[发明专利]与小麦抗条锈病基因QYr.sicau-1B-1连锁的SNP分子标记与应用有效

专利信息
申请号: 201910134070.9 申请日: 2019-02-22
公开(公告)号: CN109706263B 公开(公告)日: 2022-04-05
发明(设计)人: 马建;兰秀锦;秦娜娜;郑有良;魏育明;江千涛;陈国跃;刘亚西 申请(专利权)人: 四川农业大学
主分类号: C12Q1/6895 分类号: C12Q1/6895;C12Q1/6851;C12N15/11
代理公司: 北京路浩知识产权代理有限公司 11002 代理人: 王文君;陈征
地址: 625014 四*** 国省代码: 四川;51
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摘要:
搜索关键词: 小麦 条锈病 基因 qyr sicau 连锁 snp 分子 标记 应用
【说明书】:

发明属于分子育种技术领域,提供了与小麦抗条锈病基因QYr.sicau‑1B.1连锁的SNP分子标记及应用,所述SNP分子标记为KASP‑Yr,其可通过核苷酸序列如SEQ ID NO.1~3所示的引物扩增得到。检测分析表明,该分子标记能准确跟踪所述小麦抗条锈病QTL QYr.sicau‑1B.1,预测小麦的抗条锈病特性,进而方便进行分子设计育种。本发明还公开了一种鉴定小麦抗条锈病QTL QYr.sicau‑1B.1的分子标记的方法,利用本发明所提供的方法能够加强抗条锈病预测的准确性,以便快速筛选出具有增加抗条锈病的小麦品种或品系用于育种,可大大加快小麦高产量品种的选育进程。

技术领域

本发明分子生物学及作物遗传育种领域,特别是涉及与小麦抗条锈病性状相关的分子标记,具体地,涉及小麦抗条锈病基因 QYr.sicau-1B-1连锁的SNP分子标记、扩增其的引物对以及该分子标记的应用。

背景技术

小麦是我国重要的粮食作物,常年种植面积在2000万公顷以上,约占粮食作物面积的27%;总产量为1亿吨以上,约占粮食作物产量的22%。小麦条锈病是我国小麦生产中一种重要的病害,当受到条锈菌的侵害时,小麦叶片会出现黄色的坏死斑,并且会产生黄色的夏孢子,这些孢子到后期就会变为黑色;条锈菌会造成叶片褪绿,无法进行光合作用,从而减产,严重时甚至会造成颗粒无收。一直以来国内外许多研究都在致力于新的抗性小麦品种的研究,其抗性基因的挖掘对选育和推广抗病品种具有重要的作用。

小麦品系‘20828’在西南生态区近10余年一直对国内条锈病流行生理小种表现为近免疫抗性,其还具有小穗数多、株高适中和株型紧凑等特点,是育种首选亲本。

单核苷酸多态性(Single Nucleotide Polymorphism,SNP)指的是基因组内DNA某一特定核苷酸位置上存在转换、颠换、插入、缺失等变化而引起的DNA序列多态性。其技术是利用己知序列信息来比对寻找SNP位点,再利用发掘的变异位点设计特异性的引物来对基因组DNA或cDNA进行PCR扩增,得到基于SNP位点的特定的多态性产物,最后利用电泳技术分析产物的多态性。SNP标记的优点是数量多,分布广泛;在单个基因和整个基因组中分布不均匀;SNP 等位基因频率容易估计。

KASP是由LGC公司(Laboratory of the Government Chemist) (http://www.lgcgenomics.com)研发的竞争性等位基因特异性PCR技术(Kompetitive AlleleSpecific PCR,KASP)具有低成本、高通量特点的新型基因分型技术,通过引物末端碱基的特异匹配来对SNP 以及In Del位点进行精准的双等位基因分型,在水稻、小麦、大豆等作物的分子标记辅助选择中得到广泛应用。

此前有学者对抗条锈病性状进行了QTL定位,发现与之相关的 QTL在小麦中广泛存在,且分布在每一条染色体中,其中1B染色体上定位到的抗条锈病QTL最多。但是由于病原菌小种的高度变异,大量的抗条锈病基因已经或者正在丧失抗性,因此一直以来国内外许多研究都在致力于新的抗性小麦品种的研究,这就需要了解小麦抗源的抗病基因及其遗传特点,从而对小麦抗源进行更加合理有效的应用,培育出更高效的抗性品种。

发明内容

本发明的目的在于提供与小麦抗条锈病QTL QYr.sicau-1B.1紧密连锁的分子标记。

本发明的另一目的在于提供所述分子标记的荧光定量PCR引物。

本发明的第三个目的在于提供上述小麦抗条锈病QTL QYr.sicau-1B.1紧密连锁的分子标记的应用。

本发明的目的是通过以下技术方案实现的:

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