[发明专利]一种同时检测3种人畜共患病病原菌的多重IMS-荧光RPA检测方法在审
申请号: | 201910130087.7 | 申请日: | 2019-02-21 |
公开(公告)号: | CN109609604A | 公开(公告)日: | 2019-04-12 |
发明(设计)人: | 李轲;禹建鹰;张淑霞;徐超;连素梅;郭会清 | 申请(专利权)人: | 郭会清 |
主分类号: | C12Q1/6844 | 分类号: | C12Q1/6844;C12Q1/6804;C12Q1/689;C12Q1/10;C12Q1/04;C12R1/42;C12R1/19;C12R1/01 |
代理公司: | 郑州博派知识产权代理事务所(特殊普通合伙) 41137 | 代理人: | 荣永辉 |
地址: | 450000 河南省郑*** | 国省代码: | 河南;41 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 病原菌 荧光 人畜共患病 检测 引物 免疫磁珠分离 结果判定 免疫磁珠 模板提取 探针设计 荧光信号 敏感度 探针 制备 基层 | ||
1.一种同时检测3种人畜共患病病原菌的多重IMS-荧光RPA检测方法,其特征在于,包括以下步骤:
步骤一、引物与探针设计:
选择沙门氏菌fimY位点、大肠杆菌O157:H7 Mannosyltransferase位点、布氏杆菌Omp31位点为靶基设计引物和探针;
步骤二、免疫磁珠的制备:
取0.1mL磁珠液于盛有1.0mL PBST缓冲液的离心管中,混匀,3000r/min离心2min,弃液体;重复上述步骤清洗3次,加入1.0mL PBST缓冲液使磁珠重悬其中;向上述重悬液中加入0.1mL沙门氏菌属免疫血清,放摇床,室温轻缓旋转振荡3h;用1.0mL 1×洗液清洗5次后,加入0.5mL重悬液,于4℃保存备用;重复以上操作制备大肠杆菌O157:H7和布氏杆菌免疫磁珠液;
步骤三、免疫磁珠分离:
无菌操作取20g检样至装有200mL蛋白胨水的带滤网无菌均质袋内,轻缓振荡30min;过滤检样上清液转移于离心管,5000r/min离心20min,弃上清液体,沉淀重悬于1.0mL PBST缓冲液中;取全部检样悬液于装有0.1mL免疫磁珠悬液的小管中,室温轻缓旋转振荡30min;小心移出管中液体,加入1.0mL洗液混匀,3min后移出洗液,重复清洗5次,加入0.5mL重悬液使吸附目标菌的磁珠重悬其中;带有目标菌的磁珠重悬液可直接用于细菌基因组DNA提取;
步骤四、模板提取:
取步骤二所得全部带有目标菌的磁珠重悬液10000r/min离心1min,弃上清;按细菌基因组DNA提取试剂盒提供的操作手册提取DNA;得到的核酸用NanoDrop 1000分光光度计测定其浓度和纯度;
步骤五、三重荧光RPA:
三重荧光RPA的反应体系为50μL,包括Rehydration Buffer 29.5μL,ddH2O 3.3μL,Primer F(10μM)、Primer R(10μM)各1.5μL,Twist Ampn exon Probe(10μM)0.5μL,基因组DNA各1μL,最后加入MgAc(280mM)2.5μL;向含有冻干酶粉的0.2mL TwistAmp Exo RPA反应管中依次加入上述反应体系各成分,充分混匀后2000r/min离心10sec,将反应试管放在RPA荧光定量PCR仪7500Fast中进行实时荧光扩增,37℃恒温反应40min;
步骤六、结果判定:
RPA反应设置三个荧光通道(FAM、HEX、cy5),反应过程实时收集荧光,反应结束后能收集到荧光信号,并有明显扩增曲线,方可判定为阳性。
2.根据权利要求1所述的一种同时检测3种人畜共患病病原菌的多重IMS-荧光RPA检测方法,其特征在于,步骤一中所设计的引物和探针序列如表1所示:
表1多重荧光RPA扩增用特异引物及探针序列
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