[发明专利]普雷沃菌属在鉴别和/或区分不同民族个体中的应用有效
| 申请号： | 201910112179.2 | 申请日： | 2019-02-13 |
| 公开（公告）号： | CN109913524B | 公开（公告）日： | 2021-05-04 |
| 发明（设计）人： | 何昆仑;刘继轩;赵晓静;高晓健;贾志龙;张泽宇;姜辉源;朱雨;刘镕珲 | 申请（专利权）人： | 中国人民解放军总医院 |
| 主分类号： | C12Q1/06 | 分类号： | C12Q1/06;C12Q1/689;C12R1/01 |
| 代理公司： | 北京领科知识产权代理事务所(特殊普通合伙) 11690 | 代理人： | 张丹 |
| 地址： | 100039*** | 国省代码： | 北京;11 |
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| 摘要： | |||
| 搜索关键词： | 普雷沃菌属 鉴别 区分 不同 民族 个体 中的 应用 | ||
1.一种微生物标志物在鉴别和/或区分高原上的藏族和高原上的汉族个体中的应用，所述的微生物标志物为普雷沃菌属，所述的普雷沃菌属包括产黑色素普雷沃菌、中间普雷沃菌、人体普雷沃菌、栖牙普雷沃菌、洛氏普雷沃菌、变黑普雷沃菌、谭氏普雷沃菌、苍白普雷沃菌、颊普雷沃茵、口腔普雷沃菌、二路普雷沃菌、解糖胨普雷沃菌和齿龈普雷沃菌，所述的高原为海拔3500m以上，其中，将普雷沃菌属的相对丰度与阈值比较，所述的阈值为1.43×10-1，当个体的粪便或肠道内容物中的普雷沃菌属的相对丰度大于1.43×10-1，则该个体为高原上的藏族个体，当个体的粪便或肠道内容物中的普雷沃菌属的相对丰度小于1.43×10-1，则该个体为高原上的汉族个体，所述的相对丰度用“普雷沃菌属OTU（OperationalTaxonomic Unit）值”/“检测样本检测到的所有菌属OTU值”表示。
2.一种鉴别和/或区分个体为高原上的藏族或高原上的汉族个体的方法，所述的方法的步骤包括：
(1)确定所述的个体的粪便或肠道内容物中的普雷沃菌属的相对丰度，其中，所述的普雷沃菌属包括产黑色素普雷沃菌、中间普雷沃菌、人体普雷沃菌、栖牙普雷沃菌、洛氏普雷沃菌、变黑普雷沃菌、谭氏普雷沃菌、苍白普雷沃菌、颊普雷沃茵、口腔普雷沃菌、二路普雷沃菌、解糖胨普雷沃菌和齿龈普雷沃菌；
(2)将普雷沃菌属的相对丰度与阈值比较，所述的阈值为1.43×10-1，当个体的粪便或肠道内容物中的普雷沃菌属的相对丰度大于1.43×10-1，则该个体为高原上的藏族个体，当个体的粪便或肠道内容物中的普雷沃菌属的相对丰度小于1.43×10-1，则该个体为高原上的汉族个体；
其中，所述的高原为海拔3500m以上，所述的相对丰度用“普雷沃菌属OTU（OperationalTaxonomic Unit）值”/“检测样本检测到的所有菌属OTU值”表示。
3.根据权利要求2所述的鉴别和/或区分个体为高原上的藏族个体或高原上的汉族个体的方法，其特征在于，所述的步骤(1)中包括：
1)收集待检测个体的粪便或肠道内容物，并提取粪便或肠道内容物中微生物的DNA；
2)目的片段的扩增；
3)测序；
4)计算普雷沃菌属的相对丰度。
4.检测微生物标志物相对丰度的产品在鉴别和/或区分高原上的藏族和高原上的汉族个体中的应用，所述的微生物标志物为普雷沃菌属，所述的普雷沃菌属包括产黑色素普雷沃菌、中间普雷沃菌、人体普雷沃菌、栖牙普雷沃菌、洛氏普雷沃菌、变黑普雷沃菌、谭氏普雷沃菌、苍白普雷沃菌、颊普雷沃茵、口腔普雷沃菌、二路普雷沃菌、解糖胨普雷沃菌和齿龈普雷沃菌，所述的高原为海拔3500m以上，其中，将普雷沃菌属的相对丰度与阈值比较，所述的阈值为1.43×10-1，当个体的粪便或肠道内容物中的普雷沃菌属的相对丰度大于1.43×10-1，则该个体为高原上的藏族个体，当个体的粪便或肠道内容物中的普雷沃菌属的相对丰度小于1.43×10-1，则该个体为高原上的汉族个体，所述的相对丰度用“普雷沃菌属OTU（Operational Taxonomic Unit）值”/“检测样本检测到的所有菌属OTU值”表示。
5.根据权利要求4所述的检测微生物标志物相对丰度的产品在鉴别和/或区分高原上的藏族和高原上的汉族个体中的应用，其特征在于，所述的检测微生物标志物相对丰度的产品包括用于检测微生物标志物相对丰度的试剂、仪器或装置。
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