[发明专利]单链结合蛋白在审

专利信息
申请号: 201880011391.3 申请日: 2018-02-23
公开(公告)号: CN110291208A 公开(公告)日: 2019-09-27
发明(设计)人: M·皮埃科德;N·P·威尔森;U·罗斯韦勒 申请(专利权)人: 特罗姆瑟大学-挪威北极圈大学
主分类号: C12Q1/6813 分类号: C12Q1/6813;C12Q1/6832
代理公司: 北京信诺创成知识产权代理有限公司 11728 代理人: 尹吉伟
地址: 挪威特*** 国省代码: 挪威;NO
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摘要:
搜索关键词: 氨基酸序列 钠离子 单链DNA结合蛋白 功能片段 结合蛋白 结合能力 钙离子 钾离子 镁离子 去杂交 单链 杂交 暴露 表现
【权利要求书】:

1.单链DNA结合蛋白(SSB)去杂交DNA分子的用途,所述SSB在500mM钠离子存在下表现出其最大ssDNA结合能力的至少50%,其中所述SSB包含:SEQ ID NO:1的氨基酸序列或与SEQ ID NO:1至少75%相同的氨基酸序列,或其功能片段,并且其中所述DNA分子存在于或暴露于含有以下中一种或多种的溶液中:

(i)至少350mM的钠离子,

(ii)至少50mM的钾离子,

(iii)至少150mM的镁离子,或

(iv)至少200mM的钙离子。

2.单链DNA结合蛋白(SSB)防止互补ssDNA杂交的用途,所述SSB在500mM钠离子存在下表现出其最大ssDNA结合能力的至少50%,其中所述SSB包含:SEQ ID NO:1的氨基酸序列或与SEQ ID NO:1至少75%相同的氨基酸序列,或其功能片段,并且其中所述ssDNA存在于或暴露于含有以下中一种或多种的溶液中:

(i)至少350mM的钠离子,

(ii)至少50mM的钾离子,

(iii)至少150mM的镁离子,或

(iv)至少200mM的钙离子。

3.根据权利要求1或权利要求2所述的用途,其中,所述溶液含有至少500mM、优选至少750mM的钠离子。

4.根据权利要求1至3中任一项所述的用途,其中,所述溶液含有至少100mM、优选至少300mM优选至少600mM的钾离子。

5.根据权利要求1至4中任一项所述的用途,其中,所述溶液含有至少200mM、优选250mM的镁离子。

6.根据权利要求1至5中任一项所述的用途,其中,所述溶液含有至少250mM、优选300mM的镁离子。

7.根据权利要求1至6中任一项所述的用途,其中,所述SSB包含SEQ ID NO:1的氨基酸序列或与其至少90%相同的氨基酸序列。

8.根据权利要求1至7中任一项所述的用途,其中,所述SSB在SEQ ID NO:1的位置17和/或71处掺入取代。

9.根据权利要求8所述的用途,其中,所述取代氨基酸在pH7.0下在其侧链上带有正电荷,优选其中所述取代氨基酸选自赖氨酸和精氨酸。

10.根据权利要求1至9中任一项所述的用途,其中,所述用途在以下方法期间进行:

i)核酸扩增、纯化或测序,优选纳米孔测序;

ii)定点突变;

iii)使用显微镜检查样品中的核酸结构;

iv)限制酶消化;

v)逆转录;

vi)增强T4聚合酶的活性;或

vii)保护ssDNA或RNA免受核酸酶消化。

11.一种单链DNA结合蛋白(SSB),其在500mM钠离子存在下表现出其最大ssDNA结合能力的至少50%,并且包含:SEQ ID NO:1的氨基酸序列或与其至少75%相同的氨基酸序列,或其功能片段,并且其中所述氨基酸在位置17和/或71处已被取代。

12.根据权利要求18所述的SSB,其包含SEQ ID NO:2的氨基酸序列。

13.一种核酸分子,其编码根据权利要求11或12中限定的SSB。

14.一种表达载体,其含有根据权利要求13所限定的核酸分子。

15.一种宿主细胞或病毒,其包含根据权利要求14所要求的表达载体。

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