[发明专利]检测与抗癫痫类药物相关的基因的SNP位点的核苷酸以及检测方法在审
申请号: | 201811654872.4 | 申请日: | 2018-12-30 |
公开(公告)号: | CN109468379A | 公开(公告)日: | 2019-03-15 |
发明(设计)人: | 胡昌明;赵薇薇;严慧;朱阳进;徐艳艳;汤愿笑;甘立佳;于世辉 | 申请(专利权)人: | 广州金域医学检验中心有限公司 |
主分类号: | C12Q1/6883 | 分类号: | C12Q1/6883;C12Q1/6858;C12N15/11 |
代理公司: | 北京超凡志成知识产权代理事务所(普通合伙) 11371 | 代理人: | 李青 |
地址: | 510000 广东省*** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 核苷酸 抗癫痫 检测 引物组合 基因多态性检测 结果判读 相关基因 基因 多态性 无干扰 引物组 种检测 | ||
1.一种检测与抗癫痫类药物相关的基因的SNP位点的核苷酸,其特征在于,其包括引物组合1-引物组合9中的一种或多种的组合;
其中,引物组合1包括:SEQ ID NO.1-2所示的扩增引物和SEQ ID NO.19所示的检测引物;
引物组合2包括:SEQ ID NO.3-4所示的扩增引物和SEQ ID NO.20所示的检测引物;
引物组合3包括:SEQ ID NO.5-6所示的扩增引物和SEQ ID NO.21所示的检测引物;
引物组合4包括:SEQ ID NO.7-8所示的扩增引物和SEQ ID NO.22所示的检测引物;
引物组合5包括:SEQ ID NO.9-10所示的扩增引物和SEQ ID NO.23所示的检测引物;
引物组合6包括:SEQ ID NO.11-12所示的扩增引物和SEQ ID NO.24所示的检测引物;
引物组合7包括:SEQ ID NO.13-14所示的扩增引物和SEQ ID NO.25所示的检测引物;
引物组合8包括:SEQ ID NO.15-16所示的扩增引物和SEQ ID NO.26所示的检测引物;
引物组合9包括:SEQ ID NO.17-18所示的扩增引物和SEQ ID NO.27所示的检测引物。
2.一种与抗癫痫类药物相关的基因的SNP位点的检测方法,其特征在于,其包括如下步骤:
(1)使用权利要求1所述的核苷酸中的扩增引物对样品进行PCR扩增,得到第一扩增产物;
(2)使用权利要求1所述的核苷酸中的检测引物对经碱性磷酸酶处理后的第一扩增产物进行单碱基延伸反应,得到第二扩增产物;
(3)采用飞行时间质谱技术分析所述第二扩增产物的多态性。
3.根据权利要求2所述的检测方法,其特征在于,在步骤(1)中,进行PCR扩增的体系含有:引物组合1-引物组合9的扩增引物。
4.根据权利要求2所述的检测方法,其特征在于,在步骤(1)中,进行PCR扩增的程序的退火温度为:55-57℃。
5.根据权利要求2所述的检测方法,其特征在于,在步骤(1)中,所述扩增引物在体系中的浓度为0.8-1.2μM。
6.根据权利要求2-5任一项所述的检测方法,其特征在于,在步骤(2)中,进行单碱基延伸反应的体系含有:引物组合1-引物组合9的检测引物和第一扩增产物。
7.根据权利要求6所述的检测方法,其特征在于,所述检测引物在单碱基延伸反应的体系中的总浓度为7-9μM。
8.根据权利要求7所述的检测方法,其特征在于,引物组合1-引物组合9的各检测引物在单碱基延伸反应的体系中的浓度分别是:0.582μM、0.742μM、0.836μM、0.843μM、0.857μM、0.882μM、1.000μM、1.017μM以及1.122μM,单碱基延伸反应的体系的体积为9μL。
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