[发明专利]一种SNP位点分析方法及系统在审

专利信息
申请号: 201811583420.1 申请日: 2018-12-24
公开(公告)号: CN109741788A 公开(公告)日: 2019-05-10
发明(设计)人: 范绍钦 申请(专利权)人: 广州合众生物科技有限公司
主分类号: G16B20/20 分类号: G16B20/20;G16B30/00
代理公司: 广州一锐专利代理有限公司 44369 代理人: 李新梅
地址: 510000 广东省广州市天河*** 国省代码: 广东;44
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摘要:
搜索关键词: 样本 分析方法及系统 输出结果 序列末端 样本序列 分析 基因型 去除 标注 统计
【权利要求书】:

1.一种SNP位点分析方法,其特征在于,包括:

获取标准SNP序列;

将标准SNP序列进行标注;

获取样本SNP序列;

将样本SNP序列进行峰图处理,并标记第二峰;

去除样本SNP序列末端的杂峰;

将标准SNP序列与样本SNP序列进行对比;

统计样本序列的基因型并输出结果。

2.根据权利要求1所述的一种SNP位点分析方法,其特征在于,所述的将标准SNP序列进行标注,具体为标注基因型及SNP所在基因序列中的位置。

3.根据权利要求2所述的一种SNP位点分析方法,其特征在于,所述的将标准SNP序列进行标注后,将标准SNP序列以多个文件或镜像存储形式进行存储,形成标准数据库。

4.根据权利要求1所述的一种SNP位点分析方法,其特征在于,所述的去除样本SNP序列末端的杂峰后还包括:

将SNP序列进行拼接。

5.根据权利要求1所述的一种SNP位点分析方法,其特征在于,所述的将标准SNP序列与样本SNP序列进行对比,具体为根据标准SNP序列,在样本SNP序列中显示相对应的位点并用不同颜色标记。

6.根据权利要求7所述的一种SNP位点分析方法,其特征在于,所述的将标准SNP序列与样本SNP序列进行对比,还包括根据标准序列中的一种基因型,显示该基因型相同的样本序列个数和位置。

7.一种SNP位点分析系统,其特征在于包括:

标准序列获取模块:所述标准序列获取模块用于获取标准SNP序列;

标准序列标注模块:所述标准序列标注模块用于将标准SNP序列进行标注;

样本序列获取模块:所述样本序列获取模块用于获取样本SNP序列;

样本序列处理模块:所述样本序列处理模块用于先将样本SNP序列进行峰图处理,并标记第二峰后,再去除样本SNP序列末端的杂峰;

比较模块:所述比较模块用于将标准SNP序列与样本SNP序列进行对比;

统计模块:所述统计模块用于统计样本序列的基因型并输出结果。

8.根据权利要求7所述的一种SNP位点分析系统,其特征在于,还包括:

拼接模块:所述的拼接模块用于将SNP序列进行拼接。

9.一种计算机可读存储介质,其特征在于,所述计算机可读存储介质存储有计算机程序指令,该程序指令适于由处理器加载并执行权利要求1~6任一项所述的方法。

10.一种移动终端,其特征在于,包括处理器以及存储器,所述的处理器用于执行存储器中存储的程序,以实现权利要求1~6任一项所述的方法。

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