[发明专利]用于提高碱基编辑精度的融合蛋白在审
| 申请号： | 201880056915.0 | 申请日： | 2018-08-28 |
| 公开（公告）号： | CN111065647A | 公开（公告）日： | 2020-04-24 |
| 发明（设计）人： | 陈佳;黄行许;杨力;杨贝;李潇飒;王滢;刘亚京 | 申请（专利权）人： | 上海科技大学 |
| 主分类号： | C07K14/32 | 分类号： | C07K14/32;C12N9/22;C12N15/113 |
| 代理公司： | 上海弼兴律师事务所 31283 | 代理人： | 薛琦 |
| 地址： | 201210 上海市浦东*** | 国省代码： | 上海;31 |
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| 摘要： | |||
| 搜索关键词： | 用于 提高 碱基 编辑 精度 融合 蛋白 | ||
1.一种融合蛋白，其包含第一片段和第二片段，所述第一片段包含胞苷脱氨酶，所述第二片段包含无催化活性的毛螺旋菌(Lachnospiraceae bacterium)Cpf1(dLbCpf1)。
2.如权利要求1所述的融合蛋白，其特征在于，所述胞苷脱氨酶为载脂蛋白B mRNA编辑酶催化多肽样(APOBEC)蛋白。
3.如权利要求2所述的融合蛋白，其特征在于，所述APOBEC蛋白选自由APOBEC1、APOBEC2、APOBEC3A、APOBEC3B、APOBEC3C、APOBEC3D、APOBEC3F、APOBEC3G、APOBEC3H、APOBEC4和活化诱导的(胞苷)脱氨酶组成的群组。
4.如权利要求3所述的融合蛋白，其特征在于，所述APOBEC蛋白是APOBEC1。
5.如权利要求4所述的融合蛋白，其特征在于，所述APOBEC1蛋白包含突变W90Y或R126E，或其组合。
6.如权利要求3所述的融合蛋白，其特征在于，所述APOBEC蛋白是APOBEC3A。
7.如权利要求1-6中任一项所述的融合蛋白，其进一步包含一个或多个尿嘧啶DNA糖基化酶抑制剂(UGI)。
8.如权利要求7所述的融合蛋白，其包含至少两个UGI。
9.如权利要求8所述的融合蛋白，其特征在于，至少一个UGI通过蛋白酶切割位点与所述第一片段和所述第二片段分开。
10.如权利要求9所述的融合蛋白，其特征在于，所述蛋白酶切割位点为自剪切肽。
11.如权利要求1-10中任一项所述的融合蛋白，其进一步包含一个或多个核定位序列(NLS)。
12.如权利要求11所述的融合蛋白，其特征在于，至少一个iNLS位于所述第二片段和第一UGI之间。
13.如权利要求11所述的融合蛋白，其特征在于，至少两个iNLS位于所述第二片段和第一UGI之间。
14.如权利要求11-13中任一项所述的融合蛋白，其特征在于，至少一个NLS位于所述第一片段和所述第二片段的N末端。
15.如权利要求11-14中任一项所述的融合蛋白，其特征在于，至少一个NLS位于所述第一片段和所述第二片段的C末端。
16.如权利要求1所述的融合蛋白，从N末端到C末端，其包含：第一NLS、所述第一片段、所述第二片段、第二NLS、第一UGI、第三NLS、自剪切肽和第二UGI。
17.如权利要求16所述的融合蛋白，其进一步包含第四NLS，所述第四NLS在所述第二片段和所述第一UGI之间。
18.如权利要求17所述的融合蛋白，其进一步包含第二自剪切肽和第三UGI，所述第二自剪切肽位于所述第二UGI的N末端。
19.一种编辑样品核酸序列上的胞嘧啶的方法，其包括使所述样品与合适的指导RNA和如权利要求1-18中任一项所述的融合蛋白或编码所述融合蛋白的多核苷酸接触。
20.如权利要求19所述的方法，其特征在于，所述胞嘧啶位于所述核酸序列上从前间区序列邻近基序(PAM)序列3’端计的第6位和第22位核苷酸之间。
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