[发明专利]生物样本核酸质量的测定方法

说明书

本发明涉及一种生物样本核酸质量的测定方法，具体来说，涉及一种使用能扩增靶向基因的引物进行定量聚合酶链反应(PCR)来测定生物样本DNA质量的方法，本发明还公开了一种制备该方法所用引物的方法，以及一种利用所测定的DNA质量来标准化所检测到的靶向基因突变量的方法。本发明的方法能够对用于基因分析的生物样本的NDA质量进行客观评价，并能将客观结果呈现于基因突变的表达率，从而为临床研究和伴随诊疗领域提供可靠的信息。

技术领域

本申请主张2017年4月4日申请的大韩民国专利申请第10-2017-0043918号的优先权，所述说明书的全部内容作为本申请的参考文献。

本发明涉及一种生物样本核酸质量的测定方法，具体来说，涉及一种能扩增内部质量对照位点(internal quality control region)的引物；或通过一组引物和探针进行PCR(聚合酶链式反应,polymerase chain reaction)来测定生物样本核酸质量的方法以及所述方法中使用的引物；或应用一组引物和探针的制备方法和所述经测定的核酸质量来标准化靶向基因突变比率的一种方法。

背景技术

临床医生在针对某一疾病选择最合理的治疗方案之前，分析该疾病分子特征的做法越来越普遍。在临床上与合理且精确的伴随诊断(Companion diagnostics,CDx)共同为患者提供最佳的治疗，最大限度地提高疗效。

2011年7月，美国食品和药物管理局(FDA)发布了将伴随诊断(CDx)用作指导如何选择和使用合理疗法(体外辅助诊断设备-工业和FDA工作人员指南，美国FDA，2014)。根据这一定义，CDx分析成为了一种提供安全且有效使用治疗药物所需信息的非常重要的体外诊断手段。FDA还明确了CDX分析所需的三个区域：[a]筛选特定治疗药物预期最有效的患者区域，[B]筛选用特定治疗药物治疗结果为产生副作用的可能性较大的患者区域，[C]通过监测治疗反应和调整治疗方案(例如：药物剂量、治疗时间等)提高药物的安全性和有效性的区域。

伴随诊断的目的是通过深入了解分子生理机制和药物作用机制，应用特定分子的特性获取所需的治疗效果。

另一方面，通过伴随诊断调整定制的特定药物及剂量的情况下，需要一种在短时间内可进行十分可靠和精确的分析方法。这时，要考虑的重要因素包括分析方法的标准化、试剂和方法的验证、经验证的实验室经验和病理学家的参与等。然而，最近用来验证标准肿瘤板的突变状态而进行的生物样本质量验证的研究表明，尽管使用相同或相似的方法，在不同的实验室中也可能获得不同的研究结果。

进行遗传分析的机构不同，则其具体的分析条件也会不同，不仅如此，分析目标样品的状态和质量的差异也会影响分析结果，而为了使这些变数最小化，因此对样本的质量进行量化和标准化分析变得越来越重要。

发明内容

技术课题

因此，本发明的发明人客观地评价从个体获得的生物样本中提取的基因的状态，努力研发一种能够确保基因分析结果可靠性的方法，结果研发出能够特异性扩增满足预定条件的任意的内部质量对照位点(internal quality control region)的一种PCR引物；或利用一组引物和探针的能客观评价生物样本核酸质量的方法，从而完成了本发明。