[发明专利]非洲猪流感病毒DNA连接酶的晶体及其制备方法和应用在审

专利信息
申请号: 201910060493.0 申请日: 2019-01-22
公开(公告)号: CN109810955A 公开(公告)日: 2019-05-28
发明(设计)人: 甘建华;李继喜;陈屹勍 申请(专利权)人: 复旦大学
主分类号: C12N9/00 分类号: C12N9/00;G16C20/50
代理公司: 上海正旦专利代理有限公司 31200 代理人: 陆飞;陆尤
地址: 200433 *** 国省代码: 上海;31
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摘要:
搜索关键词: 制备方法和应用 猪流感病毒 亮氨酸 非洲猪瘟病毒 生物技术领域 高度可溶性 表达菌株 催化反应 蛋白分子 谷氨酰胺 晶体结构 三维结构 天冬酰胺 药物筛选 药物设计 不对称 分辨率 折叠 氨基酸 底物 构象 人源
【权利要求书】:

1. 一种非洲猪流感病毒DNA连接酶AsfvLIG的晶体,其特征在于,参数为:

晶体空间群:P21

晶胞参数:a=72.257 Å,b=55.159 Å,c=79.875 Å,α=γ=90°,β=103.15°。

2.根据权利要求1所述的晶体,其特征在于,晶体三维结构中,一个晶体学不对称单位中有一个蛋白分子,由9个α螺旋以及17个β折叠组成。

3.根据权利要求2所述的晶体,其特征在于,所述的晶体三维结构具体组成如下:α螺旋1,即含有Asn3-Gln4,β折叠1,即含有Gln8-Ser10,β折叠2,即含有Ile13-Cys15,β折叠3,即含有Ile19-Thr23,β折叠4,即含有Gly26-Val38,:α螺旋2,即含有Asp48-Ser52,β折叠5,即含有Val59-Val68,β折叠6,即含有Thr79-Val81,α螺旋3,即含有Val95-Ala111,β折叠6,即含有Ile147-Lys151,β折叠6,即含有Ile155-Lys170,α螺旋4,即含有Asp181-Phe191,β折叠7,即含有Tyr199-Tyr205,α螺旋5,即含有Leu211-Asn219,β折叠8,即含有His228-Phe235,α螺旋6,即含有Ser244-Gln257,β折叠9,即含有Ile266-Gln269,α螺旋7,即含有Val275-Glu288,β折叠10,即含有Glu291-Arg296,β折叠11,即含有Leu314-Leu317,β折叠12,即含有Leu321-Gln332,β折叠13,即含有Ile342-Leu348,β折叠14,即含有Lys351-Lys359,α螺旋8,即含有Tyr363-Lys372,α螺旋9,即含有Pro375-Leu382,β折叠15,即含有Gly384-Ser395,β折叠16,即含有Gly399-Leu402,β折叠17,即含有Arg405-Phe409。

4.根据权利要求1-3之一所述的晶体,其特征在于,所述的DNA连接酶AsfvLIG的氨基酸序列如SEQIDNO:1所示。

5.一种如权利要求1-4之一所述的非洲猪流感病毒DNA连接酶AsfvLIG的晶体的制备方法,具体步骤为:

(1)将预先制备好的高纯度AsfvLIG蛋白浓缩至0.4-0.6mM, 并加入等体积的对应的浓度为0.4-0.6mM的DNA底物,所述DNA底物含有三条DNA链,其序列分别为SEQIDNO.2、SEQIDNO.3、SEQIDNO.4;

(2)使用商业化结晶试剂盒作为晶体生长的初筛条件,用座滴气象扩散法进行结晶,通过优化调整,最终在0.05-0.5M的醋酸铵,pH为4-6、浓度为0.1-0.3M 的BIS-TRIS,5-18%的分子量为100-10000的PEG分子条件下,得到衍射分辨率高的晶体。

6.根据权利要求5所述的制备方法,其特征在于,步骤(1)中所述非洲猪流感病毒DNA连接酶AsfvLIG的蛋白纯度在90%以上。

7.如权利要求1所述的非洲猪流感病毒DNA连接酶AsfvLIG的晶体结构在药物设计、制备或药物筛选中的用途。

8. 根据权利要求7所述的用途,其特征在于, AsfvLIG 的NTD结构域以及催化位点:N153、L211、L402、Q403附近的口袋都是AsfvLIG特异性的,作为理想的药物设计靶点,用于设计针对非洲猪瘟病毒的小分子药物与筛选大分子抗体。

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