[发明专利]用于高通量测序的快速文库构建在审

专利信息
申请号: 201880058442.8 申请日: 2018-07-17
公开(公告)号: CN111133135A 公开(公告)日: 2020-05-08
发明(设计)人: J·邓纳姆 申请(专利权)人: 希昆斯生物科学公司
主分类号: C40B50/06 分类号: C40B50/06;C12N9/22;C12N15/10;C12Q1/6806;C12Q1/6869;C40B70/00;C40B80/00
代理公司: 广州嘉权专利商标事务所有限公司 44205 代理人: 黄琳娟
地址: 美国加利*** 国省代码: 暂无信息
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摘要:
搜索关键词: 用于 通量 快速 文库 构建
【权利要求书】:

1.制备高通量测序文库的方法,其包含以下步骤:

A.从多个多核苷酸中产生双链片段;

B.使片段的末端绽裂以暴露单链区域;

C.使寡核苷酸探针与单链区域杂交以形成双链双链体,其中探针包含可切割的:

(1)5'化学活性基团;

(2)3'化学活性基团;或

(3)5'和3'化学活性基团;以及

其中所述探针的长度至少等于绽裂片段的暴露的单链区域;

D.使所述双链双链体与至少一种切割剂接触以切割化学活性基团,以在双链双链体中产生单链3'悬突、单链5'悬突,或单链3'和5悬突;以及

E.将至少两组双链DNA接头连接至所述双链双链体,其中

(1)第一组接头中的接头包括以下中的至少一种:

i.与双链双链体的3'单链悬突的悬突末端互补的3'悬突,如果存在的话;或者

ii.与双链双链体的5'单链悬突的悬突末端互补的5'悬突,如果存在的话,

(2)第二组接头中的接头包括以下中的至少一种:

i.与双链双链体的3'单链悬突的悬突末端互补的3'悬突,如果存在的话;

ii.与双链双链体的5'单链悬突的悬突末端互补的5'悬突,如果存在的话,或者

iii.连接到双链双链体的平末端的平末端,如果存在的话。

2.根据权利要求1所述的制备高通量测序文库的方法,其中:所述探针包含5'化学活性基团;

所述至少一种切割剂切割5'化学活性基团;

所述第一组接头中的接头包含与双链双链体的3'单链悬突的悬突末端互补的3'悬突;

所述第二组接头包含连接至双链双链体的平末端的平末端。

3.根据权利要求1所述的制备高通量测序文库的方法,其中:所述探针包含3'化学活性基团;

所述至少一种切割剂切割3'化学活性基团;

所述第一组接头中的接头包含与双链双链体的所述5'单链悬突的悬突末端互补的5'悬突;

所述第二组接头包含连接至双链双链体的平末端的平末端。

4.根据权利要求1所述的制备高通量测序文库的方法,其中:所述探针包含3'和5'化学活性基团;

至少一种切割剂切割3'化学活性基团,并且至少一种切割剂切割5'化学活性基团;

所述第一组接头中的接头包含与双链双链体的5'单链悬突的悬突末端互补的5'悬突;

所述第二组接头包含与双链双链体的3'单链悬突的悬突末端互补的3'悬突。

5.根据权利要求1所述的方法,其中双链多核苷酸片段是随机产生的。

6.根据权利要求5所述的方法,其中双链多核苷酸片段是酶促产生的。

7.根据权利要求5所述的方法,其中双链多核苷酸片段是通过超声破碎产生的。

8.根据权利要求5所述的方法,其中双链多核苷酸片段的长度为50-1000个碱基对(bp)。

9.根据权利要求8所述的方法,其中双链多核苷酸片段的长度为100-800bp。

10.根据权利要求1所述的方法,其中绽裂片段的暴露的单链区域的长度为6-12个核苷酸。

11.根据权利要求1所述的方法,其中所述寡核苷酸探针包含:脱氧核苷酸(dNTP);dNTP/三磷酸核糖核苷酸(rNTP)杂交体;肽核酸(PNA);锁核酸(LNA);异鸟苷(isoG);异胞嘧啶(isoC);或它们的任意组合。

12.根据权利要求1或11所述的方法,其中所述寡核苷酸探针还包含硫代磷酸酯键。

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