[发明专利]扩增淋巴细胞的方法

说明书

本发明涉及通过在一种或多种包含抗原的肽的存在下和/或在呈递抗原的抗原呈递细胞的存在下培养来自受试者的包含淋巴细胞的样品或衍生自该样品的淋巴细胞来扩增抗原特异性淋巴细胞的方法。还公开了这种方法在改善个性化免疫疗法(例如肿瘤免疫疗法)中的用途。

相关申请的交叉引用

本申请要求2017年11月6日提交的美国临时申请序列号62/582,163的优先权，其全部内容通过引用合并于此。

技术领域

本发明涉及通过在包含抗原的一种或多种肽的存在下和/或在抗原呈递细胞呈递抗原的存在下培养来自受试者的包含淋巴细胞的样品或培养源自该样品的淋巴细胞来扩增抗原特异性淋巴细胞的方法。还公开了这种方法在改善个性化免疫疗法中的用途。

背景

免疫原性肿瘤可以受益于不同的免疫治疗干预。其中，自体肿瘤浸润性淋巴细胞(tumor-infiltrating lymphocytes，TILs)的过继细胞转移(adoptive cell transfer，ACT)可有效介导肿瘤消退。

最近的技术进步加速了针对非同义的体细胞肿瘤突变产生的所谓肿瘤新抗原的T细胞特异性的鉴定。新抗原是免疫治疗的理想潜在靶标，不仅因为它们具有高度的肿瘤特异性，而且因为胸腺不会反选择高亲和力和/或亲和力的新抗原特异性T细胞^2-4。不仅新抗原被证明是成功的免疫检查点阻断疗法的关键介体^5-7，而且它们也已成功用于ACT^8,9。最后，几个小组提供了由新抗原特异性T细胞介导的肿瘤消退的直接证据。确实，Tran及其同事通过上皮癌中的新抗原反应性CD4+T细胞的ACT首次证明了后者。最近，Sahin和Ott证实了黑色素瘤患者接受个性化新抗原疫苗接种(分别基于mRNA¹¹和肽¹²)与免疫检查点阻断的完全反应^11,12。

当前用于扩增TIL的方案通常涉及两个主要的扩增过程。最初的TIL培养涉及在富含白介素2(IL-2)的培养基中孵育肿瘤样品，以获得最初的大量TIL。然后，在该初始阶段期间获得的TIL通常经历快速扩增方案(rapid amplification protocol，“REP”)。REP过程将TIL的最终数量增加到10⁹-10¹¹的数量级。

尽管常规的TIL扩增已经为癌症患者提供了良好的服务，但是本领域中需要优化TIL培养过程以使新抗原特异性T细胞克隆的回收最大化或富集新抗原特异性TIL。本文公开的发明满足了该需求，并且还适用于肿瘤特异性新抗原以外的其他抗原。

发明概述

在本领域中非常需要改善个性化免疫疗法。本发明通过提供一种通过在一种或多种包含抗原的肽存在的情况下培养来自受试者的样品来富集抗原特异性淋巴细胞的方法,满足了这一和其他需求，其中所述样品包含淋巴细胞或衍生自淋巴细胞的淋巴细胞。

一方面，本发明提供了一种离体富集和扩增新抗原特异性淋巴细胞的方法，该方法包括在一种或多种肽存在下培养得自受试者的样品或衍生自其的淋巴细胞，其中每种所述肽包含不同的抗原。

在本发明的方法中可以使用任何数量的肽。优选地，不同肽的数目应使得对MHC分子的竞争最小化，以避免对某些T细胞克隆型的次佳刺激。在一些实施方案中，该方法涉及在两种或更多种肽的存在下培养，其中每种所述肽包含不同的肿瘤特异性新抗原。在一些实施方案中，该方法包括在1-300种肽存在下培养，其中每种所述肽包含不同的肿瘤特异性新抗原。在一些实施方案中，该方法包括在1-100种肽存在下培养，其中每种所述肽包含不同的肿瘤特异性新抗原。在一些实施方案中，该方法包括在20-50种肽存在下培养，其中每种所述肽包含不同的肿瘤特异性新抗原。