据权利要求7所述的一种SNP位点分析系统,其特征在于,还包括:
拼接模块:所述的拼接模块用于将SNP序列进行拼接。
9.一种计算机可读存储介质,其特征在于,所述计算机可读存储介质存储有计算机程序指令,该程序指令适于由处理器加载并执行权利要求1~6任一项所述的方法。
10.一种移动终端,其特征在于,包括处理器以及存储器,所述的处理器用于执行存储器中存储的程序,以实现权利要求1~6任一项所述的方法。
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