[发明专利]一种基于计算机的骨髓白细胞自动标记方法及系统在审
申请号: | 201910031626.1 | 申请日: | 2019-01-14 |
公开(公告)号: | CN109754398A | 公开(公告)日: | 2019-05-14 |
发明(设计)人: | 庞宝川;陈哲;柳家胜;刘娟 | 申请(专利权)人: | 武汉兰丁医学高科技有限公司 |
主分类号: | G06T7/00 | 分类号: | G06T7/00;G06K9/62 |
代理公司: | 武汉维盾知识产权代理事务所(普通合伙) 42244 | 代理人: | 彭永念 |
地址: | 430073 湖北省武汉市洪山区东湖新技术开*** | 国省代码: | 湖北;42 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 骨髓白细胞 计算机 病理医生 病理诊断 自动标记 多图层 细胞 读取 文本信息文件 自动标记系统 计算机标记 可视化界面 白细胞 标记系统 分类模型 分类识别 汇总统计 快速精准 数据来源 图层图像 细胞图像 可视化 玻片 预设 阅片 数字化 诊断 | ||
1.种基于计算机的骨髓白细胞自动标记方法,其特征在于,所述包括如下步骤:
步骤一、读取细胞文本信息文件,根据(x,y,R)确定细胞图像CellImag;
步骤二、将细胞图像CellImage输入预设的分类模型,得到该细胞属于骨髓不同白细胞的概率表,将概率最大的对应标签类和其概率值存储在按照(x,y,R,label,Probablity)组织的文本结构信息中;
步骤三、骨髓白细胞类别图层图像生成,根据预设分类模型的label标签生成属于该类别的特定颜色ColorLabel,将同一个类别的所有细胞在其对应(x,y,R)位置处用颜色ColorLabel用圆形进行标记,生成类别图层图像LabelLayerImage;
步骤四、汇总统计label相对应的细胞数目及所有细胞数目,生成不同类别骨髓白细胞的占比信息,数值可视化且进行柱状图可视化,将不在正常比例范围类别的细胞信息用红色方框进行标记。
2.根据权利要求1所述的基于计算机的骨髓白细胞自动标记方法,其特征在于:所述步骤二中预设的分类模型对细胞进行分类可包含不同骨髓白细胞种类的模型,模型网络结构及白细胞种类可以根据需求做出相应改变。
3.一种基于计算机的骨髓白细胞自动标记系统,其特殊在于,所述系统包括玻片数字化模块、数字化图像切块模块、细胞图像定位识别模块、玻片细胞信息汇总分析模块及可视化模块:
所述玻片数字化模块:通过扫描仪以扫描倍率ScanPlan得到每一个实际病人的病理切片的数字化图像DigitalImage,数字化图像以扫描特定格式存储;
所述数字化图像切块模块:通过读取数字化图像DigitalImage,将数字化图像DigitalImage切分成2048*2048的小块Blocks方便计算机后续进行并行处理提高效率;
所述细胞图像定位识别模块:将Blocks输入待处理队列,计算机每一次从待处理队列自动读取ProperNum个图像数据通过骨髓白细胞的细胞自动定位分割方法快速识别骨髓白细胞,并将识别的骨髓白细胞输入到训练好的相应神经网络模型中得到其对应类别信息及其概率,并将相关信息按照(x,y,R,label,Probablity)存储到CellsPosition信息结构文本中;
所述玻片细胞信息汇总分析模块:读取CellsPosition信息结构文本,根据其中(x,y,R,label,Probablity)汇总统计label相对应的细胞数目及所有细胞数目,生成不同类别骨髓白细胞的占比信息;
所述可视化模块:根据玻片细胞信息汇总分析模块结果进行数值可视化且进行柱状图可视化,将不在正常比例范围类别的细胞信息用红色方框进行标记;同时将类别图层图像LabelLayerImage和原始数字化图像DigitalImage进行复合,根据选择可以查看单一类别骨髓白细胞标记图像或者是多类别骨髓白细胞标记图像。
4.根据权利要求3所述的基于计算机的骨髓白细胞自动标记系统,其特征在于:所述玻片数字化模块中ScanPlan常见倍率为物镜100倍。
5.根据权利要求3所述的基于计算机的骨髓白细胞自动标记系统,其特征在于:所述细胞图像定位识别模块中ProperNum的取值和权利要求2中的预设的分类模型复杂度有关。
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