[发明专利]幽门螺杆菌检测体系及检测试剂盒和应用在审
申请号: | 201910069881.5 | 申请日: | 2019-01-24 |
公开(公告)号: | CN109797203A | 公开(公告)日: | 2019-05-24 |
发明(设计)人: | 王军一;肖雯;尚慧捷;闫楠;闫蕾;赵达聪 | 申请(专利权)人: | 杭州和壹基因科技有限公司 |
主分类号: | C12Q1/6844 | 分类号: | C12Q1/6844;C12Q1/689;C12Q1/04;C12N15/11;C12R1/01 |
代理公司: | 杭州中成专利事务所有限公司 33212 | 代理人: | 朱莹莹 |
地址: | 310051 浙江省杭州*** | 国省代码: | 浙江;33 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 幽门螺杆菌检测 抗生素耐药性 幽门螺杆菌 分型 检测试剂 试剂盒 应用 复合扩增体系 生物技术领域 扩增体系 检测 无创 | ||
1.幽门螺杆菌检测体系,包括以下4种扩增体系的一种或多种的组合:
1)对菌种鉴定基因16S rRNA和23S rRNA进行检测的引物及探针的幽门螺杆菌鉴定复合扩增体系;其中,引物为:
16S rRNA引物:
16-F:GAGAAGCAATACTGCGAAGTGGAG
16-R:GCGATTCCAGCTTCATGCA
23S rRNA引物:
23-F:TTCAGTGAAATTGTAGTGGAGGTG
23-R:TCCCATTAGCAGTGCTAAGTTGTA
探针为:
16S-P:X-CTCAGTTCGGATTGTAGGCTGCAAC-(MGB)
23S-P:X-CAAGACGGAAAGACC-(MGB);
2)对菌株分型基因CagA进行检测的引物及探针的幽门螺杆菌分型鉴定扩增体系;
其中,引物为:
CagA-F:AGCAGGTAAAGGAGTGGGCG
CagA-R:TTTGCCTCATCAAAATCAATTGTAG
探针为:
CagA-P:X-GCTAGCCCTGAACCCATTTACGCTAC-(MGB);
3)包括对菌株克拉霉素耐药基因23S rRNA的2个突变位点进行检测的引物及探针的幽门螺杆菌克拉霉素耐药性突变检测复合扩增体系;
其中,引物为:
23-F:TTCAGTGAAATTGTAGTGGAGGTG
23-R:TCCCATTAGCAGTGCTAAGTTGTA
探针为:
23S-P2142m:X-CAAGACGGgAAGACC-(MGB)
23S-P2143m:X-CAAGACGGAgAGACC-(MGB);
4)包括对菌株左氧氟沙星耐药基因gyrA的3个突变位点进行检测的引物及探针的幽门螺杆菌左氧氟沙星耐药性突变检测复合扩增体系;
其中,引物为:
gyrA-F:ATCGTGGGTGATGTGATTGGT
gyrA-R:CATAGAAAAATCTTGCGCCATTC
体系中涉及的探针为:
gyrA-P261m:X-ATGGCGACACRGCAGT-(MGB)
gyrA-P271m:X-CAGTTTATWATGCGTTAGTG-(MGB)
gyrA-P272m:X-CAGTTTATGGTGCGTTAGTG-(MGB)
gyrA-P271+272m:X-CAGTTTATAGTGCGTTAGTG-(MGB)
X为5’端连接的荧光物质,为FAM、NED、VIC、Cy5、Cy3或ROX。
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