[发明专利]一种基于计算机的骨髓白细胞自动标记方法及系统

说明书

本发明公开了一种基于计算机的骨髓白细胞自动标记方法，包括读取细胞文本信息文件；将细胞图像CellImage输入预设的分类模型；骨髓白细胞类别图层图像生成；汇总统计label相对应的细胞数目及所有细胞数目等，本发明还公开一种基于计算机的骨髓白细胞自动标记系统。本发明可以完成玻片从数字化到分类识别以及多图层可视化等多种功能，既可以解决电子阅片数据来源问题，也可以最大程度的实现骨髓白细胞标记系统的意义，让病理医生依赖于计算机完成相关病理诊断工作，计算机标记出来的不同种类的白细胞多图层可视化界面也可以满足病理医生诊断过程中不同的需求，辅助其快速精准完成病理诊断。

技术领域

图1为本发明基于计算机的骨髓白细胞自动标记方法的流程图；

图2为本发明基于计算机的骨髓白细胞自动标记系统的模块示意图。

具体实施方式

下面将结合本发明实施例中的附图，对本发明实施例中的技术方案进行清楚、完整地描述，显然，所描述的实施例仅仅是本发明一部分实施例，而不是全部的实施例。基于本发明中的实施例，本领域普通技术人员在没有做出创造性劳动前提下所获得的所有其它实施例，都属于本发明保护的范围。

请参阅图1-2，具体实施方式一：本发明提供如下技术方案：一种基于计算机的骨髓白细胞自动标记方法，包括如下步骤：

步骤一、读取细胞文本信息文件，根据(x,y,R)确定细胞图像CellImag；

步骤二、将细胞图像CellImage输入预设的分类模型，得到该细胞属于骨髓不同白细胞的概率表，将概率最大的对应标签类和其概率值存储在按照(x,y,R,label,Probablity)组织的文本结构信息中；

步骤三、骨髓白细胞类别图层图像生成，根据预设分类模型的label标签生成属于该类别的特定颜色ColorLabel，将同一个类别的所有细胞在其对应(x,y,R)位置处用颜色ColorLabel用圆形进行标记，生成类别图层图像LabelLayerImage；

步骤四、汇总统计label相对应的细胞数目及所有细胞数目，生成不同类别骨髓白细胞的占比信息，数值可视化且进行柱状图可视化，将不在正常比例范围类别的细胞信息用红色方框进行标记。

所述的步骤二中预设的分类模型对细胞进行分类可包含不同骨髓白细胞种类的模型，模型网络结构及白细胞种类可以根据需求做出相应改变。其中，步骤二中预设的分类模型的网络结构使用的是InceptionV3进行迁移学习，对应的分类标签包括：粒细胞、淋巴细胞、单核细胞、红细胞、嗜酸性粒细胞、嗜碱性粒细胞、浆细胞。预设分类模型的训练集中包括粒细胞：12000、淋巴细胞：10000、单核细胞：2000、红细胞：6004、嗜酸性粒细胞：2014、嗜碱性粒细胞：300、浆细胞：702。数据增强方法包括：镜像、[0,45,90,135,180]旋转、平移。通过数据增强使得每一类别的图像数量均增，在训练过程中使用在线增强方法：镜像、0-360°旋转、平移、噪声防止训练过拟合。保留验证集效果最好的模型作为预设分类模型。

一种基于计算机的骨髓白细胞自动标记系统，该系统包括玻片数字化模块、数字化图像切块模块、细胞图像定位识别模块、玻片细胞信息汇总分析模块及可视化模块：

所述的玻片数字化模块：通过扫描仪以扫描倍率ScanPlan得到每一个实际病人的病理切片的数字化图像DigitalImage，数字化图像以扫描特定格式存储；同时，玻片数字化模块中ScanPlan常见倍率为物镜100倍。

所述的数字化图像切块模块：通过读取数字化图像DigitalImage，将数字化图像DigitalImage切分成2048*2048的小块Blocks方便计算机后续进行并行处理提高效率；