[发明专利]普雷沃菌属在鉴别和/或区分不同民族个体中的应用

说明书

本发明提供一种微生物标志物在鉴别和/或区分不同民族个体中的应用，所述的微生物标志物为普雷沃菌属。

技术领域

本发明属于生物鉴别和/或区分领域，具体涉及普雷沃菌属在鉴别和/或区分不同民族个体中的应用。

背景技术

人体肠道中存在大量的共生菌群，其数量超过 1000万亿个，大约是人体细胞总数的 10 倍。同时肠道内微生物基因的数量约为 300 万个，大约是人类基因组基因数量的100 多倍，如此海量的基因能够帮助微生物适应多变的环境，形成了与人体密不可分的共生关系。不同遗传背景和生活习惯的居民其肠道菌群组成存在较大差异，例如拟杆菌属是西方居民肠道中相对含量最多且个体间差异最大的细菌属，韩国居民是栖粪杆菌属。目前我国不同民族肠道菌群结构差异对比的研究数据尚不足。

普雷沃菌属属细菌拟杆菌门，厌氧，既往发现为机会致病菌。

专利CN107002021A中公开了一种类风湿性关节炎的生物标记物及其应用，该现有技术公开了Prevotella copri CB7等微生物用于预测受试者与微生物群有关的疾病。

专利CN107075588A中公开了一种用于微生物组来源的诊断和治疗的方法及系统，该现有技术公开了Prevotella菌属用于诊断为克罗恩病的表征。

郭壮在博士学位论文《应用焦磷酸测序技术对不同人群肠道微生物群落结构的研究》中研究表明生活方式及基因型对人肠道菌群构成有显著的影响作用，同时，研究表明，汉族和藏族居民其特有OUTs主要为劳特氏菌（Blautia）和普氏菌属（Prevotella）细菌。

现有技术中并没有公开普雷沃菌属在鉴别和/或区分人群民族中的应用。

发明内容

第一方面，本发明提供一种微生物标志物在鉴别和/或区分高原上的藏族和汉族个体中的应用，所述的微生物标志物为普雷沃菌属。

所述的普雷沃菌属包括产黑色素普雷沃菌、中间普雷沃菌、人体普雷沃菌、栖牙普雷沃菌、洛氏普雷沃菌、变黑普雷沃菌、谭氏普雷沃菌、苍白普雷沃菌、颊普雷沃茵、口腔普雷沃菌、二路普雷沃菌、解糖胨普雷沃菌、齿龈普雷沃菌。

所述的高原为海拔2000m以上，具有低压、缺氧的条件。

进一步优选的，所述的高原环境为海拔2700m以上，具有低压、缺氧的条件下。

在本发明的一个具体实施方式中，所述的高原环境为海拔3500m以上，具有低压、缺氧的条件下。

在本发明的一个具体实施方式中，所述的高原环境为海拔5500m以上，具有低压、缺氧的条件下。

第二方面，本发明提供一种鉴别和/或区分高原上的藏族和汉族个体的方法，所述的方法的步骤包括：

（1）确定所述的个体的粪便或肠道内容物中的微生物标志物的丰度；

（2）将微生物标志物的丰度值与阈值比较，得知个体的民族。

优选的，所述的步骤（1）中利用测序法测定微生物标志物的丰度。

更优选的，所述的步骤（1）中包括：

1）收集待检测个体的粪便或肠道内容物，并提取粪便或肠道内容物中微生物的DNA；

2）目的片段的扩增；

3）测序；

4）计算微生物标志物的丰度。

所述的步骤1）中粪便或肠道内容物中微生物的DNA的提取方法选自：CTAB法、GITC法或利用商业化的试剂盒进行。

优选的，利用CTAB法提取粪便或肠道内容物中微生物的DNA。