[发明专利]整体性检测单个细胞的非破坏性测量信息和基因组相关信息的方法有效
申请号: | 201880029173.2 | 申请日: | 2018-05-02 |
公开(公告)号: | CN110678558B | 公开(公告)日: | 2023-06-02 |
发明(设计)人: | 谷内江望;太田祯生 | 申请(专利权)人: | 国立大学法人东京大学 |
主分类号: | C12Q1/6844 | 分类号: | C12Q1/6844;C12M1/00;C12N15/09 |
代理公司: | 北京市金杜律师事务所 11256 | 代理人: | 杨宏军;唐峥 |
地址: | 日本*** | 国省代码: | 暂无信息 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 整体性 检测 单个 细胞 破坏性 测量 信息 基因组 相关 方法 | ||
1.整体性检测单个细胞的非破坏性测量信息和基因组相关信息的方法,所述方法包括下述工序:
准备多个隔室,每1个隔室包含单个细胞或来源于其的物质、第一微珠、和第二微珠,
其中,第一微珠是各自以可切割的方式连接于与各成像信息对应的第一条形码核酸的粒子,或者是各自含有与各成像信息对应的第一条形码核酸的生物,
并且,各隔室中的第一微珠的成像信息可彼此区分,
所述第二微珠与多条第二条形码核酸连接,所述第二条形码核酸能和与细胞基因组或其表达产物对应的基因组相关核酸或者第一条形码核酸杂交;
在准备各隔室前或在各隔室中,对单个细胞的非破坏性测量信息和第一微珠的成像信息一同进行检测,将单个细胞的非破坏性测量信息与第一微珠的成像信息进行关联;
自所述关联的第一微珠切割第一条形码核酸,使所述基因组相关核酸及第一条形码核酸分别与第二条形码核酸杂交而得到杂交复合物;
制造来源于所述杂交复合物的扩增产物;
以所述扩增产物的表达模式作为指标,整体性检测单个细胞的非破坏性测量信息和基因组相关信息,
其中,以来源于第一条形码核酸与第二条形码核酸形成的杂交复合物的第一扩增产物的表达模式作为指标来检测单个细胞的非破坏性测量信息,
以来源于所述基因组相关核酸与第二条形码核酸形成的杂交复合物的第二扩增产物的表达模式作为指标来检测单个细胞的基因组相关信息。
2.如权利要求1所述的方法,其具有(a)~(c)中的至少任一个特征:
(a)每1个隔室的第一微珠的数量为多个,
(b)每1个隔室的第二微珠的数量为1个,
(c)所述隔室为孔、液滴或凝胶粒子的形态。
3.如权利要求1或2所述的方法,其中,所述基因组相关核酸为所述单个细胞基因组DNA、来源于所述单个细胞基因组的RNA或其cDNA、或者对在所述单个细胞中表达的蛋白质具有特异性的核酸探针。
4.如权利要求1或2所述的方法,其中,所述非破坏性测量信息为基于选自颜色、荧光、大小、形状、电磁波、透过、相位、散射、反射、相干拉曼、拉曼及吸收光谱中的至少1种测定信息的非破坏性测量信息。
5.如权利要求或2所述的方法,其中,第一微珠的第一条形码核酸各自包含在与相同的成像信息对应的第一微珠中共通的第一共通条形码区、和能与第二条形码核酸杂交的第一杂交区。
6.如权利要求1或2所述的方法,其中,第一共通条形码区的序列信息为确定单个细胞的非破坏性测量信息的指标。
7.如权利要求1或2所述的方法,其中,与所述第二微珠连接的多条第二条形码核酸各自包含彼此共通的第二共通条形码区、可彼此区分的第二固有条形码区、和能与基因组相关核酸或第一条形码核酸杂交的第二杂交区。
8.如权利要求7所述的方法,其中,所述第二共通条形码区的序列信息为确定存在于隔室中的单个细胞或来源于其的物质的指标。
9.如权利要求7所述的方法,其中,所述第二固有条形码区的序列信息为确定基因组相关核酸的指标。
10.如权利要求1或2所述的方法,其中,第二条形码核酸还包含PCR引物区。
11.如权利要求7所述的方法,其中,第二杂交区是包含与所述第一杂交区或所述基因组相关核酸互补的核酸而成的。
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