[发明专利]炎性肠病生物标志物的方法和用途

权利要求书

1.预测具有炎性肠病(IBD)的受试者中的治疗应答的方法，所述方法包括：

检测选自组A或组B的一种或多种生物标志物，其中组A由以下组成：PAI-1/SERPINE、TNC、IL13RA2、CCL2、PRNP、GPX8、DRAM1、STAT4、IL24、IL6、PI15、PTGS2、SELE、SMR3A、SLC23A2、HDGFRP3、HIF1A、IKBIP和KLHL5；且其中组B由以下组成：PRNP、IL13RA2、GPX8、IKBIP、KLHL5、PTX3、TXNDC15、PDE4B、C1S、TLR1、MME、TSPAN2、TNFRSF11B、ACSL4、CSGALNACT2、DRAM1、SGTB、PDPN、RBMS1、ANGPT2、TMEM55A、HGF、STAT4、RGS5、ROBO1、TOR1AIP1、CCL18、HS3ST3B1、SDC2、PXDN、DSE、SNX10、TNC、CLIC2、PPT1、RGS18和THEMIS2。

2.权利要求1的方法，其中所述受试者：

(i)如果符合以下条件，则被预测为对抗TNFα治疗应答：

相对于参考值的PAI-1/SERPINE log2表达值小于约6.5，

相对于参考值的TNC log2表达值小于约6.3，

相对于参考值的IL13RA2 log2表达值小于约5.5，

相对于参考值的CCL2 log2表达值小于约7.5，

相对于参考值的PRNP log2表达值小于约7.75，

相对于参考值的GPX8 log2表达值小于约5.5，

相对于参考值的DRAM1 log2表达值小于约7.5，

相对于参考值的STAT4 log2表达值小于约6.45，

相对于参考值的IKBIP log2表达值小于约4.65，或

相对于参考值的KLHL5 log2表达值小于约5.25；或

(ii)如果符合以下条件，则被预测为对抗TNFα治疗不应答：

相对于参考值的PAI-1/SERPINE log2表达值大于约6.5，

相对于参考值的TNC log2表达值大于约6.3，

相对于参考值的IL13RA2 log2表达值大于约5.5，

相对于参考值的CCL2 log2表达值大于约7.5，

相对于参考值的PRNP log2表达值大于约7.75，

相对于参考值的GPX8 log2表达值大于约5.5，

相对于参考值的DRAM1 log2表达值大于约7.5，

相对于参考值的STAT4 log2表达值大于约6.45，

相对于参考值的IKBIP log2表达值大于约4.65，或

相对于参考值的KLHL5 log2表达值大于约5.25。

3.权利要求2的方法，其中如果所述受试者被预测为对抗TNFα治疗应答，则将用抗TNFα疗法治疗所述受试者，或者其中如果所述受试者被预测为对抗TNFα治疗不应答，则将用PAI-1抑制剂治疗所述受试者。

4.前述权利要求中任一项的方法，其中如果所述受试者具有大于或等于约5.777的IL13RA2 log2表达值和大于或等于约7.706的GPX8 log2表达值，则所述受试者被预测为对抗TNFα治疗不应答。

5.检测PAI-1的方法，其包括：

(i)从受试者获得生物样品；

(ii)检测所述样品中的PAI-1的水平；

(iii)当PAI-1相对于参考值上调时，诊断所述受试者具有IBD；如果每个高倍视野的PAI-1阳性细胞的数目为约25或更大，则诊断所述受试者具有活动性溃疡性结肠炎；或如果相对于参考值的PAI log2表达值高于4.5，则诊断所述受试者具有IBD；

(iv)如果PAI-1水平具有约7.5或更小的相对于参考值的log2表达值，则将有效量的抗TNF或抗α4β7抗体(例如，抗TNFα(英夫利昔单抗)和抗α4β7(维多珠单抗))施用于诊断的受试者；或

(v)如果PAI-1水平具有约9.5或更大的相对于参考值的log2表达值，则施用有效量的PAI-1抑制剂(例如，CDE-268)。