[发明专利]HLA组织匹配及用于其的方法在审
申请号: | 201880066387.7 | 申请日: | 2018-09-05 |
公开(公告)号: | CN111213210A | 公开(公告)日: | 2020-05-29 |
发明(设计)人: | 派翠克·松吉翁 | 申请(专利权)人: | 河谷控股IP有限责任公司 |
主分类号: | G16B25/00 | 分类号: | G16B25/00;G16B30/00;G16B20/00 |
代理公司: | 北京柏杉松知识产权代理事务所(普通合伙) 11413 | 代理人: | 王春伟;刘继富 |
地址: | 美国加利*** | 国省代码: | 暂无信息 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | hla 组织 匹配 用于 方法 | ||
1.一种匹配供体组织与受体组织的方法,其包括:
获得多个供体组织样品的组学数据,其中每个供体组织样品是脐带血或骨髓样品;
使用计算机算法根据组学数据确定每个供体组织样品的HLA分型;
生成供体登记档,其存储多个供体组织样品的相应HLA分型;和
在所述供体登记档中将供体组织样品中的一个鉴定为相容于具有匹配的HLA分型的受体。
2.根据权利要求1所述的方法,其中所述组学数据是外显子组测序数据、全基因组测序数据和/或RNA测序数据。
3.根据权利要求1所述的方法,其中,所述HLA分型被确定至至少四位深度。
4.根据权利要求1所述的方法,其中所述计算机算法使用德布鲁因图和包含至少一种已知的HLA分型的多个等位基因的参考序列。
5.根据权利要求4所述的方法,其中所述参考序列包含至少一种HLA分型的等位基因,所述等位基因具有至少1%的等位基因频率。
6.根据权利要求4所述的方法,其中所述参考序列包含至少一种HLA分型的至少十种不同的等位基因。
7.根据权利要求4所述的方法,其中所述参考序列包含至少两种不同的HLA分型的等位基因。
8.根据权利要求1所述的方法,其中所述HLA分型为HLA-A分型、HLA-B分型、HLA-C分型、HLA-DRB-1分型和HLA-DQB-1分型中的至少三种。
9.根据权利要求1所述的方法,其中通过血清分型来确定所述匹配的HLA分型。
10.根据权利要求1所述的方法,其中所述供体样品是脐带血。
11.一种匹配供体组织与受体组织的方法,其包括:
获得多个移植受体的组学数据,其中每个移植受体是针对实体器官的受体;
使用计算机算法根据组学数据确定每个移植受体的HLA分型;
生成受体登记档,其存储多个移植受体的相应HLA分型;和
在所述受体登记档中将受体中的一个鉴定为相容于具有匹配的HLA分型的供体器官。
12.根据权利要求11所述的方法,其中所述组学数据是外显子组测序数据、全基因组测序数据和/或RNA测序数据。
13.根据权利要求11所述的方法,其中所述HLA分型被确定至至少四位深度。
14.根据权利要求11所述的方法,其中所述计算机算法使用德布鲁因图和参考序列。
15.根据权利要求14所述的方法,其中所述参考序列包含至少一种HLA分型的等位基因,所述等位基因具有至少1%的等位基因频率。
16.根据权利要求14所述的方法,其中所述参考序列包含至少一种HLA分型的至少十种不同的等位基因。
17.根据权利要求14所述的方法,其中所述参考序列包含至少两种不同的HLA分型的等位基因。
18.根据权利要求11所述的方法,其中所述HLA分型为HLA-A分型、HLA-B分型、HLA-C分型、HLA-DRB-1分型或HLA-DQB-1分型。
19.根据权利要求11所述的方法,其中所述HLA分型为HLA-A分型、HLA-B分型、HLA-C分型、HLA-DRB-1分型和HLA-DQB-1分型中的至少三种。
20.根据权利要求11所述的方法,其中所述供体器官是肺、肝、心脏或皮肤。
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