[发明专利]DUSP3基因甲基化检测试剂在制备结直肠癌预后诊断试剂中的应用有效
申请号: | 201910045812.0 | 申请日: | 2019-01-17 |
公开(公告)号: | CN111440866B | 公开(公告)日: | 2023-08-11 |
发明(设计)人: | 禹汇川;骆衍新;白亮亮;唐冠楠;王小琳;黄品助;黄安培;李英杰;黄美近;王磊;汪建平 | 申请(专利权)人: | 中山大学附属第六医院;中山大学 |
主分类号: | C12Q1/6886 | 分类号: | C12Q1/6886;C12N15/11 |
代理公司: | 北京市万慧达律师事务所 11111 | 代理人: | 谢敏楠 |
地址: | 510000 广东*** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | dusp3 基因 甲基化 检测 试剂 制备 直肠癌 预后 诊断 中的 应用 | ||
1.基因检测试剂在制备结直肠癌预后诊断试剂中的应用,所述基因为DUSP3基因,所述的DUSP3基因检测试剂为DUSP3基因甲基化的检测试剂,所述的DUSP3基因甲基化的检测试剂的检测区域的序列为SEQ ID NO:1,所述的DUSP3基因甲基化的检测试剂的检测位点为cg16747321,所述的结直肠癌为I-II期结直肠癌。
2.基因检测试剂在制备结直肠癌预后诊断试剂盒中的应用,所述基因为DUSP3基因,所述的DUSP3基因检测试剂为DUSP3基因甲基化的检测试剂,所述的DUSP3基因甲基化的检测试剂的检测区域的序列为SEQ ID NO:1,所述的DUSP3基因甲基化的检测试剂的检测位点为cg16747321,所述的结直肠癌为I-II期结直肠癌。
3.根据权利要求1或2所述的应用,其特征在于,所述基因还包含TLE4基因、KAZN基因中的一种或两种。
4.根据权利要求1或2所述的应用,其特征在于,所述基因还包括TLE4基因。
5.根据权利要求1或2所述的应用,其特征在于,所述的DUSP3基因甲基化的检测试剂为检测DUSP3基因经转化试剂修饰后的序列的试剂。
6.根据权利要求5所述的应用,其特征在于,所述的转化试剂选自肼盐、重亚硫酸氢盐和亚硫酸氢盐中的一种或几种。
7.根据权利要求5所述的应用,其特征在于,所述的转化试剂选自亚硫酸氢盐。
8.根据权利要求1或2所述的应用,其特征在于,所述的DUSP3基因检测试剂含有DNA芯片。
9.根据权利要求1或2所述的应用,其特征在于,所述DUSP3基因甲基化的检测中,甲基化程度高,则结直肠癌复发风险高;当甲基化程度低,则结直肠癌复发风险低,所述甲基化程度的阈值取值为78.57%。
10.根据权利要求1或2所述的应用,其特征在于,所述的检测样品为肠粘膜组织。
11.一种结直肠癌预后诊断系统,其特征在于,所述的诊断系统含有:
检测构件:所述的检测构件用以检测诊断对象的DUSP3基因甲基化程度;
结果判断构件:所述的结果判断构件用于根据检测构件所检测的DUSP3基因甲基化程度的结果,输出甲基化百分比参数PMR或疾病风险结果;所述的检测构件为超微量分光光度计、实时荧光定量PCR仪、超高灵敏度化学发光成像系统中的一种或几种;所述DUSP3基因甲基化程度为样品中DUSP3基因体区域CG位点的甲基化比例,所述CG位点为cg16747321;所述的结果判断构件含有输入模块、分析模块和输出模块;输入模块用于输入DUSP3基因甲基化程度;分析模块用于根据DUSP3基因甲基化程度,分析出治愈后的结直肠癌复发的可能性或者风险值;输出模块用于输出分析模块的分析结果;所述的结果判断构件中,当DUSP3基因甲基化程度高于阈值78.57%时,则判断治愈后的结直肠癌复发的风险高;当DUSP3基因甲基化程度低于阈值78.57%时,则判断治愈后的结直肠癌复发的风险低;所述的结直肠癌为I-II期结直肠癌。
12.根据权利要求11所述的诊断系统,其特征在于,所述的甲基化百分比参数PMR为甲基化/(甲基化+非甲基化)×100。
13.根据权利要求11所述的诊断系统,其特征在于,所述的甲基化百分比参数PMR=甲基化荧光值/(甲基化荧光值+非甲基化荧光值)×100。
14.根据权利要求11所述的诊断系统,其特征在于,所述的甲基化百分比参数PMR=100/(1+1/2-ΔCT),ΔCT=CT甲基化荧光–CT非甲基化荧光。
15.根据权利要求11所述的诊断系统,其特征在于,所述的样品为肠粘膜组织。
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