[发明专利]一种用于检测犬支原体的实时荧光定量PCR方法在审

专利信息
申请号: 201910051367.9 申请日: 2019-01-16
公开(公告)号: CN109777880A 公开(公告)日: 2019-05-21
发明(设计)人: 彭秀丽;尹勋;王文靖;阳汶龙 申请(专利权)人: 彭秀丽;尹勋;王文靖;阳汶龙
主分类号: C12Q1/689 分类号: C12Q1/689;C12Q1/04;C12Q1/686;C12N15/11;C12R1/35
代理公司: 暂无信息 代理人: 暂无信息
地址: 430070 湖北省武*** 国省代码: 湖北;42
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摘要:
搜索关键词: 支原体 实时荧光定量PCR 特异引物 灵敏度 检测 生物技术领域 唾液酸酶基因 重组标准质粒 保守区序列 倍比稀释 变异系数 分离培养 交叉反应 目的片段 特异扩增 线性关系 早期诊断 支原体病 重要意义 常规PCR 病原体 假阳性 检出限 拷贝数 血清学 种检测 构建 拷贝 可用 扩增 重复
【说明书】:

发明提供了一种检测犬支原体的特异引物及实时荧光定量PCR检测方法,属于生物技术领域。本发明根据Genebank公布的犬支原体唾液酸酶基因保守区序列设计特异引物,扩增目的片段,将其连接到pMD‑18T载体,构建重组标准质粒,将其进行10倍倍比稀释,Ct值与拷贝数之间呈良好的线性关系,相关系数为0.9947。该方法灵敏度高,最低检出限为1.85×104拷贝/μL,比普通PCR检测灵敏度提高100倍;特异性好,对常见的3种支原体以及犬常见病原体均无特异扩增曲线;重复稳定性好,组间及组内变异系数均小于0.5%。该方法克服了传统分离培养鉴定时间长、血清学方法易产生交叉反应及常规PCR假阳性的缺陷,可用于犬支原体的早期诊断和检测,对犬支原体病的防控具有重要意义。

技术领域

本发明涉及一种犬病原菌的检测方法,具体涉及一种犬支原体实时荧光定量PCR检测方法,属于生物技术领域。

背景技术

随着人们生活水平的提高,越来越多的人开始养宠物。据狗民网发布的《2017年中国宠物行业白皮书》,其中宠物犬约占61.74%,约1.5亿只。一只宠物犬一年花费约6000元,宠物医疗约占总费用的30%。

支原体属于细菌界、厚壁菌门、柔膜菌纲、支原体目、支原体科、支原体属的一类缺乏细胞壁、能够独立生存的已知的最小原核微生物。支原体可以感染许多动物,包括犬、禽、猪、反刍动物、人以及爬虫类动物等。支原体的基因组极小,细胞能够自我复制,约0.3-0.8μm,生长需依赖环境中的养分。

犬支原体主要引起犬呼吸道疾病、泌尿生殖道疾病、贫血症、关节炎及结肠炎等。支原体常与其他细菌或病毒混合或继发感染,并加重疾病症状,如不及时治疗会引起病原扩散以及其他组织器官的损伤。研究表明,犬支原体在生殖道感染的检出率雄性犬30%-50%,雌性犬23%-75%,支原体给宠物犬及肉犬养殖业造成巨大的影响,对于长期食用狗肉的人存在潜在危害,所以能够早期诊断犬是否感染支原体尤为重要。

支原体检测方法主要包括分离培养、血清学方法及常规PCR方法等。检测犬支原体最可靠的依据方法是从样本中分离到支原体,但犬支原体的分离耗时、敏感性差,对营养要求极为苛刻,体外培养生长缓慢,耗时较长,容易被其他病原微生物污染,所以传统的分离培养法不能满足临床诊断的需要。血清学检测方法与其他支原体之间存在交叉反应,给犬支原体的鉴别诊断带来了困难。常规PCR检测技术灵敏度不高,容易受到环境的污染,且无法实时监测PCR过程。目前,国内犬支原体相关的研究尚属空白,急需建立一种快速、准确和灵敏度高的检测方法。随着现代分子生物学技术的快速发展,实时荧光定量PCR检测技术填补了以上方法的缺陷,具有灵敏度高,特异性好,样品消耗少,且可以实时直观地检测PCR扩增过程,使它成为应用于检测微生物的有效方法。

鉴于此,本发明拟建立一种快速、敏感及准确定量的方法检测犬支原体,为犬支原体的流行病学调查及疫情预警提供技术支持,对我国养犬业的健康发展及公共卫生安全具有重要意义。

发明内容

本发明针对现有技术的缺陷,目的在于提供一种检测犬支原体的特异引物及实时荧光定量PCR检测方法。

为实现上述发明目的,本发明所采取的技术方案为:

1.引物设计:根据GeneBank上公布的犬支原体的唾液酸酶基因保守区序列设计特异引物,其核苷酸序列如下:

上游引物:5′-AAATCGAACTCGAGGACAACAAT-3′,

下游引物:5′-AGCATCAAAAACAACTTCCTTGC-3′。

2.实时荧光定量PCR扩增反应体系为:

实时荧光定量反应条件为:94℃预变性5min,95℃变性15s,58℃褪火30s,72℃延伸15s,39个循环,最后72℃延伸7min。

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