[发明专利]一种基于PDL1/PDL2超增强子的免疫检测点抑制剂的应用有效
申请号: | 201910057576.4 | 申请日: | 2019-01-22 |
公开(公告)号: | CN109666723B | 公开(公告)日: | 2022-04-15 |
发明(设计)人: | 范义辉;徐元培;吴英成;毛仁芳 | 申请(专利权)人: | 南通大学 |
主分类号: | C12Q1/6851 | 分类号: | C12Q1/6851;G01N33/68 |
代理公司: | 北京科家知识产权代理事务所(普通合伙) 11427 | 代理人: | 徐思波 |
地址: | 226019 *** | 国省代码: | 江苏;32 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 基于 pdl1 pdl2 增强 免疫 检测 抑制剂 应用 | ||
1.一种PDL1/PDL2超增强子PDL1L2-SE在调控PDL1和PDL2表达中的非治疗目的应用,其特征在于,通过PDL1/PDL2超增强子的切除,抑制细胞表面PDL1、PDL2的表达,其中所述PDL1/PDL2超增强子PDL1L2-SE的DNA序列为hg19_dna range=chr9:5498729-5502895;
包括如下过程:
PDL1/PDL2超增强子的切除过程
首先通过数据库分析,发现在PDL1与PDL2之间一段DNA序列hg19_dna range=chr9:5498729-5502895高度乙酰化,并将该段DNA序列命名为PDL1L2-SE,于是在DNA序列:hg19_dna range=chr9:5498729-5502895的上下游分别设计两个sgRNA:sgRNA-1、sgRNA-2,构建了两个新的Crispr/Cas9质粒;
(1-1)构建sgRNA-CRISPR质粒
(1-1-1)
1、酶切载体
2、琼脂糖凝胶电泳;
3、切胶回收;
(1-1-2)sgRNA引物退火
(1-1-3)连接
(1-2)构建稳转细胞系
(1-2-1)种板:转染前一天在六孔板里铺设SUM159细胞,细胞密度保持在30%-50%左右;
(1-2-2)转染:
1、1ug sgRNA-1和1ug sgRNA-2CRISPR/Cas9质粒同时加入50ul Opti-mem无血清转染培养基中,同样地,1ug sgVector质粒加入50ul Opti-mem无血清转染培养基中;
2、2ul Lipo2000加入50ul Opti-mem无血清转染培养基中;
3、室温放置5min后,稀释的质粒与Lipo2000混匀放置20min后均匀滴加至六孔板内;
(1-2-3)药筛:转染48h后,加入浓度为2ug/ml的puromycin,连续加药,直至所剩细胞都带有GFP+荧光,停药换成完全培养基继续培养细胞;
(2)PDL1/PDL2超增强子切除后的验证过程
(2-1)Genotyping:
(2-1-1)提取DNA:收集细胞,胰酶消化离心后,加入50ul buffer L和1ul Proteaseplus,55℃30min,95℃5min;
(2-1-2)PCR Amplification:
(2-1-3)琼脂糖凝胶电泳,显影观察条带位置;
(2-2)测序:将条带所在位置凝胶切下,收集在ep管中,附带上游引物,送由基因测序公司进行基因测序;
(3)PDL1/PDL2超增强子切除后,PDL1和PDL2低表达的验证过程
基因水平上,通过实时定量PCR实验:分别提取sgVector和sgPDL1L2-SE的稳转细胞的RNA,检测PDL1和PDL2的表达,发现sgPDL1L2-SE组的PDL1和PDL2的拷贝数较sgVector组明显降低;
蛋白水平上,通过Western blot实验:分别提取sgVector和sgPDL1L2-SE的稳转细胞的蛋白,检测PDL1的蛋白表达量,发现sgPDL1L2-SE组的PDL1蛋白丰度较sgVector组明显降低。
2.根据权利要求1所述的应用,其特征在于,所述Western blot实验包括如下步骤:
收集细胞,用适当RIPA裂解液裂解细胞提取蛋白,通过BCA试剂盒测定蛋白浓度;
电泳:配置12%的SDS-PAGE凝胶,保持样品蛋白上样量相同,进行上样电泳;
转膜:在电流300mA的条件下转膜60min,使蛋白转移到PVDF膜上;
封闭:加入5%的脱脂牛奶,在摇床上封闭60min;
一抗孵育:PDL1单克隆抗体,PDL2单克隆抗体或GAPDH单克隆抗体均以1:1000的比例稀释,4℃孵育过夜;
二抗孵育:一抗回收洗涤后,根据一抗来源,选择二抗,按照1:2000的比例稀释,室温孵育2h;
显影:二抗洗涤干净后,使用ECL试剂盒,按照说明进行显影检测蛋白。
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